MTHFR-geenin mutaatio — MTHFR-geenin yleiset variantit voivat heikentää foolihapon aineenvaihduntaa ja nostaa homokysteiinipitoisuutta. Kattava genotyyppaus tunnistaa sekä yleiset että harvinaiset variantit, jotka vaikuttavat metylaatioreittiisi.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa sekä yleisiä polymorfismeja että harvinaisia patogeenisiä variantteja MTHFR-geenissä, mikä paljastaa kohonneen homokysteiinipitoisuuden geneettisen taustan ja mahdollistaa kohdennetut ravintolisästrategiat.
MTHFR-geenin mutaatio
MTHFR-geeni koodaa metyleenitetrahydrofolaattireduktaasia, entsyymiä, joka on keskeisessä asemassa folaatin muuntamisessa sen aktiiviseen muotoon sekä yhden hiilen aineenvaihdunnan säätelyssä – eli reaktiojärjestelmässä, jossa aminohappo homokysteiini muuttuu metioniiniksi. On olemassa kaksi yleistä polymorfismia: C677T, joka vähentää entsyymiaktiivisuutta noin 30 %:iin normaalista homotsygooteissa, ja A1298C, joka vähentää aktiivisuutta noin 60 %:iin. Harvinaisessa vakavassa muodossa bialleliset patogeeniset variantit aiheuttavat entsyymitoiminnan lähes täydellisen menetyksen, mikä johtaa vakavaan hyperhomokysteinemiaan ja neurologisiin komplikaatioihin.
Noin 10 % pohjoisamerikkalaisista on homotsygootteja C677T-polymorfismin suhteen. Molemmat polymorfismit ovat yleisiä eri väestöryhmissä, ja niiden esiintyvyydessä on etnogeografisia eroja. Kun foolihappopitoisuus on alhainen, näiden polymorfismien kantajilla voi ilmetä lievästi kohonnut homokysteiinipitoisuus, mikä liittyy lisääntyneeseen sydän- ja verisuonitautien riskiin sekä naisilla lievästi kohonneeseen riskiin sikiön selkärankahalkion syntymiseen. Harvinainen vakava MTHFR-puutoksen muoto vaikuttaa maailmanlaajuisesti noin 1:10 000–50 000 ihmiseen ja periytyy autosomaalisesti recessiivisesti.
MTHFR-varianttien ymmärtämisellä on välittömiä kliinisiä vaikutuksia. Niillä, joilla homokysteiinipitoisuus on kohonnut, patogeenisen MTHFR-variantin tunnistaminen ohjaa yksilöllisten foolihappo- ja B-vitamiinilisästrategioiden suunnittelua. Yleisen C677T-polymorfismin kantajille genotyypin vahvistaminen auttaa perhesuunnittelupäätöksissä ja synnytystä edeltävässä neuvonnassa. Vakavan puutoksen tapauksessa geneettinen löydös mahdollistaa betaiinihoidon aloittamisen, vahvistaa diagnoosin ja ohjaa perheenjäsenten ketjutestausta – jokaisella sairastuneen henkilön sisaruksella on 25 %:n riski sairastua uudelleen.
MTHFR-variantteihin kuuluu sekä yleisiä polymorfismeja (C677T ja A1298C) että harvinaisia patogeenisiä variantteja, jotka aiheuttavat vakavaa entsyymipuutosta – ja joilla jokaisella on erilaiset entsymaattiset vaikutukset ja kliiniset seuraukset.
Tavallisessa MTHFR-testissä tutkitaan vain kahta polymorfismia. Tutkimusten mukaan testissä jää havaitsematta yli 100 harvinaista patogeenistä varianttia, jotka aiheuttavat vakavaa homokystinuriaa.
Harvinaiset variantit piilevät koko geenisekvenssissä
Kliinisissä MTHFR-testeissä seulotaan yleensä vain kaksi yleistä polymorfismia (C677T ja A1298C), jolloin jää huomiotta yli 100 harvinaista patogeenistä MTHFR-varianttia, jotka aiheuttavat vakavaa homokysteinuriaa ja vakavia metylaatiovikoja. Nykyiset kliiniset ohjeet (ACMG, American College of Gastroenterology) eivät suosittele rutiininomaista MTHFR-polymorfismitestausta trombofilian varalta, sillä homokysteiinipitoisuuden mittaaminen yksinään on käytännöllisempää kuin genotyypin määrittäminen. Koko genomin sekvensointi kattaa koko koodaavan ja ei-koodaavan sekvenssin, jolloin sekä yleiset polymorfismit että harvinaiset patogeeniset variantit tunnistetaan samanaikaisesti.
Tutkimustulos ohjaa perheen seulontaa ja yksilöllistä hoitoa
Kun patogeeninen MTHFR-variantti on vahvistettu, se mahdollistaa useita kliinisiä toimenpiteitä: kohdennetun foolihapon ja B-vitamiinien lisäravinteiden käytön kyseisen entsyymivian perusteella, tietoon perustuvan raskaudenaikaisen neuvonnan, jos variantti vaikuttaa foolihapon aineenvaihduntaan (vähentäen sikiön selkärankahalkion riskiä), suvun jatkotestauksen muiden kantajien tunnistamiseksi (harvinaisen variantin kantajan jokaisella sisaruksella on 25 %:n riski saada sama mutaatio) sekä vakavissa puutostiloissa betaiinihoidon aloittamisen. Naisille, jotka suunnittelevat raskautta ja joilla on todettu C677T-homozygoottisuus, foolihapon lisäannostelu raskauden alkuvaiheessa on nykyään vakiintunut hoitokäytäntö.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – MTHFR-geenimutaation sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua