Epilepsian geenitestaus – jossa tietty geeni määrittää, mikä epilepsialääke tehoaa, mikä pahentaa kohtauksia ja onko täsmähoitoja, kuten ketogeeninen ruokavalio tai mTOR-estäjät, suositeltavaa käyttää.
Koko genomin sekvensointi kartoittaa samanaikaisesti kaikki yli 100 epilepsiaa aiheuttavaa geeniä – kuten SCN1A, SCN2A, KCNQ2, CDKL5, STXBP1, SLC2A1, TSC1/TSC2 ja muut – ja tarjoaa molekyylitason diagnoosin, jonka perusteella voidaan valita geenikohtainen hoito.
Epilepsia — Geenitestaus
Epilepsiaa sairastaa noin yksi 26:sta (3,4 miljoonaa Yhdysvalloissa), ja jopa 70–80 prosentissa tapauksista syy on geneettinen – yksittäisen geenin (monogeenisen) epilepsioista monimutkaiseen polygeeniseen alttiuteen. On tunnistettu yli 100 monogeenistä epilepsiaa aiheuttavaa geeniä, jotka koodaavat ionikanavia (SCN1A, SCN2A, KCNQ2, KCNQ3, KCNA2), synaptisia proteiineja (STXBP1, SYNGAP1), metabolisia entsyymejä (SLC2A1, ALDH7A1), transkriptiotekijöitä (CDKL5, FOXG1) ja mTOR-reitin komponentteja (TSC1, TSC2, DEPDC5). Geneettinen diagnoosi ohjaa yhä useammin hoidon valintaa.
Geenikohtainen hoito on epilepsian genetiikan tärkein sovellusalue. SCN1A-geenin muunnokset (Dravetin oireyhtymä) – potilaiden tila pahenee natriumkanavan salpaajien (karbamatsepiini, fenytoiini, lamotrigiini) käytön seurauksena; nämä ovat yleisimmin määrättyjä epilepsialääkkeitä. KCNQ2-geenin muunnokset – reagoivat natriumkanavan salpaajiin, erityisesti karbamatsepiiniin. SLC2A1-variantit (GLUT1-puutos) — ketogeeninen ruokavalio on ensisijainen hoitomuoto, ja pelkät epilepsialääkkeet eivät riitä. TSC1/TSC2-variantit — everolimuusi (mTOR-estäjä) on FDA:n hyväksymä TSC:hen liittyvien kohtausten hoitoon. Nämä geenikohtaiset hoitovasteet tarkoittavat, että empiirinen epilepsialääkkeiden valinta ilman geneettistä diagnoosia voi johtaa väärän lääkkeen käyttöön.
Noin 30 % epilepsiapotilaista ei reagoi tavanomaisiin epilepsialääkkeisiin (lääkeresistentti epilepsia). Geneettinen testaus lääkkeille vastustuskykyisessä epilepsian tunnistetaan syy noin 20–40 %:ssa tapauksista — usein paljastaen, että lääkeresistenssi oli itse asiassa lääkkeen sopimaton käyttö (väärä lääke geneettiselle alatyypille). Lisäksi epilepsian geneettinen diagnoosi antaa tietoa leikkauskelpoisuudesta, kehityksen ennusteesta, uusiutumisriskin neuvonnasta ja kelpoisuudesta geenikohtaisiin kliinisiin tutkimuksiin (ASO:t SCN1A:lle, geeniterapia CDKL5:lle ja STXBP1:lle).
Natriumkanavan salpaajat – yleisimmin määrätty kohtausten estolääkeryhmä – pahentavat SCN1A-potilaiden oireita. Tämä on yksi neurologian tärkeimmistä farmakogenomisista yhteisvaikutuksista. Molekyylitason SCN1A-diagnoosi estää lääkehoidon aiheuttaman kohtausten pahenemisen.
Yli 100 epilepsiaa aiheuttavaa geeniä ei voida testata peräkkäin. Kunkin geenin perusteella voidaan määrittää, mikä lääke sopii potilaalle, mikä ei, ja onko täsmähoitoja (ketogeeninen ruokavalio, mTOR-estäjät, ASO:t) syytä käyttää.
30 %:sta ”lääkeresistentistä” epilepsiasta saattaa itse asiassa olla kyse ”väärän lääkkeen” aiheuttamasta epilepsiasta – geneettinen diagnoosi auttaa löytämään oikean hoidon
SCN1A-geeniin liittyvää Dravetin oireyhtymää sairastavalla potilaalla, jolle on määrätty karbamatsepiinia (ensilinjan epilepsialääke), kohtaukset pahenevat – ja hänet saatetaan luokitella ”lääkeresistentiksi” sen sijaan, että tilannetta pidettäisiin ”väärin hoidettuna”. Geneettinen diagnoosi paljastaa, että kohtaukset eivät ole resistenttejä kaikille lääkkeille – vaan ainoastaan natriumkanavan salpaajille. Siirtyminen klobatsamiiniin, stiripentoliin tai fenfluramiiniin (jotka kaikki ovat tehokkaita SCN1A:ssa) voi parantaa kohtausten hallintaa dramaattisesti. WGS tunnistaa spesifisen geenin, mikä mahdollistaa optimaalisen lääkkeen valinnan alusta alkaen.
Kehitteillä olevat geeniterapiakokeet CDKL5-, STXBP1- ja SCN1A-geeneille — molekyylidiagnostiikka ratkaisee potilaan kelpoisuuden
SCN1A-geenin ASO-hoidot (joissa kohdistutaan funktion vahvistaviin muunnoksiin), CDKL5-puutostilan geenikorvaushoito sekä useat muut geenikohtaiset hoitomenetelmät ovat prekliinisessä tai varhaisessa kliinisessä kehitysvaiheessa. Kaikissa tutkimuksissa edellytetään kyseisen syygeenin vahvistettua molekyylidiagnoosia. Varhainen geneettinen diagnoosi varmistaa, että potilaat tunnistetaan ja otetaan mukaan tutkimuksiin heti, kun niitä tulee saataville – ennen kuin vuosia kestävät hallitsemattomat kohtaukset aiheuttavat kumulatiivisia kehityshäiriöitä.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – epilepsian, geenitestauksen sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
