Perinnöllinen diffuusi mahasyöpä — CDH1-geenin toimintahäiriö, johon liittyy jopa 70 prosentin elinikäinen mahasyöpäriski; syöpä kehittyy mahalaukun limakalvon alla ja on endoskopiassa näkymätön, kunnes se on kirurgisesti leikkaamaton.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa kaikki CDH1-geenin variantit – mukaan lukien suuret deleetiot ja mosaiikkimutaatiot – diagnoosin vahvistamiseksi, jonka perusteella suositellaan ennaltaehkäisevää täydellistä mahalaukun poistoa ennen kuin endoskooppisesti näkymätön syöpä ehtii edetä.
Perinnöllinen diffuusi mahasyöpä
Perinnöllinen diffuusi mahasyöpä (HDGC) on autosomaalinen dominantti syöpäalttiusoireyhtymä, jonka aiheuttavat kromosomissa 16q22.1 sijaitsevan CDH1-geenin (E-kadheriini) patogeeniset variantit. CDH1-geeni koodaa solujen välistä adheesiota välittävää proteiinia, joka on elintärkeä epiteelin eheydelle; sen toiminnan menetys johtaa diffuusille mahasyövälle (signet-rengassolukarsinoomalle) tyypilliseen heikosti koossapysyvään, infiltroivaan kasvumalliin. HDGC määriteltiin ensimmäisen kerran vuonna 1998 suuressa maori-suvussa Uudesta-Seelannista, ja se on edelleen yksi tappavimmista perinnöllisistä syöpäoireyhtymistä — CDH1-geenin patogeenisten varianttien kantajien elinikäinen mahasyöpäriski on arvioitu olevan 40–70 % miehillä ja 45–70 % naisilla. Perinnöllisten tapausten puhkeamisen mediaani-ikä on 38 vuotta, mutta tapauksia on dokumentoitu myös 20-vuotiailla potilailla.
HDGC:n kliininen haaste on se, että diffuusi mahasyöpä kasvaa yksittäisinä sinettisormus-soluina, jotka tunkeutuvat limakalvon alle – tämä kasvumalli ei muodosta näkyvää kasvaimetta eikä sitä voida havaita luotettavasti tavanomaisella endoskopialla. Endoskooppisessa seurannassa jää huomaamatta suurin osa varhaisvaiheen HDGC-leesioista, vaikka käytettäisiin järjestelmällisiä biopsiaohjeita. Jokaisessa CDH1-patogeenisen variantin kantajille ennaltaehkäisevästi tehdyssä täydellisessä gastrektomiassa paljastuu patologisessa tutkimuksessa piileviä signet-rengassolufokuksia – mikä tarkoittaa, että jopa ”normaalilta” näyttävissä mahoissa on mikroskooppista syöpää käytännössä kaikilla kantajilla. Tämä yksittäinen biologinen tosiasia on syynä suositukselle, jonka mukaan 18–40-vuotiaille CDH1-kantajille tulisi tehdä ennaltaehkäisevä täydellinen gastrektomia seurannan sijaan.
Myös naispuolisilla CDH1-kantajilla on huomattavasti kohonnut riski sairastua lobulaariseen rintasyöpään – elinikäisen riskin arvioidaan olevan 42–56 %. Lobulaarinen rintasyöpä, kuten diffuusi mahasyöpäkin, kasvaa tunkeutuvana, yksirivisenä kasvaimena, jota tavanomaisella mammografialla ei välttämättä havaita, minkä vuoksi rintojen magneettikuvaus on olennainen osa seurantaa. CDH1 on sisällytetty ACMG SF v3.2 -luetteloon toissijaisista löydöksistä, mikä heijastaa konsensusta siitä, että CDH1-kantajien tunnistaminen ennen syövän kehittymistä on sekä kliinisesti merkityksellistä että hengenpelastavaa. Noin 40 % perheistä, jotka täyttävät kliiniset HDGC-kriteerit, on CDH1-negatiivisia; joillakin näistä perheistä on muunnoksia CTNNA1-geenissä (alfa-E-kateniini) tai muissa geeneissä, ja kattava genomiin perustuva lähestymistapa on aiheellinen.
Tavanomaisissa perinnöllisen syövän geenitesteissä jäävät huomaamatta suuret CDH1-geenin deleetiot ja mosaiikkimuunnokset. Oireyhtymässä, jossa ennaltaehkäisevä leikkaus riippuu molekyylitason vahvistuksesta, puutteellinen geenitulos vaikuttaa suoraan leikkauspäätökseen.
Suuret CDH1-deleetiot muodostavat 10–15 % HDGC-tapauksista, ja ne jäävät havaitsematta eksonisekvensointipaneeleissa
Noin 10–15 % CDH1-geenin patogeenisistä muunnoksista HDGC-suvuissa on suuria genomisekvenssien deleetioita, jotka ulottuvat yhden tai useamman eksonin yli. Eksonisekvensointipaneelit, jotka eivät sisällä MLPA-menetelmällä tehtävää deleetioiden tai duplikaatioiden analyysia tai kopioiden lukumäärän vaihteluiden tunnistusta, eivät havaitse näitä muunnoksia. Lisäksi joissakin perheissä on dokumentoitu somaattista mosaiikkisuutta – jossa CDH1-variantti esiintyy vain osassa potilaan soluista – ja se voi jäädä huomaamatta tavanomaisilla sekvensointisyvyyksillä. Koko genomin sekvensointi tarjoaa samanaikaisen pistemutaatioiden havaitsemisen ja kopioiden lukumäärän vaihteluiden analysoinnin koko CDH1-geenissä, jolloin sekä yleiset geenin sisäiset variantit että rakenteelliset uudelleenjärjestelyt voidaan selvittää yhdellä testillä.
Ennaltaehkäisevä mahalaukun poisto vaatii molekyylitason vahvistuksen – negatiivinen testituloksen ei tarkoita, että tulos olisi todellakin negatiivinen
Mahalaukun täydellinen poisto on laaja kirurginen toimenpide, jolla on merkittäviä pitkäaikaisia vaikutuksia elämänlaatuun. Sitä suositellaan CDH1-geenin kantajille, koska varhaisvaiheen diffuusi mahasyöpä ei näy endoskooppitutkimuksessa ja seuranta ei ole onnistunut ehkäisemään kuolemantapauksia tunnetuissa kantajasuvuissa. Tämä suositus on aiheellinen vain, kun CDH1-geenin patogeenisen variantin molekyylitason vahvistus on saatu. Puutteellinen testipaneeli, jossa ei arvioitu suuria deleetioita tai suoritettu kattavaa CDH1-analyysiä, antaa väärän turvallisuudentunteen perheelle, jossa patogeeninen variantti saattaa edelleen olla olemassa, mutta sitä ei yksinkertaisesti voitu havaita rajoitetuilla testeillä. Koko genomin sekvensointi poistaa tämän epäselvyyden.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – perinnöllisen diffuusi mahasyövän sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
