Epidermolysis bullosa – ensimmäinen geneettinen ihosairaus, johon on saatavilla FDA:n hyväksymä geeniterapia (Vyjuvek, 2023) ja jossa kyseisen geenin ja geenimuunnoksen molekyylidiagnoosi määrittää hoidon soveltuvuuden ja haavanhoidon lähestymistavan.
Koko genomin sekvensointi analysoi samanaikaisesti kaikki yli 20 epidermolysis bullosa -geeniä – KRT5, KRT14, COL7A1, COL17A1, LAMB3 ja muut – ja tarjoaa molekyylidiagnoosin, jota tarvitaan geeniterapian soveltuvuuden arvioimiseksi ja tarkan ennusteen laatimiseksi.
Epidermolysis bullosa
Epidermolysis bullosa (EB) on ryhmä perinnöllisiä ihon hauraustiloja, joille on ominaista ihon ja limakalvojen rakkuloituminen ja eroosio jo vähäisenkin mekaanisen ärsytyksen seurauksena. EB-ryhmään kuuluu yli 30 alatyyppiä, jotka johtuvat yli 20:n, dermis-epidermis-liitoskohdan rakenneproteiineja koodaavan geenin muunnoksista. Neljä päätyyppiä – EB simplex (EBS, pääasiassa KRT5/KRT14), junctional EB (JEB, pääasiassa LAMB3/LAMA3/COL17A1), dystrofinen EB (DEB, COL7A1) ja Kindlerin EB (FERMT1) – eroavat toisistaan huomattavasti vakavuuden, vaurioituneen ihokerroksen ja ennusteen suhteen.
Biallelisten COL7A1-geenin toimintahäiriömuunnosten aiheuttama dystrofinen EB (resessiivinen DEB) kuuluu vakavimpiin muotoihin: tyypin VII kollageenin puuttuminen johtaa rakkuloiden muodostumiseen lamina densan alapuolella, mikä aiheuttaa kroonisia haavoja, arpikontraktuureja käsissä (käsineenmuotoinen epämuodostuma), ruokatorven ahtaumia ja dramaattisesti kohonnutta riskiä aggressiiviselle levyepiteelikarsinoomalle — joka on johtava kuolinsyy ja jonka puhkeaminen tapahtuu keskimäärin kolmannella elinvuosikymmenellä. Junctional EB (vakava yleistynyt muoto) voi olla tappava imeväisiässä. EB simplex on yleensä lievin päätyyppi, mutta se voi aiheuttaa merkittävää sairastuvuutta.
Beremagene geperpavec (Vyjuvek), HSV-1-pohjainen paikallisesti annettava geeniterapia, joka tuottaa toiminnallista COL7A1-proteiinia, sai FDA:n hyväksynnän toukokuussa 2023 haavojen hoitoon dystrofista epidermolysisis bullosaa (EB) sairastavilla potilailla, jotka ovat vähintään 6 kuukauden ikäisiä ja joilla on COL7A1-geenin patogeenisiä variantteja. Kyseessä on ensimmäinen FDA:n hyväksymä geeniterapia mihinkään ihosairauteen. Muita geeni- ja soluhoitoja kehitetään parhaillaan kliinisissä tutkimuksissa muille EB-alatyypeille. Vyjuvekin käyttökelpoisuuden ja kaikkiin geeniterapian kliinisiin tutkimuksiin osallistumisen edellytyksenä on molekyylidiagnoosi, joka vahvistaa spesifisen EB-geenin ja -variantin.
Beremagene geperpavec (Vyjuvek) — FDA:n hyväksymä toukokuussa 2023 — on ensimmäinen geeniterapia, joka on tarkoitettu minkä tahansa ihosairauden hoitoon. Se tuottaa toiminnallista COL7A1-proteiinia dystrofisen epidermolysisen bullosan haavoihin. Lääkkeen määräämiseen vaaditaan COL7A1-varianttien molekyylitason vahvistus.
EB-taudin aiheuttaa yli 20 geeniä. Immunofluoresenssilla tehty ihobiopsia auttaa rajaamaan taudin tyypin, mutta se ei anna molekyylidiagnoosia, jota tarvitaan geeniterapian soveltuvuuden arvioimiseksi tai tarkkaa geneettistä neuvontaa varten.
Vyjuvek-geeniterapia edellyttää vahvistettuja COL7A1-muunnoksia – pelkkä kliininen tai biopsiaperusteinen diagnoosi ei riitä
Beremagene geperpavec on tarkoitettu erityisesti COL7A1-geenin patogeenisten varianttien aiheuttamaa dystrofista epidermolysis vulgaris -taudin (EB) sairastavien potilaiden haavojen hoitoon. Ihobiopsia ja immunofluoresenssikartoitus voivat tunnistaa puuttuvan tai vähentyneen tyypin VII kollageenin, mutta ne eivät tarjoa molekyylimuunnoksen tunnistusta, jota tarvitaan Vyjuvekin määräämiseen tai kliinisiin tutkimuksiin osallistumiseen. Lisäksi tietämys spesifisistä COL7A1-muunnoksista määrittää kelpoisuuden muihin kehitteillä oleviin hoitoihin, mukaan lukien eksonien ohittamiseen perustuvat antisense-oligonukleotidit, jotka kohdistuvat tiettyihin eksoneihin. Koko genomin sekvensointi tarjoaa lopullisen molekyylidiagnoosin.
Vaikeaa EB-tautia sairastavien perheiden sikiödiagnostiikka mahdollistaa synnytyksen suunnittelun ja vastasyntyneen ihon välittömän hoidon
Perheille, joissa on jo aiemmin ollut vakavasta liitoskohtaisesta tai resessiivisestä dystrofisesta EB:stä kärsivä lapsi, tarvitaan synnytystä edeltävä molekyylidiagnoosi sen selvittämiseksi, onko seuraavilla raskauksilla sama sairaus. Sairaudesta kärsivät vastasyntyneet tarvitsevat välitöntä erikoistunutta ihonhoitoa heti syntymän jälkeen – irtoavia sidoksia, varovaista käsittelyä lääketieteellisen hoidon aiheuttamien rakkuloiden ehkäisemiseksi sekä joissakin tapauksissa vastasyntyneiden tehohoitoa. Sikiön genotyypin tunteminen ennen synnytystä mahdollistaa suunnitellun keisarileikkauksen (ihon trauman vähentämiseksi) laitoksessa, jossa on EB-kokemusta vastasyntyneiden hoidosta. Tämä edellyttää vanhempien COL7A1-, LAMB3- tai muiden EB-geenimuunnosten vahvistamista koko genomin sekvensoinnilla.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – epidermolysis bullosan sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
