Farmakogenomiikka – CYP450-geenin ja muiden lääkeaineenvaihduntaan vaikuttavien geenien variantit määräävät, miten kehosi käsittelee lääkkeitä. Farmakogenomisen profiilisi tunteminen auttaa lääkäriäsi valitsemaan alusta alkaen oikean lääkkeen ja annoksen.
Koko genomin sekvensointi määrittää CYP450-metaboloijatyyppisi, minkä ansiosta lääkärit voivat valita ja annostella lääkkeitä, jotka toimivat turvallisesti ja tehokkaasti juuri sinun geneettisen rakenteesi kannalta.
Farmakogenomiikka — Lääkevaste
Lääkeaineita metaboloivat sytokromi P450 -entsyymit ovat vastuussa yli 75 %:n osuudesta kaikkien hyväksyttyjen lääkkeiden aineenvaihdunnasta. Kolme geeniä – CYP3A4, CYP2D6 ja CYP2C19 – ovat erityisen tärkeitä: CYP3A4 metaboloi noin 50 % kaikista markkinoilla olevista lääkkeistä, kun taas CYP2D6 ja CYP2C19 metaboloivat yhdessä noin 40 %. Nämä entsyymit katalysoivat hapettumisreaktioita, jotka aktivoivat tai inaktivoivat lääkkeitä niiden erittymistä varten. Näiden geenien geneettinen variaatio luo neljä metabolointifenotyyppiä: huonot metaboloijat (PM), joilla on hyvin alhainen entsyymiaktiivisuus, keskitason metaboloijat (IM), joilla on vähentynyt aktiivisuus, normaalit/laajametaboloijat (NM/EM, villityyppi) ja erittäin nopeat metaboloijat (UM), joilla on lisääntynyt entsyymiaktiivisuus geenien duplikaation tai muiden rakenteellisten varianttien vuoksi.
CYP2D6-geenillä on 962 tunnistettua varianttia, jotka on luetteloitu PharmGKB-tietokantaan. Niihin kuuluu monimutkaisia rakenteellisia variaatioita, kuten geenin deleetioita (joista seuraa PM-fenotyyppi), duplikaatioita ja moninkertaisia duplikaatioita (joista seuraa UM-fenotyyppi) sekä hybridigeenejä (joiden toiminta vaihtelee). CYP2C19-geenillä on 753 varianttia, jotka vaikuttavat pääasiassa splaissaukseen, translaatioon ja aminohappojen substituutioihin. CYP3A4:llä on 609 tunnettua varianttia. Toiminnan menetysvariantit tuottavat matalan aktiivisuuden fenotyyppejä; geeniduplikaatiot tuottavat erittäin nopeita metaboloijia. Metaboloijien fenotyypeillä on merkittäviä kliinisiä seurauksia: huonot metaboloijat voivat kertyä myrkyllisiä lääkeainepitoisuuksia tavanomaisilla annoksilla, kun taas erittäin nopeat metaboloijat voivat saavuttaa alle terapeuttiset pitoisuudet.
Metaboliafenotyyppi määrää lääkkeiden turvallisen ja tehokkaan annostelun kymmenissä eri lääkeryhmissä. Kodeiini, CYP2D6:n aktivoima esilääke, ei tuota kipua lievittävää vaikutusta heikosti metaboloivilla potilailla – he eivät pysty muuttamaan kodeiinia sen aktiiviseksi metaboliitiksi morfiiniksi. Trisykliset masennuslääkkeet ja psykoosilääkkeet kertyvät myrkyllisiin pitoisuuksiin CYP2D6:n heikosti metaboloivilla potilailla. CYP2C19-huonometabolisoijat eivät pysty aktivoimaan klopidogreeliä (Plavix) riittävästi, mikä heikentää sen verihiutaleiden toimintaa estävää vaikutusta ja lisää stenttitromboosin riskiä. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC) julkaisee vertaisarvioituja annostussuosituksia yli 300 lääke-geeniparille, jotka ohjaavat terveydenhuollon ammattilaisia lääkkeiden valinnan ja annostuksen optimoinnissa.
Vakiopaneeleilla testataan 10–30 ”tähti-alleelia” geeniä kohden. Niistä jäävät huomaamatta uudet ja harvinaiset variantit, etenkin aliedustetuissa väestöryhmissä.
Vakiopaneelit eivät tunnista harvinaisia variantteja ja rakenteellisia muunnoksia
Tavanomaisissa farmakogenomiikkapaneeleissa testataan vain 10–30 ”tähtialleelia” (haplotyyppiä) geeniä kohden – eli ennalta määriteltyjä yleisten varianttien yhdistelmiä. Tällä menetelmällä havaitaan yleisimmät variantit useimmissa väestöryhmissä, mutta uudet tai harvinaiset variantit jäävät huomaamatta, etenkin aliedustetuissa väestöryhmissä. CYP2D6 aiheuttaa erityisiä haasteita: kopioiden lukumäärän vaihtelua (CNV:t – deleetiot ja duplikaatiot) ei voida havaita luotettavasti pelkästään tavanomaisella sekvensoinnilla; tarvitaan erikoistuneita kopioiden lukumäärän havaitsemismenetelmiä. Potilaalla voi olla harvinaisia uusia variantteja, joita ei ole mukana tavanomaisessa paneelissa, mikä johtaa virheelliseen metabolisaattorifenotyypin ennusteeseen. Koko genomin sekvensointi kopioiden lukumäärän analyysillä tarjoaa kattavan varianttien havaitsemisen, mikä mahdollistaa fenotyypin laskemisen kaikista havaituista varianteista eikä vain ennalta määritellyistä haplotyypeistä.
Lääkeannostesi on sovitettava geneettiseen aineenvaihduntaprofiiliisi
CYP2D6-entsyymin hidas metaboloija: kodeiini ei lievitä kipua; tramadoli on tehoton; jotkut psykoosilääkkeet ja masennuslääkkeet kertyvät elimistöön myrkyllisiin pitoisuuksiin, mikä edellyttää annoksen pienentämistä. CYP2C19-huonometaboloijat: klopidogreelin (Plavix) aktivaatio on heikentynyt, mikä vähentää verihiutaleiden toimintaa estävää vaikutusta ja lisää stenttitromboosin riskiä PCI-toimenpiteen jälkeen; vaihtoehtoisia P2Y12-estäjiä (prasugreeli, tikagrelori) suositellaan. CYP3A4-ultranopeat metaboloijat saattavat tarvita suurempia annoksia monista substraateista. Potilaskertomukseen dokumentoidut ja sähköisiin potilaskertomuksiin integroidut fenotyyppitulokset ohjaavat tulevaa lääkemääräystä ja ehkäisevät annosteluvirheitä, jotka aiheuttavat hoidon epäonnistumisen tai hengenvaarallisen toksisuuden.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – farmakogenomiikan, lääkevasteiden sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
