Homokystinuria – jossa CBS-genotyyppi määrää, reagoiko potilas B6-vitamiinihoitoon lähes normaalin tuloksen saavuttaen vai tarvitaanko hänelle elinikäistä metioniinipitoisuutta rajoittavaa ruokavaliota ja betaiinilisää.
Koko genomin sekvensointi mahdollistaa tietyn CBS-geenimuunnoksen tunnistamisen – mikä erottaa pyridoksiinille (B6) reagoivan homokystinurian siitä, joka ei reagoi – ja tämä on tämän sairauden tärkein yksittäinen ennuste- ja hoitokriteeri.
Homokystinuria
Klassinen homokystinuria on metioniinimetabolian autosomaalinen resessiivinen häiriö, jonka aiheuttaa kystationiini-β-syntaasin (CBS, kromosomi 21q22.3) puutos. CBS katalysoi homokysteiinin ja seriinin kondensaatiota kystationiinin muodostamiseksi – tämä on transsulfuraatioreitin ensimmäinen vaihe. CBS-puutos aiheuttaa homokysteiinin ja metioniinin kertymistä vereen ja kudoksiin. Homokystinuriaa esiintyy maailmanlaajuisesti noin 1:200 000–300 000 syntymää kohden, ja sen esiintyvyys on suurempi Irlannissa (~1:65 000) ja Qatarissa (~1:1 800). Pyridoksiini (B6-vitamiini) on CBS:n kofaktori, ja noin 50 %:lla potilaista on B6-vitamiiniin reagoivia muotoja, joissa CBS-aktiivisuus on osittain säilynyt.
Hoitamattomana homokystinuria aiheuttaa tunnistettavan kliinisen oireyhtymän: linssin sijoiltaanmenon (ectopia lentis – tyypillisesti alaspäin, mikä erottaa sen Marfanin oireyhtymästä, jossa linssi siirtyy ylöspäin), marfanoidiset luuston piirteet (pitkäkasvuisuus, pitkät raajat, rintakehän epämuodostuma, skolioosi), tromboembolia (tärkein kuolinsyy — kohonnut homokysteiinipitoisuus edistää endoteelivaurioita ja hyytymisreaktion aktivoitumista) sekä kehitysvammaisuus (vaihteleva, normaalista älykkyydestä vakavaan vammaisuuteen). Tromboembolinen riski on elinikäinen: aivohalvaus, keuhkoembolia ja syvä laskimotromboosi aiheuttavat merkittävää sairastuvuutta ja kuolleisuutta, erityisesti leikkauksen, raskauden tai liikkumattomuuden aikana.
Hoito riippuu olennaisesti B6-vitamiiniin reagoimisesta. B6-vitamiiniin reagoivat potilaat (noin 50 %) hoidetaan suurilla pyridoksiiniannoksilla (100–500 mg/vrk), mikä tehostaa jäljellä olevaa CBS-entsyymiaktiivisuutta ja normalisoi tai lähes normalisoi plasman homokysteiinipitoisuudet – näiden potilaiden ennuste on huomattavasti parempi, mukaan lukien säilynyt älykkyys, pienentynyt tromboembolian riski ja usein se, ettei ruokavaliossa tarvitse rajoittaa metioniinin saantia. B6-vitamiinille reagoimattomat potilaat tarvitsevat elinikäistä metioniinirajoitusta ruokavaliossa, betaiinilisää (joka tarjoaa vaihtoehtoisen reitin homokysteiinin remetylaatiolle), foolihappoa ja B12-vitamiinia. Ero reagoivien ja reagoimattomien muotojen välillä on kriittinen hoitopäätös, ja se määräytyy potilaan CBS-geenityypin perusteella.
Homokystinuriassa mykiön siirtyminen tapahtuu tyypillisesti alaspäin (inferonasalisesti), kun taas Marfanin oireyhtymässä se tapahtuu ylöspäin (superotemporaalisesti). Kaikilta potilailta, joilla on mykiön siirtyminen, tulisi mitata plasman homokysteiinipitoisuus – tämä yksi laboratoriokoe riittää erottamaan nämä kaksi sairautta toisistaan.
B6-vitamiinin vaste määrittää koko hoitomenetelmän ja pitkän aikavälin ennusteen. CBS-genotyyppi ennustaa vasteen erittäin tarkasti, mikä mahdollistaa hoidon välittömän optimoinnin kuukausia kestävien kokeilujen sijaan.
B6-herkät CBS-variantit ennustavat lähes normaaleja tuloksia – ei-herkät variantit ennustavat elinikäisen ruokavalion rajoittamisen tarvetta
CBS-muunnokset p.Ile278Thr ja p.Ala114Val liittyvät B6-herkkään homokystinuriaan, ja niissä säilyy merkittävää entsyymiaktiivisuutta. Potilaat, joilla on homotsygoottinen tai yhdistelmäheterotsygoottinen muoto näistä muunnoksista, saavuttavat tyypillisesti biokemiallisen normalisoitumisen pelkästään pyridoksiinihoidolla, ja heidän pitkän aikavälin kognitiiviset ja verisuoniterveydelliset ennusteensa ovat erinomaiset. Sen sijaan p.Gly307Ser (yleisin irlantilainen/eurooppalainen variantti) ei reagoi B6-vitamiiniin ja vaatii elinikäistä metioniinirajoitettua ruokavaliota ja betaiinia. Molekyyligenotyyppaus mahdollistaa välittömän hoidon luokittelun – toisin kuin 6–8 viikon empiirinen B6-kokeilu, joka viivästyttää lopullista hoitoa.
Kirurgiset ja anestesiaan liittyvät riskit ovat huomattavasti suuremmat diagnosoimattomassa homokystinuriassa – molekyylidiagnostiikka ehkäisee leikkaukseen liittyviä vakavia komplikaatioita
Kohonnut homokysteiinipitoisuus lisää merkittävästi leikkaukseen liittyvää tromboembolian riskiä. Diagnoosittomat homokystinuriapotilaat, joille tehdään leikkaus – etenkin ortopediset toimenpiteet, joihin liittyy liikkumattomuus – ovat erittäin suuressa vaarassa saada leikkauksen aikana tai sen jälkeen aivohalvauksen, keuhkoembolian tai syvän laskimotromboosin. Useat tapausselostukset dokumentoivat leikkaukseen liittyvän kuoleman aiemmin diagnosoimattomilla homokystinuriapotilailla. Molekyylidiagnoosi mahdollistaa asianmukaisen preoperatiivisen homokysteiinipitoisuutta alentavan hoidon, leikkaukseen liittyvän antikoagulaation sekä typpioksidi-anestesian välttämisen (joka estää metioniinisyntaasia ja pahentaa akuutisti homokysteiinipitoisuuksia).
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – homokystinurian ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
