Li-Fraumeni-oireyhtymä – TP53-geenin sukusolumuunnos, joka nostaa merkittävästi elinikäistä syöpäriskiä useissa elinjärjestelmissä. Varhainen tunnistaminen mahdollistaa kattavien seurantamenettelyjen käyttöönoton.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa TP53-geenin muunnokset – mikä mahdollistaa Toronto Protocol -seurantajärjestelmän, jonka avulla syövät havaitaan niiden varhaisimmassa, parhaiten hoidettavissa olevassa vaiheessa.
Li-Fraumeni-oireyhtymä
Li-Fraumeni-oireyhtymä johtuu sukusolujen patogeenisistä muunnoksista TP53-geenissä, joka koodaa p53-proteiinia – ”genomin vartijaa”. TP53 reagoi normaalisti DNA-vaurioihin pysäyttämällä solujen jakautumisen, aktivoimalla korjausmekanismeja tai käynnistämällä apoptoosin, jos vaurio on korjaamaton. Kun mutaatio periytyy patogeenisenä varianttina, yksi kopio menetetään. Tämä noudattaa Knudsonin kahden iskun tuumorisuppressorimallia: yksittäinen somaattinen mutaatio jäljellä olevassa kopiossa poistaa p53:n toiminnan kokonaan, mikä poistaa kriittisen jarrun vaurioituneiden solujen lisääntymiselle. Tuloksena on oireyhtymä, johon liittyy silmiinpistävän varhain alkavia, useita toisistaan riippumattomia primaarisia syöpiä.
Li-Fraumeni-oireyhtymä vaikuttaa noin yhteen 5 000–20 000 henkilöstä, vaikka esiintyvyyttä todennäköisesti aliarvioidaan vaihtelevien sukutapausten ja de novo -mutaatioiden vuoksi (7–20 % tapauksista). Viisi keskeistä syöpää ovat pehmytkudossarkoomat, osteosarkoomat, aivokasvaimet, premenopausaalinen rintasyöpä ja lisämunuaiskuorisyövät – mutta sairauskanta ulottuu käytännössä kaikkiin kudostyyppeihin. Elinaikainen syöpäriski on lähes 100 % naisilla ja noin 75 % miehillä 70 vuoden iässä. Monilla sairastuneilla kehittyy useita toisistaan riippumattomia primaarisia syöpiä elinaikanaan, joskus jo ennen 40 vuoden ikää.
Vahvistettu TP53-muunnoksen diagnoosi mahdollistaa Toronto-protokollan soveltamisen – kattavan seurantaohjelman, johon sisältyy vuosittainen koko kehon magneettikuvaus, aivojen magneettikuvaus sekä rintojen magneettikuvaus 20 vuoden iästä lähtien ja vatsan ultraäänitutkimus. Tämän seurannan avulla havaitaan varhaisvaiheen syövät, jolloin ennuste on paras, mikä parantaa kokonaiseloonjäämistä merkittävästi. On erittäin tärkeää, että säteilyaltistusta minimoidaan: TP53-puutteiset solut ovat yliherkkiä säteilyn aiheuttamille sekundaarisille syöpille, mikä tekee CT-kuvauksista ja sädehoidosta erityisen vaarallisia. Ensisukulaisten, mukaan lukien lasten, kaskaditestaus tunnistaa muut riskiryhmään kuuluvat henkilöt ennen oireiden ilmaantumista.
TP53-geenin patogeeniset variantit ovat pääasiassa missense-mutaatioita DNA:han sitoutuvassa domeenissa, mutta niihin kuuluu myös trunkaatioita, splays-kohtien mutaatioita ja koko geenin deleetioita – joista jokaisella on potentiaalisia genotyyppi-fenotyyppi-eroja, jotka vaikuttavat seurannan intensiteettiin.
Tavallisissa paneeleissa TP53-muunnokset voivat jäädä kokonaan havaitsematta, tai ne voivat tunnistaa somaattisia muunnoksia kloonaalisessa hematopoieesissa, jotka jäljittelevät sukusolujen tuloksia – mikä edellyttää kudosten erottelua, jota tavanomainen sekvensointi ei pysty tarjoamaan.
TP53:lla on korkein VUS-osuus vakiopaneeleissa
Vaikka TP53-geeni sisältyy useimpiin perinnöllisen syövän testipaneeleihin, sillä on yksi korkeimmista epäselmän merkityksen varianttien (VUS) esiintyvyyksistä – mikä jättää potilaat ja hoitohenkilökunnan epäselvien vastausten varaan. Lisäksi potentiaalisesti epäselvä klonaalinen hematopoieesi (CHIP) voi tuottaa veressä somaattisia TP53-variantteja, joiden alleelifraktio on pieni ja jotka jäljittelevät sukusolujen patogeenisiä variantteja. Tavallisella sekvensoinnilla ei voida erottaa toisistaan sukusolujen (kaikissa soluissa esiintyviä) ja mosaiikkimuotoisia (osassa soluista esiintyviä) variantteja. Koko genomin sekvensointi ja solutyyppikohtainen analyysi mahdollistavat näiden erottamisen ja antavat lopullisia vastauksia.
TP53-löydös muuttaa täysin syövän hoitotavan
TP53-geenin patogeenisen variantin vahvistaminen mahdollistaa Toronto-protokollan toteuttamisen – yhden lääketieteen kattavimmista syövän seurantaohjelmista. Vuosittainen koko kehon MRI-seulonta havaitsee lisämunuaiskuorikarsinoomat iässä, jolloin ne ilmenevät vauvoilla ja pikkulapsilla – eli silloin, kun varhainen havaitseminen on elintärkeää. Se tunnistaa varhaisvaiheen rintasyövät, aivokasvaimet ja sarkoomat ennen kuin ne etenevät. Yhtä tärkeää on, että se mahdollistaa säteilyn välttämisen hoitosuunnitelmissa, mikä estää säteilyn aiheuttamia sekundaarisia syöpiä väestössä, joka on erityisen altis niille.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – Li-Fraumeni-oireyhtymän sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
