Tulehdukselliset suolistosairaudet — Crohnin tauti ja haavainen paksusuolitulehdus liittyvät yli 200 geneettiseen alttiusgeeniin. Geneettisen riskiprofiilin ymmärtäminen auttaa hoidon valinnassa ja taudin kulun ennustamisessa.
Koko genomin sekvensointi paljastaa tulehduksellisten suolistosairauksien geneettisen alttiuden koko kuvan ja tunnistaa NOD2- ja IL23R-variantteja, jotka ennustavat sairauden vakavuutta ja hoitovastetta.
Tulehduksellinen suolistosairaus (Crohnin tauti)
Tulehdukselliset suolistosairaudet (IBD), joihin kuuluvat Crohnin tauti (CD) ja haavainen paksusuolitulehdus, ovat kroonisia suolistotulehduksia, jotka aiheuttavat vatsakipua, ripulia, verta ulosteessa, painonlaskua sekä mahdollisia komplikaatioita, kuten ahtaumia, fisteleitä ja paksusuolen syöpää. Crohnin taudin esiintyvyys on kehittyneissä maissa noin 1/1 000, ja se on yleisempää nuoremmilla potilailla (taudin puhkeaminen huipussaan 15–35-vuotiailla). Geneettinen vaikutus on merkittävä: periytyvyyden arvioidaan olevan 50–80 %, ja alalla on tunnistettu yli 200 IBD:hen liittyvää GWAS-lokusta. Ensimmäinen tunnistettu Crohnin taudin alttiusgeeni oli NOD2/CARD15 vuonna 2001, mikä oli käänteentekevä löytö, joka avasi tien CD:n synnynnäisen immuunijärjestelmän toimintahäiriön ymmärtämiselle. NOD2 koodaa solunsisäistä kuviontunnistusreseptoria, joka tunnistaa bakteerien muramyylidipeptidin (MDP) ja laukaisee NF-κB-signaloinnin ja tulehdusreaktion. Kolme yleistä NOD2-varianttia (R702W, G908R, 1007fs) selittävät noin 15–20 % eurooppalaista syntyperää olevien Crohnin tautia sairastavien potilaiden populaatioon liittyvästä riskistä.
Homozygoottiset tai yhdistelmäheterotsygoottiset NOD2-variantit lisäävät Crohnin taudin riskiä noin 20–40-kertaisesti verrattuna niihin, joilla näitä variantteja ei esiinny. NOD2-geenin toimintahäiriöitä aiheuttavat variantit heikentävät monodispersiivisten partikkelien (MDP) tunnistamista ja vähentävät bakteereihin kohdistuvia tulehdusreaktioita, mikä paradoksaalisesti lisää taudin riskiä, koska bakteereita ei pystytä hillitsemään asianmukaisesti ja patogeenisen bakteeriflooran dysbioottinen leviäminen kiihtyy. Tämä intuitiota vastaava mekanismi – miksi heikentynyt immuunivaste aiheuttaisi tulehdusta? – ymmärretään nyt dysbioosin ja esteen toimintahäiriön kontekstissa. IL23R koodaa interleukiini-23-reseptoria, joka osallistuu Th17-solulinjan erilaistumiseen; suojaava variantti rs11209026 (R381Q) itse asiassa vähentää Th17-polarisaatiota, mikä viittaa siihen, että IL-23/Th17-akselin yliaktivaatio ajaa IBD:tä. Tämä löytö johti suoraan hoidon kehittämiseen: IL-23-reitin estäjät (ustekinumabi, risankizumabi, guselkumabi) on nyt hyväksytty CD:n ja UC:n hoitoon, ja ne tuottavat dramaattisia kliinisiä vasteita potilasryhmissä.
NOD2-geenityypitys tarjoaa ennusteellista tietoa taudin kulusta: homotsygoottisilla NOD2-kantajilla tauti puhkeaa tyypillisesti aikaisemmin, paksusuolen vaurio on laajempi ja komplikaatioiden, kuten ahtaumien ja fistelien, esiintyvyys on suurempi. IL23R-geenin suojaavan variantin kantajilla ennustetaan parempaa vastetta IL-23-estäjiin, mikä viittaa siihen, että tulevaisuudessa farmakogenominen ennustaminen voisi ohjata hoidon valintaa. IBD:n geneettinen ymmärtäminen on pääasiassa edistänyt lääkekehitystä sen sijaan, että se olisi muuttanut yksittäisten potilaiden hoitoa; merkittävänä käännekohtana pidetty havainto, että IL23R-variantit ovat suojaavia, johti suoraan ustekinumabin, risankizumabin ja guselkumabin kehittämiseen – nykyisin hyväksyttyihin hoitoihin, joista on hyötyä laajemmalle IBD-potilasjoukolle. IBD:n geneettisen perustan ymmärtäminen on siirtämässä kliinistä näkökulmaa sen näkemisestä ensisijaisesti ruoansulatuskanavan häiriönä sen syvällisten immunologisten perusteiden tunnistamiseen.
Geenitestaus ei kuulu IBD-diagnoosin vakiomenettelyihin. Genome Test kattaa kaikki yli 200 GWAS-lokusta kattavan geneettisen riskiprofiilin laatimiseksi.
IBD:hen liittyy yli 200 geenipaikkaa, joista jokaisella on pieni yksittäinen vaikutus
IBD:n geneettinen alttius jakautuu yli 200 GWAS-lokukseen, joista jokaisella on yksinään pieni vaikutus. Tavallisissa geenitestipaketeissa ei tutkita tätä polygeenistä rakennetta. NOD2-geenityypitystä tehdään toisinaan ennusteen arvioimiseksi, mutta se ei kuulu IBD:n rutiinidiagnoosiin, joka perustuu endoskopiaan, histologiaan ja radiografiaan. Geneettinen testaus ei korvaa kliinistä diagnoosia. Koko genomin sekvensointi tarjoaa kuitenkin kattavat GWAS-varianttitiedot, joita tarvitaan tulevaisuuden polygeenisen riskipisteytyksen laskemiseen. Tämä mahdollistaa yksilöllisen geneettisen riskinarvioinnin, joka voi lopulta ohjata hoidon intensiteettiä, ennustaa taudin vakavuutta ja ohjata perheen seulontaa.
NOD2-muunnokset ennustavat taudin kulkua ja hoitomahdollisuuksia
NOD2-geenityypitys tunnistaa korkean riskin potilaat, joilla on todennäköisesti varhain puhkeava, laaja-alainen sairaus ja komplikaatioita. Nämä potilaat hyötyvät tehokkaammasta alkuvaiheen hoidosta ja tiiviimmästä seurannasta ahtaumien ja fistelien muodostumisen varalta. IL23R-geenimuunnokset tunnistavat potilaat, jotka todennäköisesti vastaavat IL-23-estäjiin – ustekinumabi, risankizumabi ja guselkumabi on nyt hyväksytty Crohnin taudin hoitoon, ja ne tuottavat dramaattisia hoitovasteita geneettisesti alttiissa potilasryhmissä. Genome Testin avulla tehty kattava geneettinen arviointi luo perustan tulevalle kliiniselle hyödyllisyydelle: kun polygeeniset riskimallit kehittyvät ja ne on kliinisesti validoitu, potilaat, joiden geneettiset tiedot on tallennettu, voivat hyötyä uusista hoitosuosituksista, jotka perustuvat heidän yksilölliseen geneettiseen profiiliinsa.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – tulehduksellisten suolistosairauksien (Crohnin tauti) sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
