Fanconin anemia – monimutkainen DNA:n korjaushäiriö, jonka aiheuttavat 23 eri geenin muunnokset ja jossa potilaan kuuluva komplementaatioryhmä määrää luuydinsiirron esikäsittelyn intensiteetin sekä elinikäisen syöpäseurannan ohjelman.
Koko genomin sekvensoinnilla tutkitaan samanaikaisesti kaikki 23 Fanconin anemian komplementaatioryhmän geeniä – tämä on ainoa käytännöllinen tapa selvittää, mikä geeni on syyllinen, sillä tämä tieto vaikuttaa suoraan elinsiirron suunnitteluun ja syövän hoitoon.
Fanconin anemia
Fanconin anemia (FA) on autosomaalinen resessiivinen (ja yksi X-kromosomiin liittyvä) DNA:n korjaushäiriö, jonka aiheuttavat patogeeniset variantit geeneissä, jotka koodaavat Fanconin anemia-BRCA-DNA-vaurion vastepolun komponentteja. FA on geneettisesti heterogeeninen – on määritelty 23 komplementaatioryhmää (FANC-A–FANC-V, sekä lisäalaryhmiä), jotka vastaavat 23:a erillistä geeniä. FANCA-geenin patogeeniset variantit aiheuttavat noin 60–70 % FA-tapauksista; FANCC (~10 %) ja FANCG (~10 %) ovat seuraavaksi yleisimpiä. FA vaikuttaa noin 1:130 000 syntymään, ja esiintyvyys on suurempi tietyissä väestöryhmissä: FANCC c.711+4A>T on yleinen aškenasijuutalaisten keskuudessa (kantajataajuus ~1:90), ja FANCA-deleetioita esiintyy runsaasti espanjalaisissa romani-väestöryhmissä.
FA:lle on ominaista vaihteleva yhdistelmä seuraavia oireita: synnynnäiset fyysiset poikkeavuudet (peukalon ja värttinäluun epämuodostumat, lyhytkasvuisuus, café-au-lait-läiskät, munuaisten epämuodostumat, sydänviat – esiintyy noin 60–75 prosentilla potilaista); etenevä luuydinsairaus (aplastinen anemia, joka ilmenee tyypillisesti ensimmäisen elinvuosikymmenen aikana); ja huomattavasti kohonnut syöpäriski – erityisesti akuutti myelooinen leukemia sekä pään ja kaulan alueen okasolusyöpä. Luuydinsairauden puhkeamisen mediaani-ikä on noin 7 vuotta. Hematopoieettisten kantasolujen siirto (HSCT) on ainoa parantava hoito luuydinsairaudelle ja AML-riskille, mutta FA-potilaat sietävät tavanomaista siirtoa edeltävää kemoterapiaa ja sädehoitoa erittäin huonosti DNA:n korjauskyvyn puutteen vuoksi — mikä edellyttää erityisesti suunniteltuja, lievempiä hoitomenetelmiä.
FA:n komplementaatioryhmällä on suora kliininen merkitys. FANCB on X-kromosomiin sidottu (ainoa X-kromosomiin sidottu komplementaatioryhmä) – kantajana olevilla naisilla ei ole kohonnutta syöpäriskiä, mutta hemitsygoottisilla miehillä tauti ilmenee vakavassa muodossa. FANCD1-geenin patogeeniset variantit ovat biallelisia BRCA2-muunnoksia – näillä potilailla on vakavin FA-fenotyyppi, varhaisin luuydinsairaus ja suurin lisäys syöpäriskeissä (medulloblastooma, Wilmsin kasvain). FANCN:n bialleliset patogeeniset variantit ovat biallelisia PALB2-geenejä. FANCJ:n bialleliset variantit ovat biallelisia BRIP1-geenejä. Tämä päällekkäisyys tunnettujen perinnöllisten syöpägeenien kanssa vaikuttaa heterotsygoottisiin perheenjäseniin — FANCD1/BRCA2-, FANCN/PALB2- ja FANCJ/BRIP1-kantajilla on heterotsygoottinen syöpäriski.
FANCD1-geenin patogeeniset variantit ovat biallelisia BRCA2-mutaatioita – ne aiheuttavat vakavimman FA-fenotyypin, johon liittyy varhaisin syövän puhkeaminen, mukaan lukien lasten medulloblastooma ja Wilmsin kasvain. Kantajilla on BRCA2-heterotsygootti, mikä lisää rintasyövän ja munasarjasyövän riskiä.
23 komplementaatioryhmää edellyttävät 23 geenin samanaikaista tutkimista. Peräkkäiset yksittäisten geenien tai rajoitettujen geenipaneelien testit eivät ole käytännöllisiä. Koko genomin sekvensointi tunnistaa kaikki FA-geenit yhdellä testillä, mikä mahdollistaa komplementaatioryhmän nopean määrittämisen.
Kromosomimurtumien tutkimuksella diagnosoidaan FA – mutta ei sitä, mikä geeni on kyseessä, mikä on välttämätöntä elinsiirron suunnittelun kannalta
Fanconin anemian diagnoosin kultainen standardi on kromosomien katkeamiskoe (diepoksibutaani tai mitomysiini C), joka osoittaa FA:lle tyypillisen DNA:n korjaushäiriön, mutta ei paljasta, mikä komplementaatioryhmä tai geeni on syyllinen. Komplementaatioryhmän määrittäminen – joka on aiemmin tehty solufuusiokokeilla – on välttämätöntä HSCT-konditionointiprotokollan suunnittelua (jotkut ryhmät vaativat mukautettuja protokollia), syövän seurannan intensiteetin suunnittelua (FANCD1/FANCD2 vaikuttavat riskiprofiiliin) ja perheen kaskaditestausta (jotta voidaan tunnistaa, mitkä sukulaiset saattavat kantaa heterotsygoottisia syöpäalttiusmuunnoksia) varten. Koko genomin sekvensointi arvioi samanaikaisesti kaikki 23 FA-komplementaatioryhmän geeniä, mikä mahdollistaa komplementaatioryhmän määrittämisen nopeasti yhdestä DNA-näytteestä.
Perheen FA-geenin heterotsygooteilla voi olla perinnöllinen syöpäriski, joka edellyttää erillistä seurantaa
FA-potilaiden perheissä on pakollisia heterotsygoottisia kantajia. Kun FA-komplementaatioryhmään kuuluu BRCA2 (FANCD1), PALB2 (FANCN), BRIP1 (FANCJ) tai BRCA1 (FANCS), heterotsygoottisilla perheenjäsenillä on perinnöllinen rintasyövän ja munasarjasyövän riski, joka edellyttää erityistä seurantaa. FANCD1-taudin saaneen lapsen vanhempi, joka on pakollinen BRCA2-heterotsygootti, tarvitsee välitöntä BRCA2-positiivisen perinnöllisen syövän hoitoa – vuosittainen rintojen magneettikuvaus, NCCN-seurantaprotokollat, riskin vähentävän leikkauksen harkitseminen. FA-komplementaatioryhmän tunnistaminen koko genomin sekvensoinnista johtaa suoraan asianmukaiseen perinnöllisen syövän neuvontaan kaikille pakollisille kantajille, jotka ovat ensimmäisen asteen sukulaisia.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – Fanconin anemian ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, myös virtuaalisia potilasjärjestöjä.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
