Lupuksen (SLE) geneettinen riski — lupuksen periytyvyysaste on noin 50 %, ja komplementin puutteesta, TREX1- tai DNASE1L3-geenimuunnoksista johtuvat monogeeniset muodot vaativat erilaisia hoitostrategioita kuin tyypillinen autoimmuunisairaus SLE.
Koko genomin sekvensointi mahdollistaa komplementtigeenien (C1Q, C2, C4), interferonopatiageenien (TREX1, DNASE1L3, RNASEH2A/B/C), HLA-haplotyyppien (DRB1) sekä kaikkien muiden lupukseen liittyvien varianttien analysoinnin – mikä auttaa erottamaan monogeenisen lupuksen polygeenisestä lupuksesta.
Lupus (SLE) — Geneettinen riski
Systeeminen lupus erythematosus (SLE) on krooninen autoimmuunisairaus, jota sairastaa Yhdysvalloissa noin 200 000–300 000 ihmistä ja jonka periytyvyysaste on noin 50 %. Geneettinen rakenne sisältää sekä polygeenisen alttiuden (HLA-DR2, HLA-DR3, ITGAM, STAT4, IRF5, BLK, TNFAIP3 ja yli 100 muuta GWAS-lokusta) että harvinaisia monogeenisiä muotoja. Vahvin yleinen geneettinen riskitekijä on HLA-luokan II alue – HLA-DRB1*03:01 ja HLA-DRB1*15:01 lisäävät kumpikin riskiä noin 2–3-kertaisesti. C4:n (komplementtikomponentti 4) kopioiden lukumäärän vaihtelu on merkittävä geneettinen tekijä – alhainen C4-kopioiden lukumäärä lisää huomattavasti lupuksen riskiä.
Monogeeninen lupus edustaa noin 1–3 % kaikista SLE-tapauksista, ja sen tunnistaminen on äärimmäisen tärkeää. Komplementin puutos – erityisesti C1q:n (>90 % sairastuu lupukseen), C1r/C1s:n, C2:n ja C4:n homotsygoottinen puutos – aiheuttaa vakavaa varhain puhkeavaa lupusta, joka johtuu apoptoottisten solujätteiden ja immuunikompleksien puutteellisesta poistumisesta. TREX1-puutos aiheuttaa Aicardi-Goutièresin oireyhtymän/perinnöllisen chilblain-lupuksen tyypin I interferonireitin aktivoivien endogeenisten nukleiinihappojen kertymisen kautta. DNASE1L3-puutos aiheuttaa hypokomplementemisen lupuksen, johon liittyy anti-dsDNA-vasta-aineita. Näillä monogeenisillä muodoilla on erityisiä patogeenisiä mekanismeja, jotka vaikuttavat hoidon valintaan.
Lupuksen geneettisen alatyypityksen merkitys hoidon kannalta on alkanut selvitä. Anifrolumabi (Saphnelo), tyypin I interferonireseptoria estävä vasta-aine, on saanut FDA:n hyväksynnän kohtalaiseen tai vaikeaan SLE:hen, ja sen vaikutusmekanismi on merkityksellisin potilailla, joilla on voimakas interferoniprofiili – mukaan lukien potilaat, joilla on interferonopatiareitin variantteja (TREX1, IFIH1, RNASEH2). Komplementtipuutteinen lupus voi vastata tuorepakastettuun plasmaan (joka korvaa puuttuvan komplementtikomponentin) tai komplementin estäjiin, mutta se EI vastaa autoimmuunireitteihin kohdistuvaan tavanomaiseen immunosuppressioon. Belimumabi (anti-BLyS) kohdistuu B-solujen aktivaatioon ja voi olla erityisen tehokas potilailla, joilla on BLK- tai BANK1-riskimuunnoksia.
C1q-puutos aiheuttaa lupusta yli 90 prosentilla kantajista – tämä on korkein penetraatioaste kaikista lupusgeeneistä. Tällä komplementtipuutokseen perustuvalla lupuksella on erilainen patogeeninen mekanismi kuin autoimmuunisella SLE:llä, eikä se välttämättä reagoi tavanomaiseen immunosuppressiiviseen hoitoon.
Monogeeninen lupus (komplementin puutos, interferonopatia) ei reagoi tavanomaisiin immunosuppressiohoitoihin. Molekyylidiagnostiikan avulla voidaan tunnistaa ne 1–3 % lupuspotilaista, jotka tarvitsevat erilaista hoitoa – sekä uudet geneettiset biomarkkerit kohdennettuja hoitoja, kuten anifrolumabia, varten.
Komplementtipuutteinen lupus vaatii komplementin korvaushoitoa, ei immunosuppressiota – vääränlainen hoito viivästyttää tehokasta hoitoa vuosilla
C1q-puutteisilla potilailla kehittyy lupuksen kaltainen sairaus, joka johtuu apoptoottisten solujen ja immuunikompleksien puutteellisesta poistumisesta – kyseessä on siis aineenvaihdunnan ongelma, ei ensisijainen autoimmuunireaktio. Tavanomainen lupuksen immunosuppressiohoito (mykofenolaatti, syklofosfamidi) kohdistuu väärään mekanismiin. Tuoreen jäädytetyn plasman infuusio (joka tarjoaa toiminnallista C1q:ta) voi tuottaa dramaattisen kliinisen parannuksen. Ilman geneettistä komplementtivajauskokeita nämä potilaat saavat yhä voimakkaampaa immunosuppressiota ”hoidon kestävään lupukseen” – vaikka oikea diagnoosi muuttaisi hoidon suunnan kokonaan.
C4-geenin kopioiden lukumäärän vaihtelu on merkittävin yhteinen geneettinen tekijä lupuksen riskin kannalta — koko genomin sekvensointi (WGS) mittaa C4A- ja C4B-geenien kopioiden lukumäärän
Kromosomissa 6 sijaitseva C4-lokus on yksi ihmisen genomin rakenteellisesti monimutkaisimmista alueista – C4A- ja C4B-geenien kopioiden lukumäärä vaihtelee (kumpikin 0–6 kopiota). Alhainen C4-kopioiden lukumäärä (erityisesti alhainen C4A) lisää huomattavasti lupuksen riskiä, kun taas korkea kopioiden lukumäärä suojaa siltä. Tavallisissa geenitesteissä ei arvioida C4-kopioiden lukumäärää. WGS lukee koko C4-lokuksen, mikä mahdollistaa kopioiden lukumäärän kvantifioinnin, joka tarjoaa tärkeimmän yleisen geneettisen lupuksen riskinarvioinnin.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – esimerkiksi lupuksen (SLE) – geneettisen riskin ja muiden sairauksien, sekä harvinaisten että yleisten, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
