Primaarinen immuunipuutos — yli 450 geneettistä sairautta, joissa toistuvat infektiot ovat oire, eivät diagnoosi, ja joissa tietyn geenin molekyylitason tunnistaminen mahdollistaa kohdennetun hoidon, parantavan elinsiirron ja geeniterapian.
Koko genomin sekvensointi mahdollistaa yli 450 primaarisen immuunipuutoksen aiheuttavan geenin samanaikaisen analysoinnin – SCID:stä (vastasyntyneiden hätätilanne) CVID:hen (aikuisilla yleisin oireileva primaarinen immuunipuutos) – ja tarjoaa molekyylitason diagnoosin, jonka perusteella päätetään, tarvitaanko potilaalle parantavaa vai oireenmukaista hoitoa.
Ensisijaiset immuunipuutossairaudet
Primaariset immuunipuutossairaudet (PID, joita kutsutaan myös synnynnäisiksi immuunijärjestelmän toimintahäiriöiksi) käsittävät yli 450 geneettisesti määriteltyä sairautta, jotka vaikuttavat immuunijärjestelmän kehitykseen ja/tai toimintaan. Kansainvälinen immunologisten seurojen liitto (IUIS) luokittelee PID-sairaudet 10 luokkaan, joihin kuuluvat yhdistelmäimmuunipuutokset (SCID), pääasiassa vasta-ainepuutokset (CVID, XLA), fagosyyttien toimintahäiriöt (CGD), komplementtipuutokset ja autoinflammatoriset sairaudet. PID-sairauksien esiintyvyyden arvioidaan olevan 1/1 200 – mikä on huomattavasti aiemmin arvioitua suurempi luku, ja suurin osa tapauksista on diagnosoimatta.
Vaikea yhdistelmäimmuunipuutos (SCID) – jonka aiheuttavat mutaatiot IL2RG-geenissä (X-kromosomiin sidottu, yleisin), ADA-, JAK3-, RAG1/RAG2- ja IL7R-geeneissä sekä muissa geeneissä – on vastasyntyneiden hätätilanne: sairastuneilla vauvoilla ei ole käytännössä lainkaan toimivia T-soluja, ja ilman lopullista hoitoa he kuolevat opportunistiseen infektioon ensimmäisen elinvuoden aikana. Vastasyntyneiden SCID-seulonta (TREC-määrityksellä) suoritetaan nykyään kaikissa Yhdysvaltain osavaltioissa, jolloin sairastuneet vauvat tunnistetaan ennen ensimmäistä infektiota. Hematopoieettisten kantasolujen siirto (HSCT) ennen 3,5 kuukauden ikää ilman aiempaa infektiota tuottaa yli 95 %:n eloonjäämisasteen — mikä tekee SCID:stä oireettoman hoidon onnistumisen malliesimerkin.
SCID:n lisäksi PID-kirjoon kuuluvat yleinen vaihteleva immuunipuutos (CVID – aikuisten yleisin oireinen PID, jota esiintyy noin yhdellä 25 000:sta), X-kromosomiin liittyvä agammaglobulinemia (XLA, BTK), krooninen granulomatoottinen sairaus (CGD, CYBB) sekä satoja harvinaisempia sairauksia. Kohdennettuja hoitoja on tulossa: leniolisibi (FDA 2023) aktivoituneen PI3Kδ-oireyhtymän (APDS) hoitoon, geeniterapia ADA-SCID:n ja X-kromosomiin liittyvän SCID:n hoitoon sekä JAK-estäjät tiettyjen PID-alatyyppien hoitoon. Molekyylidiagnoosi vaaditaan kaikissa kohdennetuissa hoidoissa, ja se on välttämätöntä HSCT-luovuttajan valinnassa ja hoito-ohjelman suunnittelussa.
Leniolisibi (Joenja, FDA 2023) on ensimmäinen kohdennettu hoito aktivoituneen PI3Kδ-oireyhtymän (APDS) hoitoon – jonka aiheuttavat PIK3CD- tai PIK3R1-geenin toiminnallisuutta lisäävät variantit. Lääkkeen määräämiseen vaaditaan molekyylitason vahvistus. Koko genomin sekvensointi (WGS) tunnistaa kaikki APDS-variantit.
Yli 450 PID-geeniä ei voida tunnistaa millään yksittäisellä immunologisella määrityksellä. Immunoglobuliinipitoisuudet ja lymfosyyttiryhmät paljastavat immuunipuutoksen, mutta eivät sen geneettistä syytä – lopullisen hoidon suunnittelu edellyttää molekyylidiagnostiikkaa.
SCID on parannettavissa, jos se diagnosoidaan ennen ensimmäistä infektiota – luuydinsiirto ennen 3,5 kuukauden ikää takaa yli 95 prosentin eloonjäämisasteen
Kyseinen SCID-geeni määrää optimaalisen HSCT-esikäsittelyohjelman, luovuttajan valinnan sekä geeniterapian toteutettavuuden vaihtoehtona. IL2RG-SCID:lle (X-kromosomiin sidottu) on käynnissä aktiivinen geeniterapiaohjelma. ADA-SCID:lle on hyväksytty geeniterapia (Strimvelis). RAG1/RAG2-SCID vaatii myeloablaatiivisen esikäsittelyn elinsiirron onnistumiseksi. Nämä geenikohtaiset elinsiirtopäätökset edellyttävät nopeaa molekyylidiagnoosia vastasyntyneisyyskaudella – mieluiten ensimmäisten elinviikkojen aikana. WGS tarjoaa kattavan SCID-geeniarvion nopeammin kuin peräkkäiset yksittäisten geenien testit.
CVID:tä esiintyy yhdellä aikuisella 25 000:sta – monilla on monogeenisiä muunnoksia, joihin on olemassa kohdennettuja hoitoja
CVID:tä pidettiin aiemmin poissulkevana diagnoosina, jonka geneettistä perustaa ei tunnettu. Genomitutkimuksissa on tunnistettu monogeenisiä syitä 25–30 prosentilla CVID-potilaista – mukaan lukien TNFRSF13B (TACI), NFKB1, CTLA4, PIK3CD, PIK3R1, LRBA ja muut. Useille näistä on olemassa erityisiä kohdennettuja hoitoja: abatasepti CTLA4/LRBA-puutokselle ja leniolisibi PIK3CD-geenin toiminnan vahvistumiselle. Potilaat, jotka saavat pelkästään tavanomaista immunoglobuliinikorvaushoitoa, voivat hyötyä lisähoidosta, kun heidän erityinen geneettinen syynsä on tunnistettu koko genomin sekvensointitutkimuksella (WGS).
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – ensisijaisten immuunipuutostilojen sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
