Synnynnäiset glykosylaatiohäiriöt — yli 170 geneettistä alatyyppiä, jotka vaikuttavat kaikkiin elinjärjestelmiin ja joiden diagnosointi kestää keskimäärin vuosia, koska yksikään asiantuntija ei pysty yksin tunnistamaan kokonaiskuvaa.
Koko genomin sekvensointi analysoi kaikki yli 170 CDG-geeniä samanaikaisesti – ja päättää näin vuosia kestäneen diagnoosiprosessin tarjoamalla täsmällisen geenidiagnoosin, joka yhdistää näennäisesti toisistaan riippumattomat monisysteemiset oireet.
Synnynnäiset glykosylaatiohäiriöt
Synnynnäiset glykosylaatiohäiriöt (CDG) ovat nopeasti laajeneva ryhmä, johon kuuluu yli 170 geneettistä sairautta. Ne johtuvat virheistä glykosylaatioreitissä – entsymaattisessa prosessissa, jossa sokeriketjut (glykaanit) kiinnittyvät proteiineihin ja lipideihin. Glykosylaatio on välttämätöntä proteiinien taitteelle, solujen signalointille, immuunijärjestelmän toiminnalle ja elinten kehitykselle. Viat lähes missä tahansa glykosylaatioreitin vaiheessa voivat aiheuttaa monisysteemisen sairauden. PMM2-CDG (aiemmin CDG-Ia), jonka aiheuttaa PMM2-geenin (fosfomannomutaasi 2) patogeeniset variantit, on yleisin alatyyppi, ja se kattaa noin 70–80 % diagnosoiduista CDG-tapauksista.
CDG aiheuttaa hyvin vaihtelevan monisysteemisen sairauden riippuen siitä, mikä geeni on vaurioitunut: neurologisia oireita (kehitysvammaisuus, pikkuaivojen hypoplasia, aivohalvauksen kaltaiset jaksot, kohtaukset), maksan toimintahäiriöitä (kohonneet transaminaasiarvot, proteiineja menettävä enteropatia, koagulopatia), luuston poikkeavuuksia (sisäänpäin kääntyneet nännit, epänormaali rasvan jakautuminen, kyfoskolioosi), hematologiset poikkeavuudet (koagulopatia hyytymistekijöiden puutteellisesta glykosylaatiosta johtuen), oftalmologiset löydökset (retinitis pigmentosa, strabismus) ja endokriininen toimintahäiriö. Monisysteeminen vaurio johtaa usein hajanaisiin erikoislääkärin arvioihin ilman yhtenäistä diagnoosia.
CDG tunnustetaan yhä laajemmin alidiagnosoiduksi sairausryhmäksi – tietoisuuden lisääntyminen ja genomitestaus ovat johtaneet tunnistettujen CDG-geenien ja diagnosoitujen potilaiden määrän räjähdysmäiseen kasvuun. Transferriinin isoelektrinen fokusointi (TIEF) on perinteinen seulontatesti N-glykosylaatio-CDG:n tunnistamiseksi, mutta sen tulos on normaali useimmissa O-glykosylaatio-, GPI-ankkurointi- ja lipidiglykosylaatio-CDG-alatyypeissä. Monet CDG-alatyypit diagnosoidaan nykyään vain genomisekvensoinnin avulla. Uusia hoitomuotoja ovat mannoosilisä (MPI-CDG:lle, ainoalle CDG-tyypille, jolle on vakiintunut ruokavaliohoito), asetatsolamidi (PMM2-CDG:n aivohalvauksen kaltaisille jaksoille) sekä geeniterapia-lähestymistavat, jotka ovat prekliinisessä kehitysvaiheessa.
MPI-CDG on ainoa CDG-alatyyppi, johon on olemassa erittäin tehokas ruokavaliohoito – yksinkertainen suun kautta otettava mannoosilisä. MPI-CDG:n erottaminen PMM2-CDG:stä edellyttää molekyyligenotyyppausta, ja sillä on suora vaikutus hoitoon.
Yhtä ainoaa biokemiallista testiä tai geenipaneelia ei riitä yli 170 CDG-geenin seulontaan. Koko genomin sekvensointi (WGS) on ainoa testi, jolla voidaan kartoittaa CDG-geenien koko kirjo – mukaan lukien äskettäin kuvatut alatyypit, joita ei vielä sisälly mihinkään kliiniseen paneeliin.
CDG-diagnoosin tekemiseen kuluu keskimäärin 5–7 vuotta – koko genomin sekvensointi (WGS) mahdollistaa diagnoosin jo muutamassa viikossa
CDG-potilaat käyvät tyypillisesti vuosien ajan useiden eri erikoislääkäreiden – neurologien, hepatologien, hematologien ja endokrinologien – vastaanotolla, ennen kuin taudin taustalla oleva glykosylaatiovika tunnistetaan. Monielinjärjestelmän vaurio viivästyttää paradoksaalisesti diagnoosia, koska yksikään erikoislääkäri ei näe kokonaiskuvaa. WGS-analyysillä arvioidaan kaikki yli 170 CDG-geeniä yhdestä verinäytteestä, mikä voi antaa muutamassa viikossa diagnoosin, johon peräkkäiset asiantuntija-arvioinnit eivät ole päässeet vuosien aikana. Tämä on juuri se kliininen tilanne, jossa kattava genomin analyysi on perinteisiä erotusdiagnoosimenetelmiä parempi.
Uusia CDG-geenejä löydetään vuosittain – vain koko genomin sekvensointi (WGS) mahdollistaa sellaisten geenien analysoinnin, joita ei vielä ole mukana missään kliinisessä testipaneelissa
Tunnettujen CDG-geenien määrä on yli kaksinkertaistunut viimeisen vuosikymmenen aikana, ja uusia alatyyppejä kuvataan vuosittain. Kliiniset geenipaneelit ovat aina retrospektiivisia – niissä testataan geenit, jotka olivat tiedossa paneelin suunnitteluhetkellä, mikä voi olla 1–3 vuotta jäljessä nykyisistä geenilöydöistä. WGS tallentaa koko genomin, mikä mahdollistaa uudelleenanalysoinnin uusien CDG-geenien julkaisemisen yhteydessä ilman, että tarvitaan uutta verinäytteenottoa tai sekvensointia. Noin 30 % aiemmin ratkaisemattomista CDG-tapauksista ratkaistaan WGS-pohjaisten geenilöytömenetelmien avulla.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – synnynnäisten glykosylaatiohäiriöiden sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
