Mitokondriotauti — vaikuttaa yhteen ihmiseen 5 000:sta, ja sen aiheuttajina ovat joko mitokondrio- tai tumagenomin muunnokset; koko genomin sekvensointi on ainoa testi, jolla molempia genomeja voidaan tutkia samanaikaisesti.
Koko genomin sekvensointi kartoittaa mitokondrioiden koko genomin (37 geeniä) sekä kaikki yli 300 mitokondriaalisia proteiineja koodaavaa tumagenomia – ratkaisten näin kahden genomin aiheuttaman diagnostisen haasteen, joka tekee mitokondriotaudista yhden lääketieteen vaikeimmista molekyylidiagnooseista.
Mitokondriaaliset sairaudet
Mitokondriaaliset sairaudet ovat heterogeeninen ryhmä sairauksia, joiden syynä on hapettavan fosforylaation (OXPHOS) häiriö – mitokondrioiden energiantuotantoreitti, joka tuottaa noin 90 % solujen ATP:stä. Nämä sairaudet ovat geneettisesti ainutlaatuisia, koska mitokondrioiden toiminta riippuu kahdesta genomista: mitokondrioiden genomista (mtDNA, 37 geeniä, jotka koodaavat 13 OXPHOS-alayksikköä, 22 tRNA:ta ja 2 rRNA:ta) sekä tumagenomista (joka koodaa noin 1 500 mitokondrioihin kohdistuvaa proteiinia, mukaan lukien OXPHOS-kokoonpanotekijät, mtDNA:n ylläpitoentsyymit ja metaboliset entsyymit). Yhdistetty esiintyvyys on noin 1/5 000, mikä tekee mitokondriaalisista sairauksista yhden yleisimmistä perinnöllisistä aineenvaihduntasairauksista.
Kliininen kuva heijastaa kudosten energiantarvetta: sairaus vaikuttaa ensisijaisesti elimiin, joiden aineenvaihdunta on vilkasta. Yleisiä oireita ovat etenevä ulkoinen silmänlihasten halvaus (CPEO), silmäluomen roikkuminen, lihassairaus, sydänlihassairaus, sensorineuraalinen kuulonalenema, diabetes mellitus, kohtaukset, aivohalvauksen kaltaiset jaksot, ataksia, ääreishermoston neuropatia, verkkokalvon rappeuma ja maitohappoasidoosi. Selkeästi määriteltyjä mitokondrio-oireyhtymiä ovat MELAS (mitokondrio-enkefalopatia, maitohappoasidoosi, aivohalvauksen kaltaiset jaksot — tyypillisesti m.3243A>G MT-TL1-geenissä), MERRF (myokloninen epilepsia ja ragged-red-kuidut — m.8344A>G MT-TK-geenissä), Kearns-Sayre-oireyhtymä (CPEO, pigmentaarinen retinopatia, sydämen johtumishäiriöt – suuret mtDNA-deleetiot) ja Leighin oireyhtymä (progressiivinen aivorungon ja basaaliganglioiden neurodegeneraatio – useita geneettisiä syitä).
Mitokondriaalisten sairauksien geneettinen monimutkaisuus aiheuttaa ainutlaatuisia diagnostisia haasteita. mtDNA-variantit periytyvät äidin puolelta, ja niihin liittyy vaihtelevaa heteroplasmiaa (mutanttisen ja villityyppisen mtDNA:n suhde kussakin kudoksessa, mikä määrää taudin kliinisen vakavuuden). Ydinperimän geenimuunnokset periytyvät tavanomaisen mendeliläisen perimämallin mukaisesti. Sama kliininen oireyhtymä voi johtua joko mtDNA- tai ydinperimän muunnoksista (esim. Leighin oireyhtymällä on yli 90 geneettistä syytä). Pelkän mtDNA:n ja sen jälkeen ydinperimän paneelien peräkkäinen testaaminen viivästyttää diagnoosia kuukausista vuosiin. WGS arvioi molemmat genomit samanaikaisesti – se on ainoa kliinisesti saatavilla oleva testi, joka tekee näin.
mtDNA-heteroplasmia – eli mutanttien ja villityyppisten mitokondriaaligenomien välinen suhde – määrää taudin kliinisen vakavuuden. Koko genomin sekvensointi (WGS) mittaa heteroplasmian tasoa ja tarjoaa ennustetietoja, jotka kohdennetuissa mtDNA-testeissä voivat jäädä huomaamatta, kun heteroplasmian taso on alhainen.
Mitokondriotauti johtuu kahden eri genomin muunnoksista. Yhden genomin kerrallaan testaaminen viivästyttää diagnoosia kuukausilla. WGS-testillä analysoidaan sekä mtDNA:ta että tuman DNA:ta samanaikaisesti – se on ainoa testi, joka tekee näin.
Kahden genomin analysointi yhdellä testillä — WGS lukee samanaikaisesti sekä mtDNA:ta että kaikkia yli 300:aa mitokondriaalista ydingeniä
Perinteinen mitokondriaalisten sairauksien tutkimusprosessi koostuu peräkkäisistä testeistä: ensin mtDNA-sekvensointi, sitten (jos tulos on negatiivinen) ydinperimän geenipaneelit ja lopuksi (jos tulos on edelleen negatiivinen) ydinperimän koko eksomin sekvensointi. Jokainen vaihe kestää viikkoja tai kuukausia, ja monet potilaat joutuvat kestämään vuosia kestävän diagnoosimatkan. WGS-menetelmällä arvioidaan koko mitokondriaalinen genomi (mukaan lukien heteroplasmian kvantifiointi) ja kaikki ydinperimän koodaamat mitokondriaaliset geenit yhdellä testillä yhdestä verinäytteestä. Tämä rinnakkainen arviointi tunnistaa sekä mtDNA- että ydinperimän variantit samanaikaisesti, mikä poistaa peräkkäisten testien viivästykset.
Suuret mtDNA-deleetiot aiheuttavat Kearns-Sayre-oireyhtymän ja CPEO:n – nämä jäävät havaitsematta mtDNA:n pistemutaatiotutkimuksissa
Yksittäiset laajamittaiset mtDNA-deleetiot (tyypillisesti 4 977 bp:n ”yleinen deleetio” tai muut yksilölliset deleetiot, joiden koko vaihtelee välillä 1–10 kb) aiheuttavat Kearns-Sayren oireyhtymän, kroonisen progressiivisen ulkoisen oftalmoplegian ja Pearsonin oireyhtymän. Tavalliset mtDNA-pistemutaatiopaneelit (joilla testataan tiettyjä nukleotidipaikkoja) eivät tunnista näitä deleetioita – niiden havaitseminen edellyttää Southern-blot-menetelmää, pitkän kantaman PCR:ää tai koko mitokondriaalisen genomin sekvensointia. WGS lukee koko mitokondriaalisen genomin ja tunnistaa sekä pistemutaatiot että rakenteelliset uudelleenjärjestelyt, mukaan lukien deleetiot, duplikaatiot ja uudelleenjärjestelyt.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – mitokondriotautien ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
