Ein Test, lebenslang aktuell: Wie die Genomforschung von Jahr zu Jahr besser wird

Wenn Sie eine Blutuntersuchung durchführen lassen, ist das Ergebnis eine Momentaufnahme – in diesem Augenblick zutreffend, ein Jahr später jedoch irrelevant. Wenn Sie Ihr gesamtes Genom sequenzieren lassen, ist das Ergebnis dauerhaft. Ihre DNA-Sequenz ändert sich nicht. Die Wissenschaft, die sie interpretiert, tut dies jedoch – und genau das unterscheidet die Gesamtgenomsequenzierung grundlegend von jedem anderen Gesundheitstest.

Ihre Daten stehen fest. Die Wissenschaft nicht.

Jeden Monat veröffentlichen Forscher weltweit neue Erkenntnisse, die genetische Varianten mit Krankheiten, dem Ansprechen auf Medikamente und Gesundheitszuständen in Verbindung bringen. Die ClinVar-Datenbank – das wichtigste öffentliche Archiv für Zusammenhänge zwischen Varianten und Krankheiten – wird jedes Jahr um Tausende neuer Einträge erweitert. Dieses Tempo nimmt zu, da immer umfangreichere Genomdatensätze für Analysen auf Populationsebene zur Verfügung stehen.

Das bedeutet, dass eine Variante in Ihrem Genom, die heute als „Variante mit unklarer Bedeutung“ (VUS) eingestuft wird, im nächsten Jahr möglicherweise als pathogen neu eingestuft wird – sobald sich aus klinischen Studien genügend Belege angesammelt haben. Umgekehrt könnte eine Variante, die zunächst bedenklich erschien, herabgestuft werden, sobald mehr Bevölkerungsdaten vorliegen.

Die entscheidende Frage lautet: Führt Ihr Testanbieter bei solchen Aktualisierungen eine erneute Analyse Ihrer Daten durch?

Warum die meisten Tests in der Zeit stehen geblieben sind

Genotypisierungstests für Verbraucher – wie sie von 23andMe, AncestryDNA und ähnlichen Anbietern angeboten werden – lesen einen vorab ausgewählten Satz genetischer Positionen auf einem Chip aus. Der Bericht, den Sie erhalten, spiegelt den Wissensstand wider, der zum Zeitpunkt der Entwicklung des Chips über diese spezifischen Positionen vorlag. Wenn die Wissenschaft etwas Neues über eine Variante entdeckt, die nicht auf dem Chip war, oder eine Variante neu klassifiziert, die darauf war, werden Ihre Ergebnisse nicht aktualisiert – weil die zugrunde liegenden Daten unvollständig sind.

Selbst manche klinischen Tests weisen diese Einschränkung auf. Bei gezielten Genpanels werden nur die Gene untersucht, die in dem Panel enthalten sind. Sollte die zukünftige Forschung eine klinisch relevante Variante in einem Gen identifizieren, das nicht in Ihrem Panel enthalten war, bräuchten Sie einen neuen Test, um diese zu erkennen.

So funktioniert die erneute Analyse des gesamten Genoms

Bei der Gesamtgenomsequenzierung wird jede Position Ihres Genoms gelesen – etwa 6,4 Milliarden Basenpaare. Das bedeutet, dass Ihre Datendatei vom ersten Tag an vollständig ist. Nichts wurde ausgelassen. Es muss nichts nachträglich erhoben werden.

Wenn neue Zusammenhänge zwischen Varianten und Krankheiten veröffentlicht und klinisch validiert werden, können die Rohdaten Ihrer ursprünglichen Sequenzierung anhand aktualisierter Datenbanken erneut analysiert werden. So können neue klinisch relevante Befunde zutage treten, die zum Zeitpunkt Ihrer ursprünglichen Untersuchung noch nicht bekannt waren – ohne dass eine Blutentnahme, ein neues Testkit oder ein neuer Test erforderlich ist.

Bei Dante Labs erfolgt diese erneute Analyse automatisch über die Genome Manager-Plattform. Wenn wir im Rahmen unseres klinischen Überprüfungsprozesses neue Zusammenhänge zwischen Varianten und Krankheiten validieren, werden Ihre Berichte aktualisiert, um den neuesten wissenschaftlichen Erkenntnissen Rechnung zu tragen. Sie erhalten eine Benachrichtigung über alle klinisch relevanten Änderungen.

Wie das in der Praxis aussieht

Betrachten wir ein Beispiel aus der Praxis: In den Jahren, seitdem ClinVar damit begonnen hat, die Klassifizierung von Varianten zu erfassen, wurden etwa 7 % aller klassifizierten Varianten mindestens einmal neu eingestuft, als neue Erkenntnisse vorlagen. Einige VUS-Varianten wurden als pathogen eingestuft. Einige wahrscheinlich pathogene Varianten wurden herabgestuft. Diese Neuklassifizierungen haben direkte klinische Konsequenzen – sie beeinflussen, ob ein Screening empfohlen wird, welche Medikamente geeignet sind und welche Familienmitglieder getestet werden sollten.

Bei einem vollständigen Genomdatensatz werden diese Neuklassifizierungen automatisch auf Ihre Berichte angewendet. Bei einem unvollständigen Datensatz – also allem, was weniger als eine Gesamtgenomsequenzierung umfasst – ist dies möglicherweise nicht der Fall, entweder weil die betreffende Variante nicht getestet wurde oder weil der Anbieter keine Neuanalyse anbietet.

Die Wirtschaftlichkeit einer einmaligen Sequenzierung

Es gibt auch ein praktisches Argument. Die Sequenzierung des gesamten Genoms kostet nur noch einen Bruchteil dessen, was sie vor fünf Jahren gekostet hat – und der Trend geht weiter nach unten. Aber bei der Kalkulation geht es nicht nur um den heutigen Preis. Es geht um die Gesamtkosten der genetischen Informationen über die gesamte Lebensdauer.

Wenn Sie heute einen bestimmten Panel-Test und nächstes Jahr einen anderen Panel-Test durchführen lassen – weil sich Ihre klinische Fragestellung geändert hat oder weil dem Panel neue Gene hinzugefügt wurden –, zahlen Sie doppelt für unvollständige Einblicke in dasselbe Genom. Bei der Gesamtgenomsequenzierung wird alles in einem Durchgang erfasst. Jede zukünftige Frage wird anhand desselben Datensatzes beantwortet.

Das Fazit

Ihr Genom ist der einzige Gesundheitstest, der nach der Durchführung an Wert gewinnt. Nicht, weil sich Ihre DNA verändert – das tut sie nicht. Sondern weil die Wissenschaft, die sie entschlüsselt, sich ständig weiterentwickelt. Die einzige Voraussetzung ist, dass bei Ihrem ursprünglichen Test alles erfasst wurde. Genau das leistet die Gesamtgenomsequenzierung.

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