Γονίδιο
MAN1C1
mannosidase alpha class 1C member 1
- HGNC 19080↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000117643↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 57134↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 1p36.11
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 1: 25.616.791–25.784.450 (GRCh38)
- Εξόνια
- 12 έξώνια σε 167,7 kb
- Πρωτεΐνη
- 630 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- HMIC
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000374332.9NM_020379.4
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/man1c1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το MAN1C1, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Καμία αναφορά Genome Test δεν διαβάζει ακόμα το MAN1C1. Η εξέταση αλληλουχεί ολόκληρο το γονιδίωμά σας, άρα τα δεδομένα σας το περιλαμβάνουν ούτως ή άλλως.
Πώς είναι διαταγμένο το MAN1C1
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 3,6 kb από τα 167,7 kb του γονιδίου· 1.893 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχιση MAN1C1
5Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι το MAN1C1 να αλληλουχηθεί με σύντομες αναγνώσεις, σε κλίμακα από 0 έως 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of MAN1C1's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of MAN1C1's exons in each kind of hard region
- ΧαρτογραφησιμότηταΤμήματα όπου αναγνώσεις των 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι εσφαλμένη. Βάρος 35%.0%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παράλογοι και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή περισσότερο. Βάρος 30%.0%
- ΕπαναλήψειςΔιαδοχικές επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες οι αναγνώσεις γλιστρούν και ενδέχεται να μην τις καλύπτουν. Βάρος 15%.3,6%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει ελλιπώς. Βάρος 10%.49%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στη συναρμολόγηση της αναφοράς εκεί κοντά, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία να ευθυγραμμιστούν οι αναγνώσεις. Βάρος 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredΚάθε μπάρα είναι το μερίδιο των εξονικών βάσεων του MAN1C1 που βρίσκονται σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Η βαθμολογία τα σταθμίζει ανάλογα με το πόσο κοστίζει το καθένα σε μια κλήση με σύντομες αναγνώσεις: 0 όταν καμία βάση δεν ανήκει σε καμία, 100 όταν κάθε βάση ανήκει σε όλες.
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο MAN1C1: mannosidase alpha class 1C member 1. Ανάκτηση 18 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/man1c1
Dante Labs. Γονίδιο MAN1C1: mannosidase alpha class 1C member 1 [Internet]. [ανακτήθηκε 18 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/man1c1
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες