Krabben tauti – kuolemaan johtava leukodystrofia, jossa syntymän jälkeinen 30 päivän hoitoikkuna ratkaisee, voidaanko oireiden ilmaantumista edeltävällä kantasolusiirrolla säilyttää neurologiset toiminnot vai menetetäänkö tämä mahdollisuus lopullisesti.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa kaikki GALC-geenin variantit – mukaan lukien eurooppalaisissa väestöryhmissä yleisen 30 kb:n deleetion – mikä mahdollistaa kantajaseulonnan, sikiödiagnoosin sekä sen ratkaisevan tärkeän varhaisen tunnistamisen, joka tekee oireettomasta HSCT-hoidosta mahdollisen.
Krabben tauti
Krabben tauti (globoidisoluinen leukodystrofia) on autosomaalinen resessiivinen lysosomaalinen varastointihäiriö, jonka aiheuttavat GALC-geenin (galaktosyyliseramidaasi) patogeeniset variantit kromosomissa 14q31.3. GALC-puutos johtaa psykosiinin (galaktosyylisfingosiniini) kertymiseen, joka on suoraan myrkyllistä oligodendrosyytteille ja Schwannin soluille – keskus- ja ääreishermoston myeliiniä tuottaville soluille. Progressiivinen demyelinaatio aiheuttaa tuhoisan kliinisen fenotyypin. Infantiilinen Krabben tauti vaikuttaa noin 1:100 000 syntymään, ja sen esiintyvyys on suurempi skandinaavisissa väestöissä.
Infantiilinen Krabben tauti puhkeaa 3–6 kuukauden iässä, ja oireina ovat ärtyneisyys, etenevä spastisuus, kehityksen taantuminen, näköhermon surkastuminen ja ääreishermoston vaurio. Hoitamattomana tauti etenee nopeasti ja päättyy aina kuolemaan – suurin osa sairastuneista lapsista kuolee ennen 2 vuoden ikää. Myöhäisvaiheen muodot (nuoruus- ja aikuisiän muodot) ilmenevät etenevänä spastisena parapareesina, ääreishermostosairautena ja kognitiivisen kyvyn heikkenemisenä, ja ne voidaan diagnosoida virheellisesti multippeliskleroosiksi, perinnölliseksi spastiseksi paraplegiaksi tai muiksi demyelinisoiviksi sairauksiksi.
Oireeton hematopoieettisten kantasolujen siirto (HSCT) – joka tehdään alle 30 päivän ikäisille vauvoille, joilla on infantile Krabben tauti – voi muuttaa taudin kulkua merkittävästi, säilyttää kognitiiviset toiminnot ja pidentää elinikää vuosista jopa vuosikymmeniin. Tämä kapea hoitoikkuna edellyttää kuitenkin, että sairastuneet vastasyntyneet tunnistetaan ennen oireiden puhkeamista. New Yorkin osavaltio aloitti Krabben taudin yleisen vastasyntyneiden seulonnan vuonna 2006, ja useat muut osavaltiot ovat sittemmin ottaneet sen käyttöön. Väestöryhmissä, joissa yleistä vastasyntyneiden seulontaa ei ole, kantajaseulonta ja synnytystä edeltävä diagnoosi molekyylisen GALC-genotyyppauksen avulla ovat ainoa keino oireiden ilmaantumista edeltävään tunnistamiseen.
GALC-geenissä esiintyvä 30 kb:n deleetio (c.1161+6532_polyA del) vastaa noin 40–50 %:a sairauden aiheuttavista alleeleista eurooppalaisissa populaatioissa. Tavallisissa eksonien sekvensointipaneeleissa tämä laaja deleetio saattaa jäädä havaitsematta – koko genomin sekvensointi tunnistaa sen suoraan.
Entsyymimäärityksillä havaitaan alhainen GALC-aktiivisuus, mutta niillä ei voida erottaa toisistaan varhais- ja myöhäisvaiheen muotoja. GALC-genotyyppi määrää taudin vakavuuden ja sopivuuden kantasolusiirtoon – tietoja, joita pelkkä entsyymiaktiivisuus ei anna.
30 kb:n GALC-deleetio jää huomaamatta eksonisekvensointipaneeleissa – koko genomin sekvensointi tunnistaa sen suoraan
Eurooppalaisissa väestöryhmissä yleisin GALC-geenin patogeeninen alleeli on noin 30 kb:n pituinen genomin deleetio (c.1161+6532_polyA del), joka poistaa eksonit 11–17 ja ulottuu 3'-reuna-alueelle. Tätä suurta rakenteellista variaatiota ei voida havaita tavallisilla eksonien sekvensointipaneeleilla tai yksittäisten eksonien Sanger-sekvensoinnilla — se vaatii joko deleetio-/duplikaatioanalyysin (MLPA) tai koko genomin sekvensoinnin, joka lukee suoraan deleetion katkaisupisteiden yli. Potilas, jolla on yksi GALC-pistemutaatio ja yksi 30 kb:n deleetio, näyttää heterotsygoottiselta (kantajalta) pelkästään eksonien sekvensoinnin perusteella, mikä voi viivästyttää sairastuneen vauvan diagnoosia kriittisen hoitojakson aikana.
Kantajien tunnistaminen ennen raskautta mahdollistaa synnytyksen suunnittelun HSCT-hoitoja tarjoavissa keskuksissa – 30 päivän aikarajaa ei voida joustattaa
Infantiilisen Krabben taudin oireettomassa vaiheessa tehtävä HSCT-hoito on suoritettava noin 30 päivän ikään mennessä, jotta saavutetaan parhaat mahdolliset tulokset. Tämä tarkoittaa, että riskiraskaukset on tunnistettava jo ennen syntymää, synnytys on suoritettava sellaisessa keskuksessa tai sen läheisyydessä, jossa HSCT-hoidon valmistelut voidaan aloittaa välittömästi, ja luovuttajan etsintä on aloitettava jo ennen syntymää. Mikään tästä ei ole mahdollista, jos ensimmäinen merkki Krabben taudista on vastasyntyneiden seulontatulos – joka monissa osavaltioissa kestää 5–7 päivää ja jota seuraa vahvistava testaus. Kantajaseulonta koko genomin sekvensoinnin avulla tunnistaa riskiryhmään kuuluvat parit ennen raskauden alkamista, jolloin koko raskauden kesto on käytettävissä synnytyksen ja elinsiirron suunnitteluun.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Some people don't wait for a diagnosis or a family history to act. Whole genome sequencing gives you the complete genetic picture now — so you and your doctor can make informed decisions before anything becomes urgent.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – Krabben taudin ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
