Kystinen fibroosi — CFTR-geenin kantajien osuus on joissakin väestöryhmissä jopa 1/25. CFTR-muunnosten kattava seulonta ennen perheen perustamista paljastaa kantajuuden, joka voi jäädä huomaamatta tavanomaisissa seulonnoissa.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa kaikki tunnetut CFTR-variantit, mikä mahdollistaa kantajaseulonnan, perhesuunnittelun ja pääsyn täsmähoitoihin CFTR-modulaattoreilla.
Kystinen fibroosi
Kystinen fibroosi (CF) on autosomaalinen resessiivinen monisysteeminen sairaus, joka vaikuttaa keuhkoihin, haimaan, maksaan, sukuelimiin ja hikirauhasiin. Esiintyvyys on noin 1/2 500–3 500 valkoihoisessa väestössä; kantajataajuus on noin 1/25 valkoihoisista. Sairauden aiheuttavat bialleliset patogeeniset variantit CFTR-geenissä, joka koodaa kystisen fibroosin transmembraanikonduktanssiregulaattoria, kloridikanavaa, joka on kriittinen neste- ja elektrolyyttitasapainon kannalta epiteelikudoksissa. CFTR-geenissä on tunnistettu yli 2 000 varianttia. F508del (fenyylialaniinin 508:n deleetio) on ylivoimaisesti yleisin, ja se edustaa noin 70 %:a CF-alleeleista maailmanlaajuisesti ja esiintyy noin 90 %:lla CF-potilaista (joko heterotsygoottisena tai homotsygoottisena). Kliinisesti CF ilmenee etenevänä keuhkosairautena (toistuvat infektiot, keuhkoputken laajentuma), haiman vajaatoimintana (imeytymishäiriö, diabetes) ja suolamenetyksenä. Keskimääräinen elinajanodote on pidentynyt 1980-luvun vauvaiästä nykyiseen noin 50 vuoteen, mikä johtuu pääasiassa aggressiivisesta keuhkojen hoidosta ja yhä enemmän CFTR-modulaattorihoidoista, jotka ovat muuttaneet CF:n kuolemaan johtavasta lapsuuden sairaudesta hallittavaksi krooniseksi sairaudeksi.
CFTR-geeni koodaa 1 480 aminohapon pituista, cAMP:n säätelemää kloridikanavaa, joka sijaitsee epiteelisolujen apikaalisissa kalvoissa. Variantit luokitellaan mekanismin perusteella: Luokka I (nonsense-, frameshift- ja kanoniset splays-mutaatiot) eivät tuota proteiinia; Luokka II (prosessointivirheet, mukaan lukien F508del) aiheuttavat virheellisen taitumisen ja hajoamisen endoplasmakalvostossa; Luokka III (kanavan avautumisen häiriöt) heikentävät kanavan avautumista; luokka IV (vähentynyt johtokyky) sallii osittaisen kloridivirtauksen; luokka V (vähentynyt määrä) tuottaa vähäisiä määriä toiminnallista proteiinia. F508del on luokan II variantti, joka aiheuttaa virheellistä taitumista ja ennenaikaista hajoamista. CFTR-proteiini on ehdottoman tärkeä kloridin eritykselle; toiminnan menetys johtaa kuivuneisiin, viskooseihin eritteisiin hengitysteissä ja kanavissa, mikä aiheuttaa tukoksia, infektioita ja tulehdusta. Kolme CFTR-modulaattorilääkettä on nyt hyväksytty, ja ne ovat muuttaneet hoitotuloksia: ivakaftori aktivoi porttimutaatioita; lumakaftori/ivakaftori korjaa F508del-mutaatioiden aiheuttaman virheellisen taitumisen; eleksakaftori/tezakaftori/ivakaftori laajentaa hoidon kattavuuden noin 90 prosenttiin CF-potilaista.
