Gen

PCA3

prostate cancer associated 3

Zytogenetische Lage: 9q21.2
Koordinaten: Chromosom 9: 76.764.438–76.787.569 (GRCh38)
Exons: 4 Exons über 23,1 kb
Auch bekannt als: DD3, NCRNA00019, PCAT3, PRUNE2-AS1
MANE-Select-Transkript: ENST00000412654.2NR_132312.2
Locus-Typ: Lange nichtkodierende RNA (lncRNA)

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Aufbau von PCA3

Nicht translatierte Region
Intron
Transkriptionsrichtung
Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 3,9 kb der 23,1 kb des Gens aus.

Sequenzierung von PCA3

3Leicht

Wie schwer sich PCA3 mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Nahezu alle Exons von PCA3 liegen in Bereichen, in denen Short Reads sauber zugeordnet werden können.

Was hinzukommt: der Anteil der Exons von PCA3 in jeder Art schwieriger Region

Mappability0 %
Homologie0 %
Gemeinsam mit chrY0 %
Abdeckung der Referenz0 %
Wiederholungen6,8 %
GC-Gehalt5,7 %

Ein Score von Dante Labs aus eigener Forschung, basierend auf den Karten schwer zu sequenzierender Regionen von NIST (Genome in a Bottle).So wird bewertet

Externe Links

Gendatensätze

Transkript

Varianten

Klinik

Herkunft der Daten

HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

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APA

Dante Labs. (o. J.). PCA3-Gen: prostate cancer associated 3. Abgerufen am 21. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/pca3

Vancouver

Dante Labs. PCA3-Gen: prostate cancer associated 3 [Internet]. [zitiert am 21. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/pca3

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