ATM-geenin aiheuttama perinnöllinen syöpäriski — ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa mainittu DNA:n korjausgeeni, joka lisää rintasyövän, haimasyövän ja eturauhassyövän riskiä ja vaikuttaa suoraan herkkyyteen PARP-estäjille ja platinapohjaiselle kemoterapialle.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 66 ATM-eksonia samanaikaisesti – tämä on ainoa tapa tunnistaa luotettavasti kaikki ATM-variantit, mukaan lukien suuret deleetiot ja syvällä intronissa sijaitsevat variantit, joita tavanomaisissa syöpäpaneeleissa aliarvioidaan järjestelmällisesti.
ATM-geenin aiheuttama perinnöllinen syöpäriski
ATM-geeni (ataxia-telangiectasia mutated) koodaa seriini-treoniiniproteiinikinaasia, joka on DNA:n kaksoisjuostekatkosten vasteen pääsäätelijä. Bialleliset ATM-patogeeniset variantit aiheuttavat ataksia-telangiektasiaa (AT), harvinaista vakavaa monisysteemistä sairautta, jolle ovat ominaisia pikkuaivojen ataksia, silmänliikkeiden apraksia, immuunipuutos, telangiektasiat ja huomattavasti kohonnut syöpäriski – erityisesti imukudoksen pahanlaatuiset kasvaimet. Heterozygoottiset ATM-patogeeniset variantit, joita esiintyy noin 0,5–1 %:lla väestöstä, liittyvät lievempään mutta kliinisesti merkittävään syöpäalttius-oireyhtymään, joka on karakterisoitu tarkasti vasta viime vuosina laajamittaisten väestögenomiikkatutkimusten avulla.
ATM-geenin heterotsygoottisilla kantajilla on arvioitu 20–25 prosentin elinikäinen rintasyöpäriski (verrattuna väestön keskiarvoon, joka on noin 12 prosenttia), ja NCCN-ohjeissa suositellaan tehostettua rintasyövän seurantaa (vuosittainen rintojen magneettikuvaus 40 vuoden iästä alkaen) näille henkilöille. ATM-kantajilla on myös kohonnut riski sairastua haimasyöpään (noin 5–7 % elinaikana, kun väestön keskiarvo on noin 1,5 %), miehillä kohonnut riski sairastua eturauhassyöpään (erityisesti korkea-asteiseen tautiin) sekä mahdollisesti kohonnut riski sairastua paksusuoli- ja munasarjasyöpään. ATM on nyt sisällytetty ACMG SF v3.2 -luetteloon toissijaisista löydöksistä, mikä heijastaa konsensusta siitä, että tunnistetuille kantajille on perusteltua tehdä toimivia muutoksia kliiniseen hoitoon.
ATM:llä on suora merkitys myös syöpäriskin luokittelun ulkopuolella – se on teranostinen biomarkkeri. ATM-puutteellisilla potilailla esiintyvät syövät voivat olla erityisen herkkiä lääkeaineille, jotka hyödyntävät DNA:n korjausreittien puutteita: PARP-estäjille, platinapohjaiselle kemoterapialle sekä ATM-kinaasiestäjille, joita tutkitaan parhaillaan kliinisissä tutkimuksissa. Sukusolujen ATM-tila vaikuttaa nykyään syövän hoitopäätöksiin — olaparibi on FDA:n hyväksymä metastaattisen kastrointiresistentin eturauhassyövän hoitoon potilailla, joilla on ATM-patogeenisiä variantteja, ja kliinisissä tutkimuksissa arvioidaan PARP-estäjäyhdistelmiä haimasyövän hoitoon ATM-kantajilla. Tämä kaksoisrooli — perinnöllisen syöpäriskin hallinta ja hoidon valinta — tekee ATM:n täydellisestä genotyyppauksesta yhä kiireellisemmän.
ATM on 66 eksonia sisältävä geeni, josta on dokumentoitu yli 3 000 varianttia. Monet raportoidut ATM-variantit ovat merkitykseltään epäselviä – niiden oikea tulkinta edellyttää geenin täydellistä sekvensointia ja sen toiminnallisen kontekstin tuntemusta.