CFTR-geenityypitys on ratkaisevan tärkeää kystisen fibroosin diagnoosissa ja yhä useammin myös hoidon valinnassa. Ivakaftori (Kalydeco) aktivoi tiettyjä gating-mutaatioita (G551D, G1244E ja muut) ja hyödyttää noin 4–6 %:a kystisen fibroosin potilaista. Lumakaftori/ivakaftori (Orkambi) on tarkoitettu F508del-homozygoottisille potilaille – noin 15 %:lle CF-potilaista – ja parantaa FEV1-arvoa noin 6 pistettä. Elexakaftori/tezakaftori/ivakaftori (Trikafta), joka on hyväksytty CF-potilaille, joilla on vähintään yksi F508del-kopio, laajentaa kelpoisuuden noin 90 %:iin CF-potilaista; Trikafta parantaa FEV1-arvoa noin 10 pistettä ja on muuttanut CF-hoidon kenttää dramaattisesti – kuolleisuus näyttää olevan laskussa lääkkeen hyväksymisen jälkeen. CFTR-genotyyppi määrää suoraan, mihin modulaattoreihin potilas voi saada pääsyn, mikä tekee geenitestauksesta välttämättömän hoidon ohjaamiseksi ja mahdollistaa yksilöllisen hoidon valinnan.
Tavallisissa CF-seulontatesteissä tutkitaan 23–32 yleistä muunnosta. Niissä jäävät huomaamatta harvinaiset mutaatiot, ja niiden herkkyys on heikko väestöryhmissä, joiden sukujuuret eivät ole Euroopassa.
Vakiopaneelit eivät tunnista harvinaisia CFTR-muunnoksia, ja niissä on puutteita sukututkimustiedoissa
Tavallisissa CF-kantajaseulontapaneeleissa testataan 23–32 yleistä varianttia (esimerkiksi laajennettu ACMG-23-paneeli). Tällä menetelmällä havaitaan noin 88 % kantajista valkoihoisessa väestössä, mutta vain noin 64 % latinalaisamerikkalaisessa, noin 49 % afroamerikkalaisessa ja noin 30 % aasialaisessa väestössä – mikä on merkittävä terveyserojen aiheuttaja. Laajennetut paneelit, jotka sisältävät yli 100 varianttia, parantavat havaitsemista, mutta harvinaiset variantit jäävät silti huomaamatta. Nykyiset vakiopaneelit eivät arvioi modifioivia geenejä (kuten TGFB1, MBL2), jotka vaikuttavat taudin vakavuuteen. Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki CFTR-variantit, mukaan lukien uudet, ja tarjoaa lopullisen kantajastatuksen arvioinnin kaikille väestöryhmille sekä mahdollistaa kattavan geneettisen riskinarvioinnin.
CFTR-genotyyppi määrää, pääseekö potilas elämänlaatua parantavaan modulaattorihoitoon
Tällä hetkellä on hyväksytty kolme CFTR-modulaattorilääkettä: ivakaftori tiettyihin gating-mutaatioihin (G551D, G1244E jne.), lumakaftori/ivakaftori F508del-homozygooteille sekä eleksakaftori/tezakaftori/ivakaftori potilaille, joilla on vähintään yksi F508del-kopio. Trikafta on hyväksytty noin 90 %:lle CF-potilaista, ja se on vähentänyt kuolleisuutta hyväksymisensä jälkeen ja parantanut FEV1-arvoa noin 10 pistettä. CFTR-genotyyppi määrää suoraan, mihin modulaattoriin potilas voi saada pääsyn. Kun genotyyppi on dokumentoitu potilaskertomukseen ja ilmoitettu potilaalle, se mahdollistaa tietoon perustuvan keskustelun hoitovaihtoehdoista, hoidon odotuksista ja ennusteesta – mikä estää diagnoosin viivästymisen ja mahdollistaa varhaisen puuttumisen, joka voi säilyttää keuhkojen toiminnan ja parantaa tuloksia dramaattisesti.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – kystisen fibroosin ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, parissa. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
