Polykystinen munuaissairaus — ADPKD, jota esiintyy yhdellä tuhannesta, on yleisin hengenvaarallinen geneettinen munuaissairaus, ja PKD1- ja PKD2-genotyyppien ero vaikuttaa sairauden etenemisnopeuteen ja siihen, milloin munuaisten vajaatoiminta puhkeaa.
Koko genomin sekvensointi kartoittaa PKD1-, PKD2- ja muita kystistä munuaissairautta aiheuttavia geenejä – ja tarjoaa molekyylidiagnoosin, jonka avulla voidaan ennustaa taudin etenemistä, arvioida tolvaptanin käyttökelpoisuutta ja toteuttaa perheen seulonta.
Polykystinen munuaissairaus — geenitestaus
Autosomaalinen dominantti polykystinen munuaistauti (ADPKD) vaikuttaa noin yhteen ihmiseen tuhannesta, mikä tekee siitä yleisimmän hengenvaarallisen monogeenisen munuaissairauden. PKD1-geeni (kromosomi 16p13.3) aiheuttaa noin 85 % tapauksista, joissa tauti on vakavampi (loppuvaiheen munuaisten vajaatoiminnan mediaani-ikä 54 vuotta). PKD2 (kromosomi 4q22.1) aiheuttaa noin 15 % lievemmistä tapauksista (ESRD-median 74-vuotiaana). Tämä 20 vuoden ero munuaisten vajaatoiminnan puhkeamisajankohdassa tekee genotyypin määrittämisestä kriittisen tekijän ennusteen ja hoidon suunnittelun kannalta.
Tolvaptani (Jynarque, V2-reseptorin antagonisti) on FDA:n hyväksymä lääke, jolla hidastetaan munuaisten kasvua ja eGFR-arvon laskua ADPKD-potilailla. Tolvaptanin käyttö edellyttää todisteita taudin nopeasta etenemisestä – PKD1-genotyypissä esiintyvät katkaisevat mutaatiot ennustavat nopeaa etenemistä ja puoltavat tolvaptanin käytön aloittamista. Hitaasti etenevää PKD2-tautia sairastavat potilaat eivät välttämättä hyödy tolvaptanista sen sivuvaikutusten vuoksi (voimakas nesteen kertyminen, maksatoksisuuden seuranta).
PKD1-geenin sekvensointi on teknisesti haastavaa, koska kuusi PKD1:tä muistuttavaa pseudogeeniä (PKD1P1–P6) jakaa yli 97 %:n homologiaa PKD1-geenin eksonien 1–34 kanssa. Tavallisissa NGS-paneeleissa lukemat saatetaan kohdistaa virheellisesti PKD1-geenin ja pseudogeenien välillä. Pitkän kantaman PCR-pohjainen rikastus tai koko genomin kattavat menetelmät yhdistettynä kehittyneeseen bioinformatiikkaan parantavat PKD1-varianttien havaitsemisen tarkkuutta.
PKD1-geenin katkaisevat mutaatiot = munuaisten vajaatoiminnan mediaani-ikä 54 vuotta. PKD2 = munuaisten vajaatoiminnan mediaani-ikä 74 vuotta. Tämä 20 vuoden ero vaikuttaa hoidon kiireellisyyteen, elinsiirron suunnitteluun ja tolvaptanin käyttökelpoisuuteen. Genotyyppi ennustaa munuaistesi tulevaisuutta.
PKD1-geenissä on pseudogeenejä, jotka vaikeuttavat tavanomaisia testejä. PKD1- ja PKD2-genotyyppien ero ennustaa 20 vuoden eron munuaisten vajaatoiminnan puhkeamisessa. Koko genomin sekvensointi parantaa PKD1-testien tarkkuutta.
PKD1-pseudogeenit vaikeuttavat tavanomaisia testejä — koko genomin sekvensointi (WGS) tarjoaa paremman varianttien havaitsemisen tässä teknisesti haastavassa geenissä
Kuusi PKD1-pseudogeeniä jakaa yli 97 % sekvenssistä PKD1-geenin kanssa, mikä aiheuttaa varianttien virheellistä luokittelua tavanomaisessa NGS-analyysissä. WGS-analyysi ottaa huomioon koko genomin kontekstin, mikä parantaa PKD1-varianttien tunnistustarkkuutta. Tämä on erityisen tärkeää, koska PKD1-geenin proteiinin muodostumisen estävillä ja estämättömillä varianteilla on erilaiset ennusteelliset merkitykset.
Tolvaptanin käyttökelpoisuus riippuu taudin nopean etenemisen ennusteesta — PKD1-geenin katkaisevat mutaatiot ennustavat, ketkä hyötyvät hoidosta eniten
Tolvaptanilla on merkittäviä sivuvaikutuksia (akvaresis, maksan toiminnan seuranta). PKD1-geenin katkaisevat mutaatiot ennustavat taudin nopeaa etenemistä, mikä puhuu tolvaptanin käytön puolesta. Hitaasti etenevää PKD2-tautia sairastavat potilaat voivat tulla toimeen tarkkailevalla odottelulla. Molekyyligenotyyppaus mahdollistaa yksilölliset hoitopäätökset.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – monirakkulataudin – geenitestauksen sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