ATM-geenissä on 66 eksonia ja tuhansia variaatioita – rajoitetut testipaneelit jättävät usein harvinaiset patogeeniset alleelit havaitsematta
ATM-geeni on yksi suurimmista syöpää altistavista geeneistä; se on pituudeltaan 150 kilotavua ja sisältää 66 koodaavaa eksonia. ATM-geenistä on dokumentoitu yli 3 000 sekvenssimuunnosta, joista suurin osa on merkitykseltään epäselviä missense-muunnoksia. Trunkaatiomuunnokset (nonsense-, frameshift- ja olennaiset splays-kohdat) luokitellaan tunnistettaessa ehdottomasti patogeenisiksi. Suuret ATM-deleetiot – jotka ovat havaittavissa vain kopioiden lukumäärän vaihteluiden analyysillä – muodostavat merkittävän osan ATM-patogeenisista variantteista perinnöllisissä syöpätapauksissa, eikä niitä voida luotettavasti havaita tavanomaisella paneelisequensoinnilla. Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 66 eksonia samanaikaisella kopioiden lukumäärän vaihteluiden analyysillä, mikä selvittää ATM-varianttien koko kirjon.
Sukusolujen ATM-tila määrää nyt PARP-estäjän käyttökelpoisuuden eturauhassyövän hoidossa
FDA on hyväksynyt olaparibin (Lynparza) ja rucaparibin (Rubraca) metastaattisen kastrointiresistentin eturauhassyövän hoitoon potilaille, joilla on patogeenisiä ATM-muutoksia sekä BRCA1/2-muutoksia. Tämän hyväksynnän ansiosta ATM-geenin perimämuutosten testaus mahdollistaa suoraan hoidon aloittamisen eturauhassyöpäpotilailla – potilas, jonka täydellisessä geenianalyysissä todetaan ATM-positiivisuus, voi olla oikeutettu PARP-estäjän monoterapiaan kemoterapian sijaan. Kliinisissä tutkimuksissa arvioidaan myös PARP-estäjiä erityisesti sukusolujen ATM-positiivisessa haimasyövässä (tilanne, jossa on hyvin vähän hyväksyttyjä hoitovaihtoehtoja). Tarkka somaattisen ja sukusolujen tilan määrittäminen sekä hoidon soveltuvuuden arviointi edellyttävät täydellistä ATM-genotyyppausta – ei osittaista paneelia, josta voi jäädä huomaamatta harvinaisia katkaisevia tai rakenteellisia muunnoksia.
Koko DNA:si (ei vain osa siitä)
Perinteisissä geenitesteissä tutkitaan vain rajattuja geenijoukkoja, jolloin suurin osa genomistasi jää huomioimatta. Me sekvensoimme koko genomisi – jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen.
Kattavat analyysit ja erikoistuneet raportit
Helppolukuinen ja sisältää vastauksia, joiden pohjalta sinä ja lääkärisi voitte toimia. Ei tulkittavaa asiakirjaa – yli 200 kliinistä raporttia, luokiteltuina aihepiireittäin.
Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta
DNA:si ei muutu, mutta genomiikan kehitys etenee vauhdilla. Joka kuukausi löydetään uusia yhteyksiä muunnosten ja sairauksien välillä. Vahvistamme nämä havainnot ja päivitämme raporttisi automaattisesti. Testisi arvo kasvaa vuosi vuodelta.
Tulokset, joita lääkärit saavuttavat vaikeimmissakin tapauksissaan.
Neljäkymmentä vuotta epävarmuutta. Yksi testi.
Potilas oli viettänyt vuosikymmeniä Ison-Britannian terveydenhuoltojärjestelmässä ilman diagnoosia. Glasgow’n Queen Elizabeth University Hospitalin NHS-hoitotiimit hyväksyivät Dante-tietokannan avulla Noonanin oireyhtymän ja RUNX1-geenin leukemiaan liittyvän muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. 40 vuoden jälkeen he saivat vihdoin vastauksen.
Koko tekstin lukeminen antaa kattavan kuvan.
Potilas hakeutui Danten vastaanotolle selvittämään jaksottaista halvausoireilua. Koko genomin sekvensointi paljasti samanaikaisen perinnöllisen sydänsairauden – Brugadan oireyhtymän –, jonka potilaan oma lääkäri vahvisti EKG-tutkimuksella. Tulos selitti myös erään perheenjäsenen aiemmin selittämättömän sydäntaustan. Yksi testi. Kaikki vastaukset siinä.
