Perinnöllinen virtsarakkosyöpä — NAT2-geenin hidas asetyloija -genotyyppi lisää riskiä heikentämällä karsinogeenien aineenvaihduntaa, ja Lynchin oireyhtymään (erityisesti MSH2) kuuluu virtsateiden syöpä osana perinnöllisten syöpien kirjoa.
Koko genomin sekvensoinnilla arvioidaan NAT2-asetylaattorin tila, Lynchin oireyhtymän geenit (MSH2 – suurin virtsateiden syöpäriski), GSTM1-geenin deleetio sekä muut virtsarakon syöpään altistavat variantit.
Virtsarakon syöpä — Perinnöllinen
Virtsarakkosyöpä koskettaa vuosittain noin 83 000 amerikkalaista. Vaikka tupakointi on merkittävin ympäristöön liittyvä riskitekijä, geneettisellä alttiudella on merkittävä rooli. NAT2 (N-asetyylitransferaasi 2) -genotyyppi on parhaiten tunnettu geneettinen riskitekijä – hitailla asetyloijilla (~50–60 % eurooppalaisista) on noin 40 % suurempi virtsarakkosyövän riski, mikä johtuu aromaattisten amiinikarsinogeenien (tupakansavusta ja työperäisestä altistuksesta) heikentyneestä maksan detoksifikaatiosta. GSTM1-nollagenotyyppi (homozygoottinen deleetio, noin 50 % väestöstä) heikentää entisestään karsinogeenien detoksifikaatiota ja lisää riskiä itsenäisesti.
Lynch-oireyhtymä – erityisesti MSH2-geenin patogeeniset variantit – lisää ylävirtsateiden uroteelisyövän (munuaisaltaan ja virtsanjohdinten syöpä) riskiä. MSH2-kantajilla on noin 12–18-kertainen riski sairastua ylempien virtsateiden uroteelisyöpään verrattuna yleiseen väestöön. Tämä yhteys on niin vahva, että selittämätön ylempien virtsateiden uroteelisyöpä alle 60-vuotiaalla potilaalla tulisi johtaa Lynch-oireyhtymän arviointiin. Lynchiin liittyvät uroteelisyövät ovat MSI-positiivisia ja voivat vastata immuunivalvontapisteiden estäjiin (pembrolitsumabi), samoin kuin Lynchiin liittyvä paksusuolen ja peräsuolen syöpä.
Muita perinnöllisiä virtsarakkosyövän riskitekijöitä ovat muun muassa RB1-geeni (retinoblastoomageeni – selviytyneillä on kohonnut virtsarakkosyövän riski, mikä saattaa liittyä syklofosfamidihoitoon), FGFR3-geeni (sukusolumuutokset saattavat altistaa matala-asteiselle papillaariselle virtsarakkosyövälle) sekä uudet GWAS-lokukset, jotka vaikuttavat uroteelisolujen biologiaan ja alttiuteen karsinogeeneille. Farmakogenomisella NAT2-genotyypillä on kaksi käyttötarkoitusta: virtsarakkosyövän riskin arviointi JA NAT2:n kautta metaboloituvien lääkkeiden (isoniatsidi, hydralatsiini, sulfonamidit) lääkeaineenvaihdunnan ohjaaminen.
NAT2-geenin hitailla asetyloijilla on kaksi kliinistä merkitystä: kohonnut virtsarakkosyövän riski JA muuttunut lääkeaineenvaihdunta. Jos olet hidas asetyloija ja tupakoit, virtsarakkosyövän riskisi on huomattavasti kohonnut – mikä tekee tupakoinnin lopettamisesta entistäkin kiireellisemmän asian.
NAT2-genotyyppi antaa samanaikaisesti kuvan virtsarakon syövän riskistä ja lääkeaineen farmakogenomisesta aineenvaihdunnasta. Lynch-oireyhtymään (MSH2) liittyvät virtsarakon syövät reagoivat immunoterapiaan. Koko genomin sekvensointi (WGS) kattaa sekä syövän genetiikan että farmakogenomiikan.
Tupakoivilla NAT2-hidasasetylaattoreilla on kohonnut virtsarakkosyövän riski – genotyyppiin perustuva riskineuvonta lisää motivaatiota tupakoinnin lopettamiseen
NAT2-geenin hitaan asetyloijan genotyypin ja tupakoinnin yhdistelmä aiheuttaa kertovaa vuorovaikutusta virtsarakon syöpäriskin suhteen. Potilaalle kertominen siitä, että hänellä on geneettinen muunnos, joka heikentää hänen kykyään poistaa tupakan karsinogeenejä elimistöstä – ja nimenomaan lisää virtsarakon syöpäriskiä – tarjoaa tehokkaan yksilöllisen motivaation tupakoinnin lopettamiseen. Kliinisissä tutkimuksissa on osoitettu, että tämä farmakogenominen neuvontatapa vahvistaa motivaatiota tupakoinnin lopettamiseen.
Selittämätön ylempien virtsateiden uroteelisyöpä tulisi johtaa Lynch-testaukseen – MSH2-geenin kantajilla on immunoterapiaan reagoivia kasvaimia
Ylävirtsateiden uroteelisyöpä (munuaisaltaan, virtsanjohdin) alle 60-vuotiaalla potilaalla, jolla ei ole ilmeisiä riskitekijöitä, tulisi johtaa MSH2/Lynch-oireyhtymän tutkimiseen. Lynchiin liittyvät uroteelisyövät ovat MSI-positiivisia ja reagoivat pembrolitsumabiin. Lisäksi Lynchin diagnoosi käynnistää perheenjäsenille suunnatut peräkkäiset geenitestaukset ja syövän seurantaprotokollat, joilla ehkäistään perheenjäsenten paksusuoli-, kohdun limakalvo- ja muita Lynchiin liittyviä syöpiä.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – virtsarakkosyövän (perinnöllinen) sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
