Gen

PPEF2

protein phosphatase with EF-hand domain 2

Zytogenetische Lage: 4q21.1
Koordinaten: Chromosom 4: 75.859.867–75.902.452 (GRCh38)
Exons: 17 Exons über 42,6 kb
Protein: 753 Aminosäuren
Auch bekannt als: PPP7CB
MANE-Select-Transkript: ENST00000286719.12NM_006239.3
Locus-Typ: Proteinkodierend

Sehr hoch
Zuversichtlich
Niedrig
Sehr niedrig

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Aufbau von PPEF2

Kodierende Sequenz
Nicht translatierte Region
Intron
Transkriptionsrichtung
Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 3,3 kb der 42,6 kb des Gens aus; 2.262 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von PPEF2

5Leicht

Wie schwer sich PPEF2 mit Short Reads sequenzieren lässt, von 100

Nahezu alle Exons von PPEF2 liegen dort, wo Short Reads sauber kartiert werden können.

Was hinzukommt: der Anteil der Exons von PPEF2 in jeder Art schwieriger Region

Mappability3,3 %
Homologie6,4 %
Wiederholungen1 %
GC-Gehalt15 %
Referenzabdeckung0 %

Ein Score von Dante Labs aus eigener Forschung, basierend auf den Genome-in-a-Bottle-Karten des NIST für schwer sequenzierbare Regionen.So wird bewertet

Externe Links

Gendatensätze

Transkript

Protein

Varianten

Klinik

Herkunft der Daten

HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

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APA

Dante Labs. (o. J.). PPEF2-Gen: protein phosphatase with EF-hand domain 2. Abgerufen am 18. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/ppef2

Vancouver

Dante Labs. PPEF2-Gen: protein phosphatase with EF-hand domain 2 [Internet]. [zitiert am 18. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/ppef2

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