Cowdenin oireyhtymä — PTEN-geenin toimintahäiriö, joka aiheuttaa yhden suurimmista elinikäisistä rintasyöpäriskeistä kaikkien perinnöllisten oireyhtymien joukossa sekä kohonneen kohdun limakalvon, kilpirauhasen, paksusuolen ja munuaissyövän riskin.
PTEN kuuluu ACMG:n SF v3.2 -luetteloon, joka sisältää geenit, joista on raportoitava kliinisessä genomisekvensoinnissa tehdyt toissijaiset löydökset. Koko genomin sekvensointi kartoittaa PTEN-lokuksen kokonaisuudessaan – mukaan lukien promootorialueen variantit ja suuret deleetiot, jotka jäävät tavanomaisissa syöpäpaneeleissa usein huomaamatta.
Cowdenin oireyhtymä — PTEN-hamartoma-kasvaimen oireyhtymä
Cowdenin oireyhtymä (CS) – yleisin PTEN-hamartoma-kasvaimen oireyhtymistä (PHTS) – on autosomaalisesti dominantti perinnöllinen syöpää altistava oireyhtymä, jonka aiheuttavat PTEN-geenin (fosfataasi ja tensin-homologi) sukusolujen patogeeniset variantit kromosomissa 10q23.31. PTEN on kasvainten estäjä, joka säätelee PI3K/AKT/mTOR-signalointireittiä; PTEN-geenin toiminnan menetys johtaa hallitsemattomaan solujen lisääntymiseen ja kasvaimien muodostumiseen. Cowdenin oireyhtymälle ovat ominaisia limakalvojen ja ihon vauriot (trichilemmomat, papillomatoottiset papulat ja akraaliset keratoosit), makrokefalia, hyvänlaatuiset hamartomat useissa elimissä sekä huomattavasti kohonnut riski useille pahanlaatuisille kasvaimille. Arvioitu esiintyvyys on 1/200 000, vaikka molekyylidiagnoosit paljastavat huomattavasti suuremman esiintyvyyden.
PTEN-geenin patogeenisen variantin kantajien elinikäiset syöpäriskit kuuluvat korkeimpiin, joita on dokumentoitu minkään perinnöllisen syöpägeenin osalta: rintasyövän riski on 67–85 % (verrattuna väestön keskiarvoon, joka on noin 12 %); kohdun limakalvon syövän riski on 28–44 %; kilpirauhassyövän riski (pääasiassa follikulaarinen) on 21–38 %; paksusuoli- ja peräsuolisyövän riski on kohonnut (9–18 %); ja munuaissolusyövän riski on noin 34 %. Miespuolisilla kantajilla on kohonnut rintasyövän riski, ja heillä on myös kohonnut riski kilpirauhassyöpään ja paksusuoli- ja peräsuolisyöpään. Bannayan-Riley-Ruvalcaba-oireyhtymä (BRR) ja Proteus-oireyhtymä (PS) ovat alleelisia PTEN-häiriöitä, joilla on päällekkäisiä mutta erillisiä kliinisiä piirteitä ja jotka kaikki johtuvat PTEN-geenin patogeenisistä muunnoksista.
Noin 25 prosentilla Cowdenin oireyhtymän kliiniset diagnoosikriteerit täyttävistä henkilöistä ei ole tunnistettavaa PTEN-geenin koodaussekvenssin variaatiota – tällä ryhmällä voi olla PTEN-geenin promootorialueen variaatioita, syviä intronivariaatioita, laajoja genomin uudelleenjärjestelyjä tai patogeenisia variaatioita muissa PHTS-oireyhtymään liittyvissä geeneissä (SDHB, SDHD, KLLN). NCCN-ohjeissa suositellaan kattavaa PTEN-analyysiä, mukaan lukien deleetio- ja duplikaatiotestaus, osana täydellistä PHTS-arviointia. Vahvistettujen PTEN-kantajien hoitoon kuuluu vuosittainen rintojen magneettikuvaus 30 vuoden iästä alkaen, vuosittainen mammografia 30–35 vuoden iästä alkaen, riskin vähentävän mastektomian harkitseminen, vuosittainen kohdun limakalvon näytteenotto 30–35 vuoden iästä alkaen sekä vuosittainen kilpirauhasen ultraäänitutkimus.
PTEN-hamartoma-kasvaimen oireyhtymiin kuuluvat Cowdenin oireyhtymä, Bannayan-Riley-Ruvalcaban oireyhtymä, Proteuksen oireyhtymä ja Proteuksen kaltainen oireyhtymä – alleeliset sairaudet, joiden oirekuvat ovat osittain samankaltaisia mutta kliinisesti erotettavissa toisistaan ja jotka kaikki johtuvat PTEN-geenin patogeenisistä muunnoksista.
PTEN-promoottorin variantit ja laajat genomin uudelleenjärjestelyt muodostavat jopa 25 % PHTS-tapauksista – nämä variantit jäävät järjestelmällisesti huomaamatta tavanomaisissa perinnöllisen syövän seulontatesteissä, joissa sekvensoidaan ainoastaan PTEN-geenin koodaavat eksonit.
PTEN-geenin promootorialueen variantit on jätetty pois useimmista syöpäpaneelien koostumuksista
PTEN-geenin promootorialueella esiintyviä sukusolujen patogeenisiä variantteja – erityisesti toistuvasti esiintyvää c.-1019_-1018dupTA-varianttia – on tunnistettu Cowdenin oireyhtymää sairastavilla potilailla, joiden tulokset ovat negatiivisia tavanomaisissa PTEN-eksonisekvensointipaneeleissa. Nämä variantit heikentävät PTEN-geenin transkriptiota ja aiheuttavat toiminnallisen haploinsuffisienssin muuttamatta koodaavaa sekvenssiä. Tavallisissa syöpäpaneeleissa sekvensoidaan vain PTEN-geenin 9 koodaavaa eksonia ja kanonisia splissauskohtia; niihin ei sisälly promootorialuetta tai geenien välisiä säätelyelementtejä. Koko genomin sekvensointi lukee koko PTEN-lokuksen, mukaan lukien promootorin, kaikki intronit ja 3' UTR:n — alueet, joilla säätelevät patogeeniset variantit sijaitsevat.
Useiden syöpien riskinhallinta edellyttää PTEN-geenin tilan vahvistamista mahdollisimman varhaisessa iässä
PTEN-geeniin liittyvät syöpäriskit ovat perinnöllisten oireyhtymien korkeimpia, ja seuranta on aloitettava kolmannella elinvuosikymmenellä – ennen kuin suurin osa tämän väestöryhmän rinta- ja kohdun limakalvosyövistä on kliinisesti havaittavissa. NCCN suosittelee vuotuista rintojen magneettikuvausta ja mammografiaa 30 vuoden iästä alkaen sekä kohdun limakalvon seurantaa 30–35 vuoden iästä alkaen. Tämä tiukka seurantaohjelma on perusteltu elinikäisen riskin tietojen perusteella, mutta sen toteuttaminen edellyttää vahvistettua PTEN-patogeenistä varianttia. Negatiivinen tulos epätäydellisessä paneelissa – jossa ei ole arvioitu PTEN-promoottoria tai rakenteellisia uudelleenjärjestelyjä – voi antaa väärän turvallisuudentunteen, joka viivästyttää tarvittavaa seurantaa vuosilla.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Learn more →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – Cowdenin oireyhtymän, PTEN-hamartoma-kasvaimen oireyhtymän sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
