Polykystinen munuaistauti – yleisin hengenvaarallinen geneettinen sairaus, jota esiintyy yhdellä 400–1 000 ihmisestä. Tällöin tietty PKD1- tai PKD2-genotyyppi ennustaa munuaisten vajaatoiminnan puhkeamisen ajankohtaa vuosikymmenien tarkkuudella ja määrittää potilaan kelpoisuuden tolvaptan-hoitoon.
Koko genomin sekvensointi selvittää PKD1-geenin kokonaisuudessaan – mukaan lukien tarkan kartoituksen sen kuuden pseudogeenin osalta, jotka vaikeuttavat tavanomaista sekvensointia – sekä PKD2-geenin, jolloin saadaan genotyyppi, jonka avulla voidaan ennustaa loppuvaiheen munuaistautia (ESRD) koskeva aikataulu ja hoitovaste.
Munasarjojen monirakkulatauti
Autosomaalinen dominantti polykystinen munuaistauti (ADPKD) on yleisin perinnöllinen munuaissairaus ja yksi yleisimmistä hengenvaarallisista geneettisistä sairauksista. Se vaikuttaa noin 1:400–1 000 ihmiseen – arviolta 12,5 miljoonaan ihmiseen maailmanlaajuisesti. ADPKD:n aiheuttavat patogeeniset variantit PKD1-geenissä (~78 % tapauksista, kromosomi 16p13.3) tai PKD2-geenissä (~15 %, kromosomi 4q22.1), jotka koodaavat vastaavasti polykystiini-1:tä ja polykystiini-2:ta. Nämä proteiinit muodostavat kalsiumia läpäisevän kanavakompleksin, joka aistii nesteen virtauksen munuaisepiteelisolujen primaarisissa silissä. Progressiivinen kahdenpuoleinen munuaiskystien kehittyminen johtaa munuaisiin massiiviseen suurentumiseen ja lopulta loppuvaiheen munuaissairauteen.
ADPKD aiheuttaa vuosikymmenien kuluessa etenevää kahdenpuoleista munuaiskystien kasvua, mikä aiheuttaa kylkikipua, verivirtsaisuutta, verenpainetautia, virtsateiden tulehduksia ja munuaiskivitautia. Noin 80 prosentilla potilaista kehittyy maksakystia, jotka ovat yleensä oireettomia, mutta voivat joillakin naisilla aiheuttaa voimakasta maksan suurentumista. Kallonsisäisiä aneurysmia esiintyy noin 8 %:lla ADPKD-potilaista (verrattuna 2–3 %:iin väestössä yleensä) — repeämä aiheuttaa subaraknoidaalivuodon, johon liittyy korkea kuolleisuus. Mitraaliläpän prolapsi, paksusuolen divertikulat ja nivusherniat ovat tyypillisiä oireita. ESRD:n keskimääräinen puhkeamisikä on noin 54 vuotta PKD1:n ja 74 vuotta PKD2:n kohdalla — 20 vuoden ero, joka määräytyy kokonaan genotyypin perusteella.
Vasopressiinin V2-reseptorin antagonisti tolvaptan (Jynarque) sai FDA:n hyväksynnän vuonna 2018 aikuisten nopeasti etenevän ADPKD:n hoitoon. Tolvaptan hidastaa munuaisten kokonaistilavuuden kasvua ja eGFR:n laskua, mikä viivästyttää loppuvaiheen munuaisten vajaatoimintaa (ESRD). FDA:n käyttöohjeessa kohderyhmänä on nimenomaan nopeasti etenevä ADPKD – tyypillisesti PKD1-geenin katkaisevat variantit, jotka aiheuttavat nopeimman etenemisen. Mayon kuvantamisluokitus (htTKV) yhdistettynä molekyyligenotyyppiin tarjoaa tarkimman riskiluokituksen tolvaptan-hoidon päätöksentekoa varten. Lisäksi kallonsisäisten aneurysmien seulonta (aivojen MRA) suositellaan ADPKD-potilaille, joilla on suvussa aneurysmia tai subaraknoidaalivuotoa.
PKD1-geenin katkaisevat variantit (kehyssiirtymä-, nonsense- ja splice-häiritsevät variantit) aiheuttavat loppuvaiheen munuaistautia (ESRD) noin 12 vuotta aikaisemmin kuin PKD1-geenin katkaisemattomat (missense-) variantit. Tietyn varianttityypin tunnistaminen tarkentaa ennustetta pelkän PKD1- ja PKD2-geenien vertailun lisäksi.
PKD1-geenillä on samalla kromosomilla kuusi hyvin homologista pseudogeeniä, jotka vaikeuttavat tavanomaista sekvensointia. Pitkien lukujen avulla toteutettu koko genomin sekvensointi kartoittaa pseudogeenialueen, jotta todelliset PKD1-geenin patogeeniset variantit voidaan tunnistaa.
PKD1- ja PKD2-geenien ero aiheuttaa 20 vuoden eron loppuvaiheen munuaistautiin (ESRD) sairastumisessa — genotyyppi on munuaisten ennusteen vahvin ennustaja
ESRD:n keskimääräinen puhkeamisikä on noin 54 vuotta PKD1-geenin patogeenisten varianttien kohdalla ja noin 74 vuotta PKD2-geenin patogeenisten varianttien kohdalla – mikä tekee molekyyligenotyypistä ADPKD:n munuaisten ennusteen yksittäisen vahvimman ennustajan, joka on merkittävämpi kuin pelkkä lähtötilanteen munuaisvolyymi, ikä tai eGFR-muutosnopeus. Lisäksi PKD1-trunkaatiovariantit aiheuttavat ESRD:n noin 12 vuotta aikaisemmin kuin PKD1-ei-trunkaatiovariantit, mikä tarkentaa ennustetta entisestään. Tämä tieto vaikuttaa suoraan kliiniseen päätöksentekoon: tolvaptanin aloittamisen ajankohta, verenpaineen tavoitearvot, perhesuunnittelukeskustelut ja elävän luovuttajan munuaisensiirron ajankohta riippuvat kaikki ennustetusta ESRD-aikataulusta.
Tolvaptanin käyttökelpoisuuden arviointi edellyttää taudin etenemisen nopeaa arviointia — genotyyppi on riskimallin keskeinen osa
Tolvaptanin (Jynarque) FDA-hyväksyntä koskee ADPKD-potilaita, joilla on riski taudin nopeaan etenemiseen. PROPKD-pisteytys, joka yhdistää molekyyligenotyypin (PKD1-geenin katkaistu variantti = korkein pisteet) ja kliiniset muuttujat (sukupuoli, verenpaineen nousun alkamisajankohta, urologiset oireet), ennustaa taudin nopeaa etenemistä todennetulla tarkkuudella. Potilaat, joilla on alhainen PROPKD-pisteet (tyypillisesti PKD2- tai PKD1-muunnokset, jotka eivät aiheuta proteiinin katkeamista), eivät välttämättä ole tolvaptanin käyttöaiheisia – näin vältetään lääkkeen merkittävät sivuvaikutukset (polyuria, polydipsia, maksatoksisuuden seuranta) potilailla, jotka eivät todennäköisesti hyödy siitä. Koko genomin sekvensointi tarjoaa molekyylitason tiedot tätä riskiluokittelumallia varten.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – polykystisen munuaistautia ja muita sairauksia, niin harvinaisia kuin yleisiäkin, edustavien järjestöjen kanssa. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
