MUTYH-geeniin liittyvä polypoosi — autosomaalinen resessiivinen perinnöllinen paksusuolen syöpäoireyhtymä, joka muistuttaa lievää FAP-oireyhtymää, mutta jonka ilmeneminen edellyttää, että molemmat vanhemmat ovat geenin kantajia. Tämä tarkoittaa, että myös perheissä, joissa ei ole aiempaa syöpätapausta, voi syntyä sairastuneita lapsia.
Koko genomin sekvensointi kartoittaa MUTYH-geenin kokonaisuudessaan ja tunnistaa molemmat alleelit samanaikaisesti – tämä on ainoa tapa määrittää biallelinen genotyyppi, joka määrittelee MAP:n ja erottaa sen APC-negatiivisesta lieventyneestä FAP:sta.
MUTYH-geeniin liittyvä polypoosi
MUTYH-geeniin liittyvä polypoosi (MAP) on autosomaalisesti resessiivinen perinnöllinen paksusuolen syövän alttiusoireyhtymä, jonka aiheuttavat bialleliset patogeeniset variantit kromosomin 1p34.1:llä sijaitsevassa MUTYH-geenissä, joka koodaa MutY-DNA-glykosylaasia – emäksenpoistokorjausentsyymiä, joka korjaa hapettumisesta johtuvia DNA-vaurioita. Toisin kuin FAP ja Lynchin oireyhtymä, MAP periytyy resessiivisesti: molempien MUTYH-geenikopioiden on oltava inaktivoituneet, jotta oireyhtymä ilmenee täysimääräisesti. MAP:lle on ominaista adenomatoottinen polypoosi (tyypillisesti 10–100 polyyppiä, toisinaan enemmän), kolorektaalisyövän riski, joka ilman seurantaa lähestyy 50–80 %:a 70 vuoden iässä, sekä pienempi mutta kohonnut riski pohjukaissuolen adenoomien ja syövän kehittymiselle, samoin kuin lieventyneessä FAP:ssa.
Kaksi yleistä MUTYH-geenin missense-muunnosta – c.536A>G (p.Tyr179Cys, aiemmin Y165C) ja c.1187G>A (p.Gly396Asp, aiemmin G382D) – muodostavat noin 80 % MAP-alleeleista pohjoiseurooppalaista syntyperää olevilla henkilöillä. Nämä kaksi varianttia ovat niin yleisiä eurooppalaisissa populaatioissa, että MUTYH-heterotsygoottisuutta (yhden alleelin kantajuus) esiintyy noin 1–2 %:lla väestöstä — tällä seikalla on käytännön merkitystä syöpäriskin neuvonnassa. Bialleliset kantajat (MAP-potilaat) ovat useimmiten näiden kahden yleisen variantin yhdistelmäheterotsygootteja. Ei-eurooppalaisissa väestöissä MAP:iin vaikuttaa kuitenkin laajempi ja vähemmän karakterisoitu MUTYH-varianttien kirjo, ja kiinteät kahden variantin paneelit ovat huomattavasti heikentäneet herkkyyttä.
MAP-taudin autosomaalinen recessiivinen periytyminen aiheuttaa merkittäviä kliinisiä seurauksia, jotka eroavat dominanttien perinnöllisten syöpäoireyhtymien vaikutuksista. MAP-taudista kärsivä vanhempi on pakollinen MUTYH-heterotsygootti, jolla on 25 %:n todennäköisyys saada tautia sairastava lapsi, jos hän solmii parisuhteen toisen kantajan kanssa (esiintyvyys noin 1–2 %). Monilla MAP-potilailla ei ole suvussa kolorektaalisyöpää, koska vanhemmat ovat oireettomia heterotsygoottisia kantajia. Tämä tarkoittaa, että MAP:ta tulisi harkita kaikilla potilailla, joilla on 10–100 kolorektaalista adenoomaa, vaikka suvussa ei olisi aiempia tapauksia. MAP:n erottaminen APC-negatiivisesta lieventyneestä FAP:sta edellyttää molempien MUTYH-alleelien havaitsemista – tehtävä, joka vaatii MUTYH-geenin täydellisen sekvensoinnin.
Kaksivarianttiset MUTYH-paneelit jättävät tunnistamatta 20 % tautia aiheuttavista alleeleista eurooppalaisilla, ja niiden kattavuus on heikko muissa kuin eurooppalaisissa väestöryhmissä. Biallelisen tilan tunnistaminen edellyttää geenin täydellistä sekvensointia – yhden alleelin havaitseminen ei riitä koskaan MAP-diagnoosin tekemiseen.
Yksittäinen MUTYH-muunnos paneelituloksessa ei kerro juuri mitään MAP-riskistä
Tavallisissa polypoosipaneeleissa tutkitaan kahta yleistä MUTYH-varianttia: p.Tyr179Cys ja p.Gly396Asp. Raportti, jossa todetaan jokin näistä varianteista, viittaa heterotsygoottiseen kantajaan – henkilöön, jolla ei ole kohonnutta paksusuolisyöpäriskiä pelkästään MAP:n perusteella, ellei hänellä ole myös toista MUTYH-alleelia. Kliininen toiminta riippuu täysin molempien alleelien tuntemisesta. Jos potilas on yhdistelmäheterotsygootti yleisen MUTYH-variantin ja harvinaisen variantin suhteen, jota ei testata rajoitetussa paneelissa, hänellä on MAP ja hän tarvitsee intensiivistä seurantaa tai ennaltaehkäisevää kolektomiaa. Koko genomin sekvensointi tunnistaa kaikki MUTYH-variantit koko geenissä samanaikaisesti, mikä mahdollistaa lopullisen biallelisen genotyyppauksen yhdellä testillä.
Euroopan ulkopuolella asuvilla MAP-potilailla on harvinaisia MUTYH-muunnoksia, jotka jäävät järjestelmällisesti huomaamatta kahden muunnoksen paneeleissa
p.Tyr179Cys- ja p.Gly396Asp-variantit ovat yleisiä pohjoiseurooppalaisilla, mutta niiden esiintyvyys on huomattavasti harvinaisempaa muissa väestöryhmissä. Etelä-Aasian, Itä-Aasian, Lähi-idän ja Afrikan alkuperää olevilla potilailla MAP johtuu monenlaisista harvinaisista MUTYH-variantteista, joista monet ovat väestöryhmäkohtaisia. Etelä-Aasian alkuperää oleva potilas, jolla on lievä polypoosi ja jonka tulos kahden variantin MUTYH-paneelissa on negatiivinen, voi kärsiä MAP:sta, jonka aiheuttaa harvinainen MUTYH-alleeli, jota paneelissa ei ole. Ainoastaan täydellinen MUTYH-geenin sekvensointi – kuten koko genomin sekvensointi tarjoaa – on yhtä herkkä kaikissa alkuperäryhmissä.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – MUTYH-geeniin liittyvän polypoosin sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
