Metylaatio ja B12-aineenvaihdunta — foolihapon ja B12-vitamiinin aineenvaihduntareittejä säätelevien geenien variantit voivat aiheuttaa väsymystä, kognitiivisia ongelmia ja neurologisia oireita. Koko genomin sekvensointi havaitsee harvinaiset variantit, jotka jäävät tavanomaisissa testeissä huomaamatta.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa foolihapon ja B12-vitamiinin aineenvaihdunnassa esiintyviä harvinaisia patogeenisiä variantteja, jotka aiheuttavat vakavia neurologisia sairauksia, ja erottaa ne yleisistä varianteista, joiden kliininen merkitys on kiistanalainen.
Metylaatio ja B12-vitamiinin aineenvaihdunta
Folaatin, metylaation ja kobalamiinin (B12) aineenvaihduntareitit ovat keskeisiä DNA:n synteesissä, metylaatioreaktioissa ja energia-aineenvaihdunnassa. Näihin reitteihin liittyy useita geenejä, kuten MTHFR, joka koodaa metyleenitetrahydrofolaattireduktaasia; MTR, joka koodaa metioniinisyntaasia; MTRR, joka koodaa metioniinisyntaasireduktaasia; sekä CBS, joka koodaa kystationiini-β-syntaasia. Näiden geenien geneettiset variantit voivat häiritä reittiä, mutta kliininen merkitys riippuu ratkaisevasti variantin tyypistä: harvinaiset bialleliset funktionaalisen menetyksen variantit aiheuttavat vakavia sairauksia, kun taas yleisten polymorfismien kliininen hyöty on osoitettu rajalliseksi huolimatta laajasta testauksesta.
Yleisimmin testattu variantti on MTHFR C677T, polymorfismi, jota esiintyy homotsygoottisena (TT-genotyyppi) noin 10–15 prosentilla valkoihoisista ja noin 25 prosentilla latinalaisamerikkalaisista, ja jonka esiintyvyys vaihtelee muissa väestöryhmissä. Yleisyydestään huolimatta vuonna 2013 julkaistuissa ACMG-ohjeissa suositellaan nimenomaisesti, ettei MTHFR-genotyyppiä tutkita rutiininomaisesti trombofilian tai toistuvien keskenmenojen yhteydessä, sillä homokysteiinipitoisuuden mittaaminen on kliinisesti merkityksellisempää kuin pelkkä genotyypin määrittäminen. Viimeaikaisissa laajoissa meta-analyyseissä on suurelta osin kumottu yleisten MTHFR-, MTR- ja MTRR-polymorfismien kliininen vaikutus tromboosiin, sydän- ja verisuonitauteihin sekä toistuviin keskenmenoihin.
In contrast, rare pathogenic variants in these genes cause distinct clinical entities with profound neurological consequences. Biallelic MTHFR deficiency causes severe homocysteinuria (plasma homocysteine often >100 μmol/L; normal <15 μmol/L), associated with developmental delay, seizures, thrombosis, and vision loss. CBS deficiency similarly produces markedly elevated homocysteine and neurological disease. Identification of rare biallelic variants enables specific treatment: high-dose folate and B12 supplementation, betaine therapy for certain forms, and dietary methionine restriction can prevent or slow neurological deterioration when diagnosed early.
MTHFR-variantit muodostavat laajan kirjon: yleisiä polymorfismeja, joilla on vain vähäinen kliininen vaikutus, sekä harvinaisia biallelisia toimintahäiriöitä aiheuttavia mutaatioita, jotka johtavat vakavaan homokystinuriaan — Genomitesti tunnistaa molemmat, mikä mahdollistaa asianmukaisen kliinisen tulkinnan.
Vakiotesteissä tutkitaan yleisiä polymorfismeja, joiden hyödyllisyydestä on erimielisyyttä. Niissä on vaarana, että jää huomaamatta harvinaisia patogeenisia variantteja, jotka aiheuttavat vakavia neurologisia sairauksia.
Yleiset variantit ovat testien pääkohteena, vaikka kliinistä näyttöä onkin vain vähän
Tavanomaiset yhden hiilen aineenvaihdunnan testipaketit keskittyvät yleisiin polymorfismeihin, kuten MTHFR C677T, MTR 2756A>G ja MTRR 66A>G. Näitä variantteja esiintyy merkittävällä osalla väestöstä, mutta niiden kliiniset seuraukset ovat edelleen kiistanalaisia. Laajoissa meta-analyyseissä ei ole pystytty osoittamaan vahvaa yhteyttä näiden yleisten varianttien ja tromboosin, sydän- ja verisuonitautien tai toistuvien keskenmenojen välillä. ACMG on antanut selkeät ohjeet, joissa vastustetaan rutiininomaista MTHFR-testausta näiden indikaatioiden osalta, mutta testaus on edelleen yleistä. Koko genomin sekvensointi havaitsee paitsi yleiset variantit myös harvinaiset patogeeniset variantit, jotka aiheuttavat taudin varmasti — mikä antaa lääkäreille mahdollisuuden erottaa hyvänlaatuiset polymorfismit ja välitöntä hoitoa vaativat tautia aiheuttavat mutaatiot toisistaan.
Harvinaiset mutaatiot on tunnistettava ennen kuin neurologisia vaurioita ehtii kehittyä
MTHFR-, MTR-, MTRR- tai CBS-geenien bialleliset toimintahäiriömuunnokset aiheuttavat vakavaa homokystinuriaa, jossa plasman homokysteiinipitoisuus ylittää 100 μmol/l. Tähän liittyy tyypillisesti neurologisia oireita, kuten kehityksen viivästymistä, kouristuksia, näön menetystä ja tromboosia. Näiden harvinaisten varianttien varhainen tunnistaminen mahdollistaa elämänlaatua muuttavat toimenpiteet: suuriannoksinen foolihapon ja B12-vitamiinin lisäys, betaiinihoito ja ruokavalion muutos voivat estää tai hidastaa dramaattisesti neurologisen tilan heikkenemistä. Vain yleisiä polymorfismeja testaavat vakiopaneelit jättävät nämä kriittiset harvinaiset variantit kokonaan huomiotta. Genome Test tarjoaa kattavan tunnistuksen kaikista reitin varianteista, mikä mahdollistaa asianmukaisen erottelun hyvänlaatuisten polymorfismien ja kiireellistä hoitoa vaativien sairautta aiheuttavien mutaatioiden välillä.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – metylaatio- ja B12-aineenvaihdunnan sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
