Geenien metylaatiotestaus — metylaatiosykliin liittyy kymmeniä muita geenejä kuin MTHFR, ja koko genomin sekvensointi kartoittaa ne kaikki — MTRR, MTR, BHMT, CBS, COMT, MAT1A, AHCY — jolloin saadaan kattava metylaatiogeeniprofiili.
Koko genomin sekvensointi analysoi kaikki metylaatiokierron geenit samanaikaisesti – ei pelkästään niitä kahta yleistä MTHFR-varianttia (C677T, A1298C), joita testataan vakiopaneeleilla, vaan kaikki variantit kaikissa folaatti-, metioniini- ja transsulfuraatioreittien geeneissä.
Geenien metylaatiotutkimukset
Metylointikierto (yhden hiilen aineenvaihdunta) on keskeinen aineenvaihduntareitti, joka tuottaa metyyliryhmiä DNA:n metylaatioon, välittäjäaineiden synteesiin, detoksifikaatioon, fosfolipidien tuotantoon ja homokysteiinin aineenvaihduntaan. Reittiin osallistuu useita entsyymejä: MTHFR (metyleenitetrahydrofolaattireduktaasi — muuntaa 5,10-metyleen-THF:n 5-metyyli-THF:ksi, joka on aktiivinen folaattimuoto), MTR (metioniinisyntaasi — muuntaa homokysteiinin metioniiniksi käyttäen B12-vitamiinia), MTRR (metioniinisyntaasireduktaasi – regeneroi aktiivista B12-vitamiinia MTR:ää varten), BHMT (betaiini-homokysteiinimetyylitransferaasi – vaihtoehtoinen homokysteiinin muuntamisreitti), CBS (kystationiini-beetasyntaasi – transsulfuraatioreitti) ja COMT (katekol-O-metyylitransferaasi – välittäjäaineiden metylaatio).
MTHFR C677T (rs1801133) on eniten tutkittu metylaatiovariantti: homotsygoottinen TT-genotyyppi (noin 10–12 % eurooppalaista syntyperää olevista) vähentää MTHFR-entsyymiaktiivisuutta noin 70 %, mikä voi aiheuttaa kohonneita homokysteiinipitoisuuksia (sydän- ja verisuonitautien riskitekijä) sekä metyylifolaatin saatavuuden heikkenemistä. MTHFR A1298C (rs1801131) vähentää aktiivisuutta noin 35 % homotsygooteissa. Metylointisyklin muodostavat kuitenkin verkostot – yksittäiset variantit muissa geeneissä (MTRR A66G, MTR A2756G, CBS C699T, COMT Val158Met) voivat vahvistaa tai kompensoida MTHFR-variantteja. Tavalliset, pelkästään MTHFR:ää mittaavat testit eivät ota huomioon tämän verkoston monimutkaisuutta.
Metylaatiovariaatioiden kliinisiä vaikutuksia ovat muun muassa: kohonnut homokysteiinipitoisuus (sydän- ja verisuonitautien riski – johon voidaan puuttua metyylifolaatin ja aktiivisen B12-vitamiinilisän avulla), sikiön selkärankahalkion riski raskauden aikana (MTHFR TT -tyyppiset naiset hyötyvät metyylifolaatista enemmän kuin foolihaposta), vaihteleva lääkeaineenvaihdunta (COMT Val158Met vaikuttaa katekoliamiinien aineenvaihduntaan, kipuaistimukseen ja vasteeseen tietyille lääkkeille) sekä CBS-variaatiot, jotka voivat vaikuttaa rikin aineenvaihduntaan ja detoksifikaatioreitteihin. Kattava metylaatiotestaus, jossa arvioidaan koko reitti – ei vain yhtä tai kahta MTHFR-varianttia – antaa kattavan kuvan yksilöllisen lisäravinteiden käytön suunnittelua varten.
Tavallisissa MTHFR-testeissä tutkitaan vain kahta varianttia (C677T ja A1298C). Metylointikierrossa on mukana yli 20 geeniä, joissa on satoja toiminnallisia variantteja. Koko genomin sekvensointi (WGS) analysoi ne kaikki – ja tarjoaa kattavan profiilin, jota puutteellisilla testeillä ei voida saada.
Metylaatio on aineenvaihduntareitti, ei yksittäinen geeni. Pelkästään MTHFR-geenin C677T- ja A1298C-muunnoksia testaamalla jää huomiotta suurin osa geneettisestä vaihtelusta, joka vaikuttaa foolihapon, B12-vitamiinin ja homokysteiinin aineenvaihduntaan. Koko genomin sekvensointi (WGS) kartoittaa koko aineenvaihduntareitin.
Pelkästään MTHFR-geenin testaus jättää verkoston huomiotta – MTRR-, MTR-, BHMT- ja CBS-variantit voivat joko vahvistaa tai kompensoida MTHFR-genotyypin vaikutusta
Potilaalla, jolla on MTHFR 677 CT -mutaatio (heterotsygootti, lievä heikkeneminen) ja joka kantaa myös MTRR 66 GG -mutaatiota (B12-vitamiinin kierrätyksen heikkeneminen) sekä MTR 2756 GG -mutaatiota (metioniinisyntaasin aktiivisuuden heikkeneminen), metylaatio voi olla merkittävästi heikentynyt – enemmän kuin pelkästään MTHFR-tuloksen perusteella voitaisiin ennustaa. Toisaalta potilaalla, jolla on MTHFR 677 TT, mutta suotuisat BHMT- ja CBS-genotyypit, metylaatio voi kompensoitua vaihtoehtoisten reittien kautta. Vain koko reitin kattava testaus paljastaa metylaatiokapasiteetin kokonaiskuvan.
COMT-geenin Val158Met-mutaatio vaikuttaa kipuaistimukseen, katekoliamiinien aineenvaihduntaan ja hormonikorvaushoidon vasteeseen – farmakogenominen variantti, jolla on laaja-alaisia kliinisiä vaikutuksia
COMT Val158Met (rs4680) määrää COMT-entsyymin aktiivisuuden: Val/Val (korkea aktiivisuus, nopea katekoliamiinien hajoaminen – ”soturifenotyyppi”), Met/Met (matala aktiivisuus, korkeammat katekoliamiinipitoisuudet – ”huolestujafenotyyppi”) ja Val/Met (keskitaso). Tämä variantti vaikuttaa kipuaistimukseen, stressireaktioon, kognitiiviseen suorituskykyyn paineen alla, estrogeenin aineenvaihduntaan sekä reaktioon tiettyihin lääkkeisiin. COMT on osa metylaatiosykliä — se käyttää SAM:ia (S-adenosyylimetioniinia) metyylidonorina. WGS tarjoaa COMT-genotyyppauksen yhdessä kaikkien muiden metylaatiogeenien kanssa.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – geenien metylaatiotestien sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
