Karbamatsepiinin yliherkkyys — HLA-alleelikohtaiset reaktiot, jotka aiheuttavat Stevens-Johnsonin oireyhtymän ja toksisen epidermaalisen nekrolyysin ja joiden kuolleisuusaste on jopa 30 %, maailman eniten määrätyllä kouristuslääkkeellä.
Koko genomin sekvensointi tarjoaa kattavan HLA-tyypityksen – joka sisältää HLA-B*15:02:n (erityisen tärkeä aasialaisille väestöryhmille) ja HLA-A*31:01:n (erityisen tärkeä eurooppalaisille väestöryhmille) samassa tuloksessa – ja ohjaa näin epilepsian farmakogenomiikan tärkeimpiä lääkemääräyspäätöksiä.
Karbamatsepiinin yliherkkyys — HLA-B*15:02
Karbamatsepiini (Tegretol) on yksi yleisimmin määrättyjä kouristuslääkkeitä fokaalisen epilepsian, kolmoishermosärkyn ja kaksisuuntaisen mielialahäiriön hoitoon. Osalla potilaista karbamatsepiini aiheuttaa vakavia ihon haittavaikutuksia: Stevens-Johnsonin oireyhtymä (SJS) ja toksinen epidermaalinen nekrolyysi (TEN) — immuunivälitteisiä rakkuloita aiheuttavia reaktioita, joihin liittyy laaja-alaista ihon ja limakalvojen irtoamista, laajaa kudosmenetystä, sepsisriskiä ja 5–30 %:n kuolleisuutta. Nämä reaktiot eivät ole annoksesta riippuvia, vaan ne ilmenevät HLA-alleelikohtaisina kuvioina, joiden perusteella hoitoa voidaan ennustaa etukäteen.
Two HLA alleles have been validated as pharmacogenomic biomarkers for carbamazepine SJS/TEN in distinct populations. HLA-B*15:02 is strongly associated with SJS/TEN risk in Han Chinese, Thai, Malaysian, Vietnamese, and other Southeast Asian populations — allele frequency ranging from 5-15% in affected ethnic groups, essentially absent in European populations. HLA-B*15:02 carriers in Asian populations who receive carbamazepine have approximately a 5-10% risk of SJS/TEN, compared to <0.1% in non-carriers. HLA-A*31:01 is associated with carbamazepine hypersensitivity (including SJS/TEN but also milder maculopapular exanthema and drug reaction with eosinophilia and systemic symptoms/DRESS) in Europeans, Japanese, and other populations where HLA-B*15:02 is rare. HLA-A*31:01 frequency is approximately 2-5% in European populations.
FDA lisäsi karbamatsepiiniin vuonna 2007 varoituksen, jossa suositellaan, että aasialaista syntyperää oleville potilaille tehdään HLA-B*15:02-testi ennen karbamatsepiinihoidon aloittamista. CPIC tarjoaa tason A ohjeistuksen karbamatsepiinille sekä HLA-B*15:02- että HLA-A*31:01-geenien osalta. Vahvistetuille HLA-riskikantajille voidaan määrätä vaihtoehtoisia kouristuslääkkeitä – lamotrigiini, levetirasetaami, fenytoiini asianmukaisella HLA-huomioinnilla, okskarbatsepiini. Hoitoa edeltävän seulonnan kiireellisyyttä korostaa SJS/TEN:n peruuttamattomuus – kun reaktio on alkanut, sen kulkua ei voida pysäyttää, ja lopputulos riippuu ainoastaan lääkityksen varhaisesta lopettamisesta ja intensiivisestä tukihoidosta.
HLA-B*15:02 on ratkaiseva alleeli Kaakkois-Aasian väestöryhmissä. HLA-A*31:01 on ratkaiseva alleeli eurooppalaisissa, japanilaisissa ja muissa väestöryhmissä. Molemmat alleelit on otettava huomioon, jotta karbamatsepiinin farmakogenominen riskiarviointi olisi kattava kaikissa väestöryhmissä.
Kaupallisia testejä on saatavilla pelkästään HLA-B*15:02:n määrittämiseen. Koko genomin sekvensointi tarjoaa lisäksi kattavan HLA-tyypityksen, joka kattaa HLA-A*31:01:n, HLA-B*58:01:n (allopurinoli), HLA-B*57:01:n (abakaviiri) sekä kaikki muut farmakogenomiikan kannalta merkitykselliset HLA-alleelit yhdellä ainoalla testillä.
Pelkästään HLA-B*15:02:n testaaminen jättää huomiotta HLA-A*31:01:stä johtuvan karbamatsiinin yliherkkyysriskin eurooppalaisilla
Kaupalliset HLA-B*15:02-pikatestit on kehitetty nimenomaan karbamatsepiinia saaville aasialaisille potilasryhmille. Kun testiä käytetään eurooppalaisilla tai monisukuisilla potilasryhmillä, negatiivinen HLA-B*15:02-tulos on oikea mutta puutteellinen – se ei ota huomioon HLA-A*31:01-alleelia, joka on eurooppalaisten keskuudessa tärkein karbamatsepiiniin liittyvän yliherkkyyden aiheuttaja. CPIC suosittelee HLA-A*31:01-testausta kaikille muille kuin aasialaisille potilaille, joille karbamatsepiinia harkitaan. Pelkästään HLA-B*15:02-testi jättää huomiotta kaikki HLA-A*31:01-riskit. Koko genomin sekvensointi suorittaa täydellisen HLA-luokan I tyypityksen 4-numeroisella kenttätarkkuudella, kattaen samanaikaisesti kaikki farmakogenomisesti merkitykselliset HLA-alleelit.
Kattava HLA-tyypitys on pysyvä farmakogenominen etu, joka kattaa karbamatsepiinin, allopurinolin, abakaviirin ja tulevat lääkkeet
Farmakogenominen HLA-kuva ulottuu karbamatsepiinin ulkopuolelle. HLA-B*58:01 ennustaa allopurinolin aiheuttamaa SJS/TEN-oireyhtymää (erityisesti han-kiinalaisissa ja korealaisissa väestöryhmissä). HLA-B*57:01 ennustaa abakaviiriin kohdistuvaa yliherkkyyttä. HLA-A*31:01 ennustaa myös okskarbatsepiinin ja fenytoiinin yliherkkyyttä joissakin väestöryhmissä. Potilas, joka tarvitsee epilepsialääkitystä tai kihtilääkitystä, voi joutua tekemään useita tällaisia lääkemääräyspäätöksiä elämänsä aikana. Koko genomin sekvensoinnilla tehty täydellinen HLA-tyypitys vastaa kaikkiin näihin kysymyksiin samanaikaisesti ja pysyvästi, ja tulos tallennetaan potilaskertomukseen käytettäväksi jokaisessa tulevassa lääkemääräystilanteessa.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Learn more →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – esimerkiksi karbamatsapiiniyliherkkyyden (HLA-B*15:02) sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, myös virtuaalisia potilasjärjestöjä.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
