Neurofibromatoosi tyyppi 1 — café-au-lait-läiskät, neurofibroomit ja joukko komplikaatioita, joiden syynä ovat NF1-geenin variantit. Geneettinen vahvistus ohjaa seurantasuunnitelmaa koko elämän ajan.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa NF1-muunnoksia, joiden avulla voidaan selvittää genotyypin ja fenotyypin välinen yhteys, arvioida hoidon soveltuvuutta sekä kartoittaa sinun ja perheesi elinikäistä terveyskehitystä.
Neurofibromatoosi tyyppi 1
Neurofibromatoosi tyyppi 1 johtuu periytyvistä patogeenisistä muunnoksista NF1-geenissä, joka on suuri geeni (350 kb, 60 eksonia) ja koodaa neurofibromiinia – RAS-signalointireitin säätelijää. RAS ohjaa solujen kasvua, lisääntymistä ja erilaistumista. Neurofibromiini toimii normaalisti RAS-signaloinnin jarruna; patogeeniset NF1-muunnokset poistavat tämän jarrun, mikä mahdollistaa RAS-signaloinnin jatkuvan aktivoitumisen. Tämän seurauksena muodostuu laajoja kasvaimia, kuten café-au-lait-makuloita, ihon ja ihonalaisia neurofibromoita, näköhermon glioomia, plexiformisia neurofibromoita ja pahanlaatuisia ääreishermoston tuumoreita (MPNST). Penetranssi on käytännössä täydellinen – 100 %:lla NF1-kantajista esiintyy joitakin kliinisiä oireita – mutta ilmentyvyys vaihtelee suuresti, joskus jopa dramaattisesti jopa saman perheen sisällä.
Neurofibromatoosi tyyppi 1 vaikuttaa maailmanlaajuisesti noin yhteen ihmiseen 3 000:sta, mikä tekee siitä yhden yleisimmistä autosomaalisesti dominanttisista geneettisistä sairauksista. Noin 50 % tapauksista on de novo -muunnoksia, joilla ei ole suvussa esiintyviä tapauksia. NF1-geenistä on luetteloitu yli 3 000 erillistä patogeenistä muunnosta, eikä siinä esiinny mutaatiokeskittymiä – patogeeniset mutaatiot jakautuvat koko koodaavan alueen yli. NF1-variantit kattavat useita mutaatiotyyppejä: pistemutaatiot, pienet insertiot/deleetiot, splice-site-variantit, suuret deleetiot (mukaan lukien koko geenin mikrodeleetiot, jotka tuottavat vakavamman fenotyypin) ja monimutkaiset uudelleenjärjestelyt. Tämä äärimmäinen heterogeenisyys tekee tulkinnasta haastavaa ilman huolellista geneettistä arviointia.
Tietyn NF1-muunnoksen tunnistamisella on välittömiä lääketieteellisiä vaikutuksia. Koko geenin deleetiot ennustavat vakavampaa tautia, mukaan lukien suuremman riskin sairastua MPNST:hen ja kehitysvammaisuuteen – mikä mahdollistaa näiden korkeamman riskin kantajien tiiviimmän seurannan. Vahvistettu NF1-diagnoosi oikeuttaa MEK-estäjähoitoon (selumetinibi) – FDA on hyväksynyt tämän lääkkeen erityisesti leikkaamattomille plexiformisille neurofibromoille, ja se kohdistuu suoraan NF1-menetyksen aiheuttamaan RAS-reitin säätelyhäiriöön. Geneettinen vahvistus mahdollistaa riskiryhmään kuuluvien sukulaisten kaskaditestauksen sekä sikiö- ja alkionvaiheen geneettisen diagnoosin perhesuunnittelua varten.
NF1-geenin genotyypin ja fenotyypin välinen korrelaatio on vahva: koko geenin deleetiot ennustavat vakavampaa tautia ja suurempaa MPNST-riskiä, mikä edellyttää tiiviimpää seurantaa verrattuna pistemutaation kantajiin.
NF1-geenin sekvensointi on tunnetusti vaikeaa. Tavallisissa testipaneeleissa jäävät huomaamatta koko geenin deleetiot, monimutkaiset uudelleenjärjestymät ja mosaiikkimuunnokset – jotka muodostavat noin 5 % NF1-tapauksista.
NF1-sekvensointia vaikeuttavat pseudogeenit ja rakenteelliset variaatiot
NF1-geeni on poikkeuksellisen suuri ja vaikea sekvensoida tarkasti. Se sisältää lukuisia pseudogeenisegmenttejä muilla kromosomeilla, mikä vaikeuttaa tavanomaista lyhyiden sekvenssien sekvensointia. Noin 5 prosentilla NF1-kantajista on koko geenin deleetioita – eli koko NF1-lokuksen täydellinen puuttuminen –, jotka edellyttävät erityistä kopioiden lukumäärän analysointia, jota tavanomainen kohdennettu sekvensointi ei tarjoa. Mosaikkiset NF1-variantit, joita esiintyy vain murto-osassa verisoluista, jäävät huomaamatta tavanomaisella sekvensointisyvyydellä. Koko genomin sekvensointi tarjoaa täydellisen kattavuuden, mukaan lukien pseudogeenialttiit alueet, ja havaitsee rakenteelliset variantit ja mosaiikkivariantit, jotka kohdennetut paneelit jättävät huomiotta.
NF1-tyyppi määrää taudin vakavuuden ja hoidon soveltuvuuden
NF1-diagnoosin geneettinen vahvistaminen mahdollistaa genotyyppi-fenotyyppi-neuvonnan: potilailla, joilla on koko geenin deleetio, on odotettavissa vakavampi sairaus, suurempi MPNST-riski ja mahdollinen kehitysvamma – mikä edellyttää tiiviimpää kasvaimen seurantaa. Kaikki NF1-kantajat, joilla on leikkaamaton plexiforminen neurofibroma, ovat nyt oikeutettuja selumetinibiin (Koselugo), FDA:n hyväksymään MEK-estäjään, joka kohdistuu suoraan NF1-menetyksen patologisesti aktivoimaan RAS-reittiin. Geneettinen löydös mahdollistaa perheen kaskaditestauksen, synnytystä edeltävän neuvonnan ja tietoon perustuvan siirtymävaiheen suunnittelun aikuisuuteen.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – tyypin 1 neurofibromatoosin sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
