Osteogenesis imperfecta – ”luunmurtumatauti”, jonka vakavuusaste vaihtelee satunnaisista murtumista perinataaliseen kuolemaan, ja jossa nimenomaan tyypin I kollageenin mutaatio määrää ennusteen, hoitomenetelmän ja tulevien raskauksien uusiutumisriskin.
Koko genomin sekvensointi kattaa COL1A1-, COL1A2-geenit sekä kaikki yli 20 muuta osteogeneettiseen hypoplasiaan (OI) liittyvää geeniä – ja tarjoaa molekyylidiagnoosin, jonka perusteella määritetään OI-tyyppi, taudin vakavuuden ennuste sekä periytyvyysmalli geneettistä neuvontaa varten.
Osteogenesis imperfecta
Osteogenesis imperfecta (OI) on ryhmä periytyviä sidekudossairauksia, joiden pääasiallisena syynä ovat patogeeniset variantit COL1A1-geenissä (kromosomi 17q21.33) tai COL1A2-geenissä (kromosomi 7q21.3), jotka koodaavat vastaavasti tyypin I kollageenin α1- ja α2-ketjuja. Tyypin I kollageeni on luun, ihon, jänteiden ja kovakalvon runsaslukuisin rakenneproteiini. OI luokitellaan tyyppeihin I–V (Sillence-luokitus) kliinisen vakavuuden perusteella, ja lisäksi on määritelty molekyylialatyyppejä (tyypit VI–XX), jotka perustuvat kollageenin prosessointiin, luun mineralisaatioon ja osteoblastien toimintaan osallistuvien ei-kollageenigeenien muunnoksiin. Yleinen esiintyvyys on noin 1/10 000–20 000.
OI-tyyppi I (lievä, kvantitatiivinen kollageenipuutos, joka johtuu COL1A1-geenin nolla-alleeleista) aiheuttaa luiden haurautta, sinisiä silmänvalkuaisia, lähes normaalin pituuden sekä murtumia, joiden määrä vähenee murrosiän jälkeen. Tyyppi II (perinataalisesti kuolemaan johtava) aiheuttaa useita kohdunsisäisiä murtumia, vakavia luuston epämuodostumia ja kuoleman perinataalikaudella. Tyyppi III (progressiivinen epämuodostuma) aiheuttaa vakavaa luiden haurautta, progressiivista luuston epämuodostumaa, hyvin lyhyttä pituutta ja pyörätuoliriippuvuutta. Tyyppi IV (kohtalainen) sijoittuu tyyppien I ja III välille. Tietty COL1A1/COL1A2-variantti – erityisesti se, aiheuttaako se kvantitatiivisen puutoksen (haploinsuffisienssi, tyypillisesti lievempi) vai rakenteellisen vian (glysiinin substituutio kollageenin kolmoiskierteessä, tyypillisesti vakavampi) – on taudin vakavuuden ensisijainen määräävä tekijä.
Hoitoon kuuluvat syklisesti annettavat laskimonsisäiset bisfosfonaatit (pamidronaatti, zoledronaatti – keskivaikean ja vaikean OI:n vakihoito, joka lisää luun tiheyttä ja vähentää murtumien määrää), ortopedinen hoito, mukaan lukien pitkien luiden luuydinsisäinen kiinnitys, fysioterapia sekä kuulon arviointi (noin 50 prosentilla OI-aikuisista esiintyy etenevää kuulon heikkenemistä). Kehitteillä olevia uudempia hoitoja ovat sklerostiini-vasta-aineet (romosozumabi), RANKL-vasta-ainehoito (denosumabi, joka on osoittanut hyötyä lasten OI-tutkimuksissa) sekä geeniterapia, joka kohdistuu dominanttisesti negatiivisiin COL1A1/COL1A2-alleeleihin.
Resessiivinen osteogenesis imperfecta (tyypit VI–XX) johtuu muista kuin kollageenigeeneistä, kuten SERPINF1-, CRTAP-, P3H1-, PPIB-, BMP1- ja IFITM5-geeneistä, löytyvistä mutaatioista – nämä jäävät huomaamatta, jos testataan ainoastaan COL1A1- ja COL1A2-geenejä.
COL1A1- ja COL1A2-geenit aiheuttavat noin 85–90 % osteogenesis imperfectus -tapauksista, mutta yli 20 muuta geeniä aiheuttaa resessiivisiä ja epätyypillisiä muotoja. Yhden geenin testaus ei tunnista resessiivistä osteogenesis imperfectusta. Koko genomin sekvensointi kartoittaa molekyylitason kokonaiskuvan.
Kollageenin tarkka muunnoksen tyyppi – haploinsuffisienssi vai glysiinin substituutio – määrää sairauden vakavuuden ennusteen
COL1A1-geenin nolla-alleelit (kehyssiirtymä-, nonsense- ja splays-kohtavariantit, jotka tuottavat ennenaikaisia lopetuskodoneja) aiheuttavat määrällistä kollageenipuutosta – tyypillisesti lievää tyypin I osteogeneettistä hypoplasiaa, johon liittyy siniset silmänvalkuaiset ja murtumariskin väheneminen murrosiän jälkeen. Sitä vastoin glysiinin substituutiot kollageenin kolmoiskierteen Gly-X-Y-toistossa (erityisesti α1-ketjun C-terminaalisella alueella) aiheuttavat rakenteellisia kollageenivikoja, jotka tuottavat kohtalaista tai vakavaa OI:ta (tyypit II–IV). Tämä genotyypin ja vakavuuden välinen korrelaatio mahdollistaa ennusteen antamisen molekyylidiagnoosin yhteydessä — tietoa, jota ei saada pelkästään kliinisestä arvioinnista vastasyntyneellä tai sikiöllä, jolla on synnytystä edeltävä murtuma.
Ultraäänitutkimuksessa havaitut sikiöaikaiset murtumat voivat olla OI-tyypin II (kuolemaan johtavia) tai tyypin III (selviytymismahdollisuuksia tarjoavia) murtumia – molekyylidiagnostiikka erottaa ne toisistaan
Sikiöultraäänitutkimuksessa voidaan toisella raskauskolmanneksella havaita useita murtumia, raajojen lyhentyneisyyttä tai rintakehän hypoplasiaa. Keskeinen kliininen kysymys on, onko kyseessä OI-tyyppi II (perinataalisesti kuolemaan johtava, tyypillisesti de novo -tyyppisten dominanttien COL1A1/COL1A2-glysiinikorvauksien aiheuttama) vai OI-tyyppi III (vakava mutta selviytymismahdollisuuksia tarjoava, myös kollageenin rakenteellisten vikojen aiheuttama). Tällä erottelulla on merkittäviä vaikutuksia hoidon neuvontaan. Amniokenteesistä tai CVS:stä saatava molekyylidiagnoosi voi tunnistaa spesifisen variantin ja — julkaistujen genotyyppi-fenotyyppitietojen perusteella — tarjota näyttöön perustuvan vakavuusennusteen, jota ultraäänitutkimus yksinään ei voi antaa.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – niiden, jotka keskittyvät osteogenesis imperfectaan ja muihin sairauksiin, olivatpa ne sitten harvinaisia tai yleisiä. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
