GERD:n geneettinen riski — gastroesofageaalisen refluksitaudin periytyvyysaste on noin 30–40 %, ja siitä on tunnistettu alttiusgeenipaikkoja; CYP2C19-farmakogenomiikka määrittää protonipumpun estäjien (PPI) tehokkuuden hoidon optimointia varten.
Koko genomin sekvensoinnilla arvioidaan GERD-alttiusmuunnoksia, Barrettin ruokatorven riskilokuksia ja CYP2C19-genotyyppiä PPI-lääkkeiden farmakogenomiikan kannalta – yhdistämällä refluksitaudin genetiikka täsmähoitoon.
GERD — Geneettinen alttius
Gastroesofageaalinen refluksitauti (GERD) koskee noin 20 %:a länsimaiden väestöstä. Kaksostutkimusten mukaan perinnöllisyysaste on 30–40 %. GWAS-tutkimuksissa on tunnistettu alttiuslokuksia lähellä FOXF1- (16q24.1), GDF7- (2p24.1), MHC-alueen (6p21) ja CCND1- (11q13) geenejä, jotka osallistuvat ruokatorven kehitykseen, immuunijärjestelmän säätelyyn ja epiteelin eheyteen.
Barrettin ruokatorvella (GERD:n esisyöpäinen komplikaatio) on selkeitä geneettisiä riskitekijöitä. CRTC1-geenipaikka (19p13.11) ja FOXF1-geenipaikka liittyvät nimenomaan Barrettin ruokatorven ja ruokatorven adenokarsinooman riskiin. Henkilöt, joilla on näitä alttiusmuunnoksia ja krooninen GERD, voivat hyötyä varhaisemmasta endoskooppisesta seurannasta Barrettin ruokatorven havaitsemiseksi.
CYP2C19 on tärkein PPI-lääkkeitä metaboloiva entsyymi. Erittäin nopeilla metaboloijilla (CYP2C19 *17/*17, noin 5–10 % eurooppalaisista) happojen tuotantoa ei välttämättä saada riittävästi hillittyä tavanomaisilla PPI-annoksilla, minkä vuoksi annosta on ehkä nostettava tai siirryttävä vonopratsaaniin (kaliumia kilpaileva happojen tuotantoa estävä lääke, joka ei ole CYP2C19-riippuvainen). Hitailla metaboloijilla (*2/*2, *2/*3) PPI-lääkkeen pitoisuudet ovat korkeammat, ja he saattavat tarvita annoksen pienentämistä. CYP2C19-genotyyppaus optimoi PPI-hoidon.
Jos PPI-lääkkeesi ”ei tehoa”, syynä voivat olla geenisi, ei lääke. CYP2C19-tyypin erittäin nopeat metaboloijat hajottavat omepratsolin liian nopeasti – heille on tarpeen säätää annostusta tai vaihtaa toiseen happoa estävään lääkkeeseen.
GERD:n genetiikka yhdistää alttiuden Barrettin oireyhtymän riskinarviointiin ja PPI-lääkkeiden farmakogenomiikkaan. Koko genomin sekvensointi (WGS) arvioi kaikki nämä kolme ulottuvuutta yhdellä ainoalla testillä.
CYP2C19-genotyyppi selittää, miksi PPI-hoito ei tehoa joihinkin potilaisiin – farmakogenomiikkaan perustuva annostelu parantaa happotasapainoa
CYP2C19-ultranopeat metaboloijat metaboloivat PPI-lääkkeitä liian nopeasti, jotta happotuotanto saataisiin riittävällä tavalla hillittyä. Ilman farmakogenomista testausta nämä potilaat luokitellaan ”PPI-hoidon vastustuskykyisiksi” ja heille tehdään tarpeettomia endoskopia- tai leikkaushoitoja. WGS-menetelmällä suoritettu CYP2C19-genotyyppaus mahdollistaa annoksen optimoinnin tai siirtymisen vonopratsaaniin.
Barrettin ruokatorven riskimuunnokset voivat auttaa tunnistamaan GERD-potilaat, jotka hyötyvät aikaisemmasta endoskooppisesta seurannasta
Barrettin oireyhtymään liittyvät alttiusgeenit (CRTC1, FOXF1) auttavat tunnistamaan GERD-potilaat, joilla on suurempi riski sairastua syövän esiasteeseen, Barrettin oireyhtymään. Seulontaohjeiden kehittyessä geneettisen riskin luokittelu voi auttaa räätälöimään päätöksen siitä, milloin seurantatutkimus tulisi suorittaa.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – GERD:n (gastroesofageaalisen refluksitaudin) sekä geneettisen alttiuden ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
