Keliakia – gluteenia vastaan kohdistuva autoimmuunireaktio, johon liittyy vahva geneettinen yhteys HLA-DQ2- ja HLA-DQ8-geeneihin. Geneettisillä testeillä voidaan lähes varmuudella sulkea keliakia pois tai vahvistaa geneettinen alttius.
Koko genomin sekvensointi tunnistaa HLA-DQ2- ja HLA-DQ8-variantit, jotka määräävät gluteeniherkkyyden, mikä helpottaa diagnoosia ja mahdollistaa keliakian poissulkemisen riskiryhmään kuuluvilla henkilöillä.
Keliakia
Keliakia on autoimmuunisairaus, jonka laukaisee gluteenin nauttiminen geneettisesti alttiilla henkilöillä. Sairauden esiintyvyys on maailmanlaajuisesti noin 1 %, ja se on yleisempää eurooppalaista syntyperää olevissa väestöryhmissä. Kliininen kuva vaihtelee suuresti: klassisiin oireisiin kuuluvat imeytymishäiriöt (ripuli, steatorrea, painonlasku), vatsakipu ja lasten kasvuhäiriöt; dermatitis herpetiformis (kutiseva ihottuma) esiintyy 15–25 %:lla keliakiapotilaista; ja epätyypillisiin oireisiin kuuluvat yksittäiset maksaentsyymien kohoamiset, anemia, osteoporoosi tai neurologiset oireet. Diagnoosi tehdään serologisten testien (kudostransglutaminaasi-IgA-vasta-aine, endomysiaalinen vasta-aine) ja ohutsuolen biopsian avulla, jossa näkyy villusten atrofia. Huomionarvoista on, että noin 98,4 % keliakiapotilaista kantaa joko HLA-DQ2- tai HLA-DQ8-geeniä, mikä tekee HLA-genotyypistä tehokkaan diagnostisen työkalun.
HLA-DQ2 ja HLA-DQ8 ovat MHC-luokan II molekyylejä, α- ja β-ketjujen heterodimeerejä, joita koodaavat HLA-alueella lähekkäin sijaitsevat geenit. HLA-DQ2 koostuu HLA-DQA1*05- ja HLA-DQB1*02-ketjuista; HLA-DQ8 koostuu HLA-DQA1*03- ja HLA-DQB1*03:02-ketjuista. Näillä molekyyleillä on peptidien sitoutumistaskuja, joilla on spesifiset ankkurijäämävaatimukset, jotka täydentävät gluteenipeptidien sekvenssejä. Patogeeninen mekanismi on T-soluvälitteinen: kudostransglutaminaasi deamidoi gluteenipeptidit, jolloin syntyy vahvoja MHC-ligandeja HLA-DQ2- tai HLA-DQ8-molekyyleille. Autoreaktiiviset T-solut tunnistavat nämä DQ2/DQ8:n esittämät gluteenista peräisin olevat epitoopit, mikä laukaisee Th1- ja Th17-vasteet, jotka aiheuttavat suoliston tulehdusta ja villusten atrofiaa. Noin 30–40 % väestöstä kantaa DQ2- tai DQ8-geeniä, mutta vain 3–5 % sairastuu keliakiaan, mikä viittaa siihen, että tarvitaan myös muita geneettisiä ja ympäristötekijöitä.
HLA-DQ2/DQ8-testaus on erityisen hyödyllistä diagnoosin poissulkemisessa: DQ2- ja DQ8-antigeenien puuttuminen sulkee käytännössä keliakian pois erittäin korkealla negatiivisella ennustearvolla (~100 %). Negatiivinen tulos potilaalla, jolla on serologisia viitteitä keliakiasta, tulisi johtaa diagnoosin uudelleenarviointiin. Positiiviset tulokset vahvistavat HLA-riskin olemassaolon, mutta eivät diagnosoi keliakiaa; lisätutkimuksia (serologisia ja endoskooppisia) tarvitaan. HLA-testaus on erityisen arvokasta potilailla, jotka jo noudattavat gluteenitonta ruokavaliota (serologia voi antaa vääriä negatiivisia tuloksia), alle 2-vuotiailla lapsilla (serologia on vähemmän luotettava) sekä keliakiapotilaiden ensimmäisen asteen sukulaisilla (10–15 %:n riski väestössä). Oireettomilla riskiryhmään kuuluvilla perheenjäsenillä DQ2/DQ8:n puuttuminen voi luotettavasti poistaa endoskooppisen seulonnan tarpeen.
HLA-DQ2/DQ8-tyypitys on hyödyllistä diagnoosin tukena ja sairauksien poissulkemisessa riskiryhmissä. Vakiotesteissä HLA-tyypityksen kattavuus voi olla rajallinen.
HLA-testaus on tehokas keino sulkea keliakia pois
HLA-DQ2- ja HLA-DQ8-geenien puuttuminen sulkee käytännössä pois keliakian erittäin korkealla negatiivisella ennustearvolla (~100 %). Tavalliset geenitestit eivät välttämättä sisällä kattavaa HLA-DQA1- ja HLA-DQB1-tyypitystä. HLA-testauksella on kuitenkin rajoituksia: positiiviset tulokset vahvistavat vain geneettisen alttiuden, eivät taudin esiintymistä, koska 30–40 % väestöstä kantaa DQ2/DQ8-geenejä, mutta vain 3–5 % sairastuu keliakiaan. Koko genomin sekvensointi kerää HLA-varianttitietoja, mikä mahdollistaa lopullisen HLA-DQ2/DQ8-riskinarvioinnin diagnoosin tueksi, perheen seulontaan ja keliakian poissulkemiseen diagnostisissa pulmatilanteissa.
HLA-genotyyppi määrittää keliakian riskin ja ohjaa perheen seulontaa
HLA-DQ2- tai HLA-DQ8-geenin kantajilla on geneettinen riski sairastua keliakiaan; DQ2/DQ8-negatiiviset potilaat voivat olla varmoja siitä, että keliakian puhkeaminen on erittäin epätodennäköistä. Perheissä, joissa on tunnettu keliakiapotilas, ensimmäisen asteen sukulaisten HLA-DQ2/DQ8-testaus selvittää, kenellä on geneettinen riski (ja kenelle tulisi tehdä serologinen seulonta) ja kenellä ei (ja kuka voi välttää tarpeettoman seurannan). Potilaille, jotka jo noudattavat gluteenitonta ruokavaliota, HLA-testaus auttaa vahvistamaan keliakian epäilyn, kun serologinen tulos on negatiivinen ruokavaliosta johtuvan gluteenin välttämisen vuoksi. Potilaskertomukseen dokumentoitu HLA-genotyyppi estää tarpeettomat ruokavalion rajoitukset niillä, joilla ei ole geenimuutosta, ja keskittää seurannan niihin, joilla on todellinen geneettinen riski.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – keliakian ja muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, myös virtuaalisia potilasjärjestöjä.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
