Hypertrofinen kardiomyopatia – selittämätön sydämen seinämän paksuuntuminen, joka johtuu usein sarkomeerigeenien muunnoksista. Sen selvittäminen, mikä geeni on kyseessä, vaikuttaa laitevalintoihin ja suvun laajamittaiseen seulontaan.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa hypertrofista kardiomyopatiaa aiheuttavat sarkomeerimutaatiot – paljastaen riskin perheenjäsenillä ja ohjaamalla seulonta- ja hoitopäätöksiä.
Hypertrofinen kardiomyopatia
Hypertrofinen kardiomyopatia (HCM) on yleisin perinnöllinen kardiomyopatia ja nuorten urheilijoiden äkillisen sydänkuoleman pääasiallinen syy. Sitä esiintyy noin yhdellä 500:sta (yhdellä 250:stä, kun käytetään geeniseulontaa), vaikka todellinen esiintyvyys voi olla suurempi epätäydellisen penetraation vuoksi. HCM:lle on ominaista selittämätön vasemman kammion hypertrofia, johon liittyy tyypillisesti epäsymmetrinen väliseinän paksuuntuminen, ilman että potilaalla olisi epänormaaleja kuormitusolosuhteita. Sairaus periytyy autosomaalisesti dominantisti, ja sen ilmentyvyys vaihtelee ja on ikään sidonnaista – joillakin variantteilla penetraatio on yli 90 % aikuisiässä, kun taas toiset pysyvät kliinisesti oireettomina joillakin kantajilla.
Kaksi geeniä, MYH7 ja MYBPC3, selittävät yhdessä 70–80 % geneettisesti tunnistetuista HCM-tapauksista. MYH7-geenin variantit (jotka koodaavat beeta-myosiinin raskasta ketjua) ovat pääasiassa missense-mutaatioita, ja niihin liittyy suurempi penetraatio, aikaisempi taudin puhkeaminen ja vakavampi hypertrofia. MYBPC3-geenin variantit (jotka koodaavat sydämen myosiiniin sitoutuvaa proteiinia C) ovat pääasiassa trunkaatioita, ja niihin liittyy myöhempi taudin puhkeaminen, mutta silti merkittävä sairaus. Ainakin kahdeksan sarkomeerigeeniä tunnustetaan nykyään HCM:n aiheuttajiksi, ja jokaisella on erilainen penetraatio ja fenotyyppiset vaikutukset. Noin 60 % HCM-tapauksista on perinnöllisiä; loput tapaukset johtuvat de novo -muunnoksista.
Sarkomeerimutaation tunnistamisella on merkittäviä vaikutuksia potilaan hoitoon ja perheneuvontaan. Geneettisten testien avulla voidaan suorittaa perheenjäsenten ketjuseulonta – oireettomilla sukulaisilla voi olla patogeenisiä muunnoksia, minkä vuoksi on syytä aloittaa säännöllinen sydämen seuranta sydämen ultraäänitutkimuksilla ja EKG:llä. Kun kantajat on tunnistettu, heille suositellaan liikunnan rajoittamista (voimakkaiden kilpaurheilulajien välttämistä), lääkehoitoa beetasalpaajilla tai kalsiumkanavan salpaajilla sekä säännöllistä seurantaa. Geneettinen tieto ohjaa myös perhesuunnittelua, sikiötutkimuksia ja alkionsiirtoa edeltävää geneettistä diagnoosia perheissä, joissa tiedetään olevan mutaatioita, ja tarjoaa vaihtoehtoja lisääntymiseen.
MYH7- ja MYBPC3-muunnoksilla on huomattavia eroja periytyvyydessä ja oireiden vakavuudessa – MYH7-muunnoksilla oireet alkavat tyypillisesti aikaisemmin ja ovat vakavampia, kun taas MYBPC3-muunnoksilla oireet alkavat myöhemmin, mutta niihin liittyy merkittävä etenemisriski.
Tavanomaisissa HCM-seulontatesteissä tutkitaan 8–15 sarkomeerigeeniä, mutta mutaatioita löydetään vain 30–60 prosentilla potilaista. Jopa 70 prosentilla potilaista syy jää geneettisesti selvittämättä.
Vastuussa oleva mutaatio saattaa sijaita geenissä, jota testipaketti ei kata
Tavalliset HCM-seulontapaneelit sisältävät yleensä 8–15 sarkomeerigeeniä, kuten MYH7, MYBPC3, ACTC1, TNNT2, TPM1 ja muita. Lopullinen geneettinen diagnoosi löytyy kuitenkin vain 30–60 prosentilla kliinisesti diagnosoiduista HCM-potilaista, jolloin 40–70 prosentilla geneettistä syytä ei saada selville. Tämä alhainen tuotto johtuu kattavuuden puutteesta (jotkut uudemmat sairausgeenit), vaikeudesta havaita syviä intronivariaatioita ja säätelymuutoksia sekä siitä, että joissakin HCM-tapauksissa esiintyy kopioiden lukumäärän variaatioita, joita tavanomaisella sekvensoinnilla ei havaita. Lisäksi variaatioiden tulkinta on edelleen haastavaa – aliedustetuissa populaatioissa esiintyvät patogeeniset variaatiot saatetaan luokitella virheellisesti merkitykseltään epäselviksi variaatioiksi.
Tämän havainnon ansiosta perheen seulonta ja sairauden hoito voidaan aloittaa jo ennen oireiden ilmaantumista
Kun patogeeninen sarkomeerimutaatio tunnistetaan, se käynnistää ensimmäisen asteen sukulaisten laajamittaisen seulonnan, jonka avulla tunnistetaan oireettomat kantajat, joilla saattaa olla sama mutaatio. Geneettinen tieto ohjaa hoidon suunnittelua: kantajille tehdään säännöllisiä sydämen ultraäänitutkimuksia, heitä kehotetaan välttämään rasittavaa kilpaurheilua lapsuuden ja nuoruuden aikana, ja heille tarjotaan lääkehoitoa, jos sydämen liikakasvu kehittyy. Geneettisessä neuvonnassa käsitellään perhesuunnittelua, sikiödiagnostiikan vaihtoehtoja ja alkionsiirtoa edeltävää geneettistä diagnoosia (PGD) pariskunnille, jotka haluavat välttää mutaation siirtymisen. Perheissä, joissa on aiemmin tapahtunut äkillinen kuolema, mutaation tunnistaminen sukulaisista mahdollistaa ennaltaehkäisevän hoidon ennen mahdollisesti kuolemaan johtavaa rytmihäiriötä.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – hypertrofisen kardiomyopatian sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
