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Gen

PPP1R11

protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 11

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
6p22.1
Koordinaten
Chromosom 6: 30.067.198–30.070.333 (GRCh38)
Exons
3 Exons über 3,1 kb
Protein
126 Aminosäuren
Auch bekannt als
HCGV, Tctex5, HCG-V, CFAP255
Frühere Symbole
TCTE5
MANE-Select-Transkript
ENST00000376772.8NM_021959.3
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet PPP1R11 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von PPP1R11

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 6, mit einer Klammer, an der PPP1R11 liegt. PPP1R11 und 20 Gene in der Nähe auf Chromosom 6, von 29.568.766 bis 30.568.765.Chromosom 66p22.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2729,6 Mb29,8 Mb30 Mb30,2 Mb30,4 MbGABBR1: 29.552.554–29.633.976, Minus-StrangGABBR1OR2H2: 29.585.121–29.590.500, Plus-StrangOR2H2MOG: 29.656.598–29.674.431, Plus-StrangMOGZFP57: 29.672.482–29.681.174, Minus-StrangZFP57HLA-F: 29.722.738–29.740.358, Plus-StrangHLA-FHLA-G: 29.826.967–29.831.130, Plus-StrangHLA-GHLA-A: 29.941.260–29.949.606, Plus-StrangHLA-APOLR1H: 30.058.899–30.064.909, Plus-StrangPOLR1HPPP1R11: 30.067.198–30.070.333, Plus-StrangPPP1R11RNF39: 30.070.266–30.075.849, Minus-StrangRNF39TRIM31: 30.102.886–30.113.126, Minus-StrangTRIM31TRIM40: 30.136.028–30.151.592, Plus-StrangTRIM40TRIM10: 30.151.943–30.161.288, Minus-StrangTRIM10TRIM15: 30.163.194–30.173.160, Plus-StrangTRIM15TRIM26: 30.184.446–30.214.158, Minus-StrangTRIM26TRIM39: 30.325.880–30.344.265, Plus-StrangTRIM39TRIM39-RPP21: 30.328.907–30.346.854, Plus-StrangTRIM39-RPP21RPP21: 30.345.125–30.346.884, Plus-StrangRPP21HLA-E: 30.489.495–30.494.205, Plus-StrangHLA-EGNL1: 30.541.212–30.556.603, Minus-StrangGNL1PRR3: 30.556.704–30.563.723, Plus-StrangPRR3Diagramm von PPP1R11: 3 Exons auf dem Plus-Strang von Chromosom 6Exon 1: 30.067.198–30.067.479, 282 BasenExon 2: 30.068.590–30.068.698, 109 BasenExon 3: 30.069.104–30.070.333, 1.230 Basen1235′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,6 kb der 3,1 kb des Gens aus; 381 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von PPP1R11

25Mittel

Wie schwer sich PPP1R11 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Einige Exons von PPP1R11 liegen in Bereichen, in denen Short Reads eine Veränderung übersehen oder falsch zuordnen können.

Dazu kommt der Anteil der Exons von PPP1R11 in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability0,1 %
  • Homologie82 %
  • Wiederholungen0 %
  • GC-Gehalt0 %
  • Referenzabdeckung0 %

Ein Dante-Labs-Score aus unserer eigenen Forschung, basierend auf den Karten schwer sequenzierbarer Regionen aus Genome in a Bottle des NIST.So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). PPP1R11-Gen: protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 11. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/ppp1r11

Vancouver

Dante Labs. PPP1R11-Gen: protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 11 [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/ppp1r11

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