Sekvensoitu vuonna 2019. Tiedot käsiteltiin vuonna 2021.
Jennifer sekvensoitti genominsa Danten avulla kaksi vuotta ennen rintasyövän diagnoosia. Kun hoito alkoi, Danten farmakogenomiikkatiedot osoittivat, että hänelle määrätty kemoterapia aiheuttaisi vakavia haittavaikutuksia. Hänen lääkärinsä valitsi vaihtoehtoisen hoidon – ja hän sai tehokasta hoitoa heti alusta alkaen.
Jokaiseen geneettiseen kysymykseen ansaitsee saada kattavan vastauksen.
Etsitpä sitten vastauksia tänään tai huolehditpa terveydestäsi tulevaisuutta varten, koko genomin kattava sekvensointi on ainoa oikea lähtökohta.
Se kulkee suvussasi. Nyt voit selvittää, kulkeeko se geeneissäsi.
Genomissasi on perinnöllisiä muunnoksia, jotka liittyvät esimerkiksi sydän-, syöpä- ja neurologisiin sairauksiin. Analysoimme ne kaikki – ja annamme tuloksille merkityksen kliinisen asiantuntemuksemme avulla.
Lisätietoja →Kun perinteiset laboratoriotestit osoittavat, että olet kunnossa. Mutta tiedät, että et ole.
Tavanomaisissa diagnostisissa testeissä etsitään ennalta määriteltyjä vastauksia. Me sekvensoimme koko DNA:si — myös ne osat, joita mikään testi ei ole suunniteltu tutkimaan. Jos vastaus löytyy genomistasi, autamme sinua löytämään sen.
Lisätietoja →Diagnoosisi saattaa olla oikea. Hoitosuunnitelmasi saattaa olla puutteellinen.
Geenisi määräävät, mitkä hoidot todennäköisesti tehoavat – ja mitkä eivät. Annamme lääkärillesi työkalut ja tiedot, joiden avulla hän voi laatia sinulle sopivan hoitosuunnitelman.
Lisätietoja →Haluat tietää sen, ennen kuin jokin pakottaa sinut ottamaan asian esille.
Jotkut eivät odota diagnoosia tai sukututkimuksen tuloksia ryhtyäkseen toimeen. Koko genomin sekvensointi antaa sinulle täydellisen kuvan perimästäsi jo nyt – joten sinä ja lääkärisi voitte tehdä tietoon perustuvia päätöksiä ennen kuin tilanne muuttuu kiireelliseksi.
Lisätietoja →Olet jo tehnyt DNA-testin. Tässä on asioita, joita se ei pystynyt kertomaan sinulle.
Useimmat kuluttajille tarkoitetut DNA-testit analysoivat alle 0,1 % genomistasi. Me analysoimme sen kokonaan.
Lisätietoja →Kliinisen tason tulokset. Yksityishenkilöiden suosima, lääkäreiden luottama ratkaisu vaikeimpiin tapauksiin.
Dante Genome Test auttoi erään brittiläisen kansallisen akuuttihoidon sairaalan asiantuntijoita tunnistamaan Noonanin oireyhtymän sekä harvinaisen, leukemiaan liittyvän geneettisen muunnoksen, jota ei ollut aiemmin havaittu. Tämä tulos muutti potilaan hoitoa.
Hyväksytty ja julkaistu
Usein kysyttyjä kysymyksiä koko genomin sekvensoinnista.
Mitä eroa on koko genomin sekvensoinnilla ja kohdennetulla geenitestillä?
Kohdennetut geenitestit – mukaan lukien tavanomaiset perinnöllisen syövän testipaneelit – tutkivat ennalta määriteltyä luetteloa tunnettuja variaatioita tietyssä geenijoukossa. Ne on suunniteltu löytämään juuri ne muutokset, joita niiden tiedetään etsivän. Koko genomin sekvensointi kartoittaa koko genomin: kaikki 6 miljardia emäsparia, jokaisen geenin ja jokaisen geenien välisen alueen. JAMA Oncology -lehdessä julkaistu Mayo Clinicin tutkimus osoitti, että tavanomaisissa testausohjeissa jäi huomaamatta yli puolet potilaista, joilla oli perinnöllisiä syöpämutaatioita. Genome Testillä ei ole kiinteää luetteloa.
Mitä saan, kun tulokset ovat valmiit?
Dante Genome -palvelu tarjoaa yli 200 lääkärikäyttöön soveltuvaa raporttia, jotka on ryhmitelty kliinisten luokkien mukaan – perinnöllinen syöpä, sydänsairaudet, harvinaissairaudet, farmakogenomiikka, kantajastatus ja paljon muuta. Raportit toimitetaan suojattuun Genome Manager -palveluun, ja ne on muotoiltu suoraan kliiniseen käyttöön. Genomitietosi säilytetään pysyvästi ja analysoidaan uudelleen automaattisesti tieteen kehittyessä.
Mitä tapahtuu, jos löydetään kliinisesti merkittävä muunnos?
Jos havaitaan patogeeninen tai todennäköisesti patogeeninen variantti, se merkitään selvästi lääkärille tarkoitetussa raportissa, jossa esitetään kliininen tausta, julkaistu tutkimustieto sekä suositellut jatkotoimenpiteet. Suosittelemme, että kerrot kaikista kliinisesti merkittävistä löydöksistä lääkärillesi tai geenineuvojalle, joka voi opastaa sinua seurantaa, riskien vähentämistä tai perheenjäsenten peräkkäistestausta koskevissa päätöksissä.
Miten tämä eroaa kuluttajille suunnatuista DNA-testeistä, kuten 23andMe tai AncestryDNA?
Kuluttajille suunnatuissa DNA-testeissä käytetään genotyyppauspiirejä, jotka lukevat alle 0,1 % genominne sisällöstä – eli vain pienen, etukäteen valitun joukon yleisiä variantteja. Ne on optimoitu sukututkimukseen ja väestötason ominaisuuksien määrittämiseen, eivät kliinisiin geneettisiin löydöksiin. Dante-genomitesti sekvensoivat 100 % genomistasi 30-kertaisella peitolla, mikä on sama standardi kuin kliinisissä diagnostisissa ympäristöissä. Näitä kahta testiä ei voi verrata toisiinsa laajuuden, menetelmien tai kliinisen hyödyn suhteen.
Kuinka kauan tulosten saaminen kestää, ja miten ne toimitetaan?
Näytteenottosarja lähetetään 48 tunnin kuluessa tilauksesta. Kun näyte saapuu CLIA-sertifioituun laboratorioomme, sekvensointi ja analysointi kestävät 6–8 viikkoa. Tulokset toimitetaan turvallisesti Genome Manager -palveluun, jossa voit tarkastella raportteja, jakaa ne lääkärillesi ja saada automaattisia päivityksiä, kun uusia havaintoja vahvistetaan genomin perusteella.
Teemme yhteistyötä potilasjärjestöjen kanssa ympäri maailmaa.
Dante Labs tekee yhteistyötä kaiken kokoisien potilasjärjestöjen kanssa – perinnöllisen syöpäriskin (ATM ) sekä muiden sairauksien, niin harvinaisten kuin yleistenkin, osalta. Tuemme järjestöjä kaikissa maissa, mukaan lukien virtuaaliset potilasjärjestöt.
Voimme tarjota räätälöityjä raportteja, ryhmäalennuksia ja juuri jäsenillenne sovitettuja paketteja. Ottakaa yhteyttä lomakkeen kautta, niin otamme teihin yhteyttä kahden työpäivän kuluessa.
- Jäsenillesi räätälöidyt genomi-raportit
- Ryhmäalennukset ja räätälöidyt paketit
- Mikä tahansa maa – mukaan lukien virtuaaliset ryhmät
- Käsiteltävät harvinaiset ja yleiset sairaudet
Viesti vastaanotettu.
Otamme sinuun yhteyttä kahden työpäivän kuluessa. Jos haluat ottaa suoraan yhteyttä: hello@dantelabs.com
Yksi testi.
Vastauksia koko elämän ajaksi.
Yksi paketti, joka toimitetaan kotiisi. Koko genomisi sekvensoidaan diagnostisissa päätöksissä käytetyn kliinisen standardin mukaisesti. Yli 200 lääkärille tarkoitettua raporttia toimitetaan Genome Manager -palveluun 6–8 viikon kuluessa – ne ovat pysyviä ja päivitetään tieteen kehittyessä.
Lähetetään 48 tunnin kuluessa · Tulokset 6–8 viikon kuluttua
