CHEK2-geenin aiheuttama perinnöllinen syöpäriski – kohtuullisen penetraation omaava syöpägeeni, joka jää usein huomaamatta tavanomaisissa, pelkästään BRCA-geenejä koskevissa testeissä. CHEK2-geenin varianttien tunnistaminen ohjaa seulonnan laajuutta ja antaa tietoa perheen syöpäriskistä.
Koko genomin sekvensointi paljastaa CHEK2-geenin muunnoksia, jotka selittävät perinnöllisen esiintymismallin perheissä, jotka aiemmin luokiteltiin BRCA-negatiivisiksi – ja avaa uusia mahdollisuuksia seulonnan tehostamiseen.
CHEK2 (perinnöllinen syöpäriski)
CHEK2-geeni koodaa tarkistuspistekinaasia 2:ta, seriin/treoniinikinaasia, jonka ATM aktivoi vasteena DNA-vaurioille. Aktivoituessaan CHEK2 fosforyloi keskeisiä solusyklin säätelijöitä, kuten p53:a ja BRCA1:tä, ja koordinoi DNA:n korjausta, solusyklin pysähtymistä ja apoptoosia. Patogeeniset CHEK2-variantit heikentävät tätä tarkistuspisteen toimintaa, jolloin vaurioituneet solut voivat jatkaa jakautumistaan ilman valvontaa. Eniten tutkittu variantti, c.1100delC, tuottaa katkaistun, epästabiilin proteiinin. Patogeeniset CHEK2-variantit luokitellaan kohtalaisen penetraatioisiksi — ne lisäävät rintasyövän riskiä noin 2–3-kertaisesti (elinikäinen riski ~20–30 %), ja riski luokitellaan sukututkimuksen perusteella.
CHEK2-geenin mutaatiot ovat väestössä yleisempiä kuin BRCA1/2-geenin mutaatiot – c.1100delC-variantin kantajuus on 0,2–1,4 % eurooppalaisissa väestöryhmissä. Rintasyövän lisäksi CHEK2-variantit liittyvät lievästi kohonneeseen riskiin sairastua eturauhas-, paksusuoli-, munuais-, kilpirauhas- ja verisyöpiin. Bialleliset CHEK2-kantajat (harvinaisia) ovat huomattavasti suuremmassa rintasyöpäriskissä kuin monoalleliset kantajat. Haasteena on, että CHEK2:n hoidon kliiniset ohjeet eivät ole yhtä vakiintuneita kuin BRCA1/2:n osalta, mikä on aiemmin aiheuttanut epävarmuutta terveydenhuollon ammattilaisille.
CHEK2-geenin patogeenisen variantin löytäminen on kliinisesti merkittävää. Se selittää perinnöllisen rintasyövän esiintymisen perheissä, joiden BRCA-testitulos on negatiivinen – tämä tilanne esiintyy noin 5 prosentissa tällaisista perheistä. Se oikeuttaa kantajat tehostettuun rintojen magneettikuvausseurantaan 40 vuoden iästä alkaen (tai aikaisemmin, jos suvussa on tapauksia). Miehillä se mahdollistaa eturauhassyövän tietoisuuden lisäämisen ja varhaisen seulonnan keskustelun. Ensisukulaisten kaskaditestaus tunnistaa muita kantajia, jotka hyötyvät seurannasta, jolloin yhden henkilön geneettinen löydös muuttuu koko perheen ennaltaehkäisyyn liittyviksi mahdollisuuksiksi.
Yksittäisen BRCA-geenin testauksessa ja monissa geenipaneeleissa CHEK2-geeni jätetään kokonaan huomiotta. Rintasyöpää sairastavista naisista 1,7 prosentilla on CHEK2-geenin muunnoksia, joita tavanomaisissa testeissä ei havaita.
CHEK2-geeniä ei sisällytetä pelkästään BRCA-geenejä sisältäviin paneeleihin eikä moniin vakiopaneeleihin
Monet perinnöllisen syövän geenitestipaneelit suunniteltiin alun perin BRCA1/2- ja Lynchin oireyhtymän geenien pohjalta. CHEK2-, ATM- ja PALB2-geenit lisättiin myöhemmin, eivätkä kaikki testipaneelit sisällä niitä. Merkittävässä tutkimuksessa kävi ilmi, että 76 %:lla CHEK2-geenin kantajista ei olisi oikeutta tehostettuun seurantaan pelkästään BRCA-geenejä koskevien vakiotestauskriteerien perusteella. Monigeenitestaukseen osallistuvista rintasyöpää sairastavista naisista noin 1,7 %:lla on patogeenisia CHEK2-geenimuunnoksia. Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki perinnöllisen syövän geenit samanaikaisesti, mikä varmistaa, ettei yhtään varianttia jää kriteereihin perustuvien aukkojen läpi.
CHEK2-geenin löydös selittää aiemmin selittämättömiä syöpäilmiöitä
Kun BRCA-testi on negatiivinen mutta suvussa esiintyy edelleen runsaasti rintasyöpätapauksia, syynä on usein CHEK2-geenin mutaatio – tämä havainto tehdään 5 prosentissa tällaisista suvuista. CHEK2-geenin mutaation tunnistaminen mahdollistaa tehostetun rintojen magneettikuvausseurannan 40 vuoden iästä lähtien, paksusuolen syövän seulonnan merkityksen korostamisen sekä eturauhassyövän seurannan miespuolisille kantajille. Se käynnistää ketjureaktion, jossa tutkitaan sukulaisia, jotka saattavat olla saman mutaation kantajia tietämättään. Joillekin suvuille CHEK2-löydös tarjoaa vihdoin sen puuttuneen geneettisen selityksen.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – CHEK2-geenin (perinnöllinen syöpäriski) ja muiden sairauksien, sekä harvinaisten että yleisten, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
