Charcot-Marie-Toothin tauti — etenevä ääreishermoston rappeuma, johon liittyy yli 100 syygeeniä. Tietyn geenimuunnoksen tunnistaminen auttaa määrittämään taudin alatyypin, ennusteen ja uudet hoitovaihtoehdot.
Koko genomin sekvensointi paljastaa CMT:n tarkan geneettisen syyn, mikä mahdollistaa tarkan alatyypin diagnoosin, ennusteen, lääkehoidon ohjauksen sekä pääsyn geenikohtaisiin kliinisiin tutkimuksiin.
Charcot-Marie-Toothin tauti
Charcot-Marie-Toothin tauti (CMT) on yleisin perinnöllinen ääreishermostosairaus, jota esiintyy noin yhdellä 2 500:sta ihmisestä. Sille ovat ominaisia etenevä distaalinen lihasheikkous ja lihasten surkastuminen (jotka alkavat tyypillisesti jaloista ja sääristä), tuntohäiriöt, refleksien heikkeneminen sekä etenevät jalkojen epämuodostumat (pes cavus, vasaravarpaat). Tauti puhkeaa tyypillisesti ensimmäisen tai toisen elinvuosikymmenen aikana, mutta puhkeamisajankohta vaihtelee suuresti yksilöiden ja geneettisten alatyyppien välillä. Vakavuus vaihtelee lievästä jalkojen roikkumisesta pyörätuoliriippuvuuteen, ja taudin etenemisnopeus vaihtelee suuresti.
CMT:n geneettinen rakenne on erittäin heterogeeninen: on kuvattu yli 100 erillistä geneettistä alatyyppiä, joihin liittyy yli 45 syygeeniä. Tärkeimpiä periytyvyysluokkia ovat CMT1 (demyelinisoiva, autosomaalinen dominantti, ~50 % tapauksista), CMT2 (aksonaalinen, ~15–30 %, pääasiassa autosomaalinen dominantti) ja CMTX (X-kromosomiin liittyvä, ~10–15 %). Neljä yleisimmin mutatoitunutta geeniä – PMP22, GJB1, MPZ ja MFN2 – muodostavat noin 90 % positiivisista molekyylidiagnooseista. PMP22-geenin 1,5 Mb:n duplikaatio aiheuttaa CMT1A:n (yleisin muoto); MFN2-mutaatioista johtuu CMT2A; GJB1-mutaatioista johtuu X-kromosomiin sidottu CMTX1.
CMT-taudin geneettinen diagnoosi on olennaisen tärkeää hoidon kannalta: tarkka alatyyppiluokitus määrittää ennusteen ja taudin etenemisnopeuden; spesifiset perintömuodot mahdollistavat geneettisen neuvonnan, jossa voidaan arvioida tarkasti taudin uusiutumisen riski; lääkitysturvallisuudessa tapahtuu muutoksia — vinkristiini on vasta-aiheinen PMP22-geeniin liittyvässä CMT:ssä ja voi aiheuttaa vakavaa neuropatiaa; geenikohtaiset kliiniset tutkimukset (PXT3003 CMT1A:lle, geeniterapiamenetelmät) tulevat saataville; ja yhteys luonnonhistoriatutkimuksiin mahdollistaa tietoon perustuvan seurannan ja suunnittelun. Suurelle osalle CMT-potilaista, joilla ei ole geneettistä diagnoosia, Genome Test voi tarjota vastauksen, joka päättää heidän diagnoosimatkansa.
CMT-tautiin kuuluu yli 100 geneettistä alatyyppiä, joihin kuuluvat demyelinisoituvat, aksonaaliset, välimuotoiset ja X-kromosomiin sidotut muodot. Neljä yleisintä geeniä selittävät 90 % diagnooseista, mutta loput 10 % edellyttävät kattavaa geenisekvensointia.
Vakiotestit kattavat 8–20 geeniä. CMT-taudilla on yli 45 tunnettua syytä. Vaiheittainen yksittäisten geenien testaus jättää 20–40 % tapauksista diagnosoimatta.
CMT:n äärimmäinen geneettinen heterogeenisyys tekee vaiheittaisesta paneelitestauksesta mahdotonta
CMT-geenitestaus on perinteisesti perustunut vaiheittaiseen lähestymistapaan: ensin analysoidaan PMP22-geenin duplikaatioita ja deleetioita (tunnistaa vain noin 50 % CMT-tapauksista); sen jälkeen suoritetaan kohdennettuja geenipaneeleja (8–20 geeniä, jotka tunnistavat lisäksi noin 30–40 %). Tällöin 20–40 %:lle potilaista jää molekyylidiagnoosi määrittämättä. Edes kattavat paneelit eivät pysty havaitsemaan kaikkia yli 45 tunnettua CMT-geeniä, harvinaisia alatyyppejä, PMP22:n ulkopuolisia kopioiden lukumäärän variaatioita tai intronivariaatioita. Kriittisen PMP22-duplikaation kopioiden lukumäärän variaatioiden havaitseminen vaatii erillisen analyysin, jota ei aina suoriteta. Koko genomin sekvensointi, jossa on asianmukainen CNV-havaitseminen ja bioinformatiivinen syvyys, kattaa kaikki tunnetut CMT-geenit, PMP22-duplikaation, intronivariaatiot ja uudet ehdokasgeenit yhdellä testillä.
Geneettinen diagnoosi mahdollistaa alatyyppikohtaisen hoidon ja kliinisiin tutkimuksiin osallistumisen
Tarkka geneettinen alatyyppien määrittäminen on käänteentekevää: CMT1A (PMP22-duplikaatio) täyttää geeniterapiakokeiden kriteerit (PXT3003, Phocéa-tutkimus); CMT2A (MFN2) täyttää kehitteillä olevien, mitokondrioihin kohdistuvien uusien hoitojen kriteerit; CMTX1 (GJB1) edellyttää X-kromosomiin sidottua perinnöllisyysneuvontaa ja voi täyttää gap junction -rakenteisiin kohdistuvien hoitomuotojen kriteerit. Kaikkien diagnosoitujen alatyyppien avulla voidaan välttää neurotoksisia lääkkeitä (vinkristiinin vasta-aihe PMP22-sairaudessa), antaa tarkkaa ennusteohjausta ja seurata siihen liittyviä komplikaatioita. Diagnoosittomille CMT-potilaille (noin 40 %) Genome Test tarjoaa usein geneettisen vastauksen, joka selittää heidän neuropatian ja avaa pääsyn kohdennettuihin hoitotoimenpiteisiin.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – Charcot-Marie-Toothin taudin sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
