Peutz-Jeghersin oireyhtymä – perinnöllinen hamartomaoireyhtymä, johon liittyy yli 85 prosentin kumulatiivinen syöpäriski kuudessa elinjärjestelmässä ja jonka seurantaohjelmat on aloitettava jo lapsuudessa.
STK11-geeni on mukana ACMG:n SF v3.2 -luettelossa toissijaisista löydöksistä. Koko genomin sekvensointi mahdollistaa STK11-geenin täydellisen karakterisoinnin, mukaan lukien suuret genomin deleetiot, jotka aiheuttavat noin 30 % PJS-tapauksista ja joita tavanomaisilla sekvensointipaneeleilla ei havaita luotettavasti.
Peutz-Jeghersin oireyhtymä
Peutz-Jeghersin oireyhtymä (PJS) on autosomaalisesti dominantti perinnöllinen ruoansulatuskanavan polypoosi- ja syöpäalttiusoireyhtymä, jonka aiheuttavat STK11-geenin (seriini/treoniinikinaasi 11, tunnetaan myös nimellä LKB1) sukusolujen patogeeniset variantit kromosomissa 19p13.3. STK11-geeni koodaa kasvainten estäjää, joka aktivoi AMPK:ta ja säätelee solujen polariteettia sekä energia-aineenvaihduntaa. PJS:lle on ominaista tyypillisten hamartomaattisten polyyppien kehittyminen koko ruoansulatuskanavassa (erityisesti ohutsuolessa), erottuva limakalvojen ja ihon pigmentaatio (melaniinipisteitä huulilla, suun limakalvolla, sormissa ja peräaukon alueella) sekä dramaattisesti kohonnut syöpäriski useissa elimissä. PJS:n esiintyvyys on noin 1/50 000–200 000.
PJS-potilaiden elinikäinen syöpäriski on poikkeuksellisen korkea – minkä tahansa syövän osalta sen arvioidaan olevan yli 85 % 70 vuoden ikään mennessä. Yksittäisten syöpien elinikäiset riskit ovat seuraavat: ruoansulatuskanavan syövät (ohutsuoli ~13 %, paksusuoli ja peräsuoli ~40 %, mahalaukku ~29 %), haimasyöpä (~36 %), rintasyöpä (~54 % naisilla), gynekologiset syövät (kohdunkaulan adenokarsinooma ~10 %, kohdun ~9 %, munasarjojen sukupuolirauhastuumori, jossa on rengasmainen tubulus ~21 %) ja keuhkosyöpä (~15 %). Seuranta on aloitettava jo lapsuudessa, ja sen on katettava useita elinjärjestelmiä samanaikaisesti. Ohutsuolen polyypit aiheuttavat lapsuudessa toistuvia suolen invaginaatioita, jotka vaativat usein kiireellistä leikkausta — tämä on ehkäistävissä säännöllisellä ohutsuolen seurannalla ja ennaltaehkäisevällä polypektomialla, kun suuria polyyppejä havaitaan.
Noin 94–96 prosentissa PJS-tapauksista, jotka täyttävät oireyhtymän diagnostiset kriteerit, on tunnistettavissa oleva STK11-geenin patogeeninen variantti. MLPA-menetelmällä tai kopioiden lukumäärän vaihteluiden analyysillä havaittavat suuret deleetiot tai duplikaatiot muodostavat noin 30 prosenttia STK11-geenin patogeenisistä varianteista – nämä jäävät havaitsematta tavanomaisissa, pelkästään eksonien sekvensointiin perustuvissa paneeleissa. Loput noin 4–6 % kliinisistä PJS-tapauksista, joissa STK11-variantteja ei havaita, voivat johtua somaattisesta mosaiikkisuudesta, syvistä intronivariantteista tai geneettisestä heterogeenisyydestä. STK11 on sisällytetty ACMG SF v3.2 -luetteloon toissijaisista löydöksistä, mikä heijastaa tehokkaiden seurantatoimenpiteiden saatavuutta, jotka vähentävät merkittävästi syöpäkuolleisuutta vahvistetuilla kantajilla.
30 % STK11-geenin patogeenisistä muunnoksista on laajoja deleetioita, joita tavanomaisissa sekvensointipaneeleissa ei havaita. Oireyhtymässä, jossa syövän seuranta on aloitettava jo lapsuudessa, diagnosoimatta jääminen aiheuttaa elinikäisiä seurauksia.
Joka kolmas PJS-taudin aiheuttava STK11-geenimuunnos on deleetio – ne jäävät huomaamatta tavallisissa sekvensointitesteissä
Noin 30 % vahvistetuista STK11-geenin patogeenisistä muunnoksista on suuria genomin deleetioita, jotka ulottuvat yhden tai useamman eksonin yli. Tavalliset seuraavan sukupolven sekvensointipaneelit, joilla sekvensoidaan STK11-geenin koodaavia eksoneja, eivät tunnista suuria deleetioita luotettavasti ilman erillistä kopioiden lukumäärän vaihteluiden analyysia. Useilla julkaistuilla PJS-suvuilla, joilla oli täydellinen kliininen fenotyyppi – limakalvojen ja ihon pigmentaatio, useita hamartomaattisia polyyppejä ja tyypillinen suvussa esiintyvä historia – havaittiin STK11-deleetioita, jotka edelsivät negatiivisia paneelituloksia kuukausista vuosiin. Oireyhtymässä, jossa lasten ohutsuolen seuranta alkaa 8-vuotiaana (NCCN:n suositus) ja haiman seuranta 35-vuotiaana, tällaisella diagnoosin viivästymisellä on suoria vaikutuksia syövän ehkäisyyn.
PJS-seuranta kattaa samanaikaisesti kuusi eri syöpätyyppiä – mikä edellyttää yhtä lopullista diagnoosia koko hoitokäytännön aloittamiseksi
STK11-molekyylidiagnoosin vahvistaminen käynnistää monielinvalvontaprotokollan, joka poikkeaa huomattavasti tavanomaisista syöpäseulontasuosituksista. NCCN PJS -ohjeissa suositellaan: yläruoansulatuskanavan tähystystä ja kolonoskopiaa 8–10-vuotiaana; ohutsuolen tähystystä tai kapselitähystystä 8–10-vuotiaana; vuosittainen rintojen magneettikuvaus 25-vuotiaasta alkaen ja mammografia 30-vuotiaasta alkaen; vuosittainen lantion ultraäänitutkimus tai kohdun limakalvon arviointi 18-vuotiaasta alkaen; haiman seuranta 35-vuotiaasta alkaen (endoskooppinen ultraäänitutkimus/magneettikuvaus); ja kivesten tutkimus miehillä syntymästä alkaen (SCTAT-riski). Mikään tavanomainen syövän seulontaohjelma ei kata kaikkia näitä – vahvistettu PJS-molekyylidiagnoosi on edellytys sille, että voidaan käynnistää kattava protokolla, joka tekee seurannasta merkityksellistä.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – Peutz-Jeghersin oireyhtymän sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
