Gen
HLA-DRA
major histocompatibility complex, class II, DR alpha
- HGNC 4947↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000204287↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 3122↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 6p21.32
- Koordinater
- Kromosom 6: 32.439.887–32.445.046 (GRCh38)
- Exoner
- 5 exoner fordelt over 5,2 kb
- Protein
- 254 aminosyrer
- Tidligere symboler
- HLA-DRA1
- MANE Select-transkript
- ENST00000395388.7NM_019111.5
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hla-dra.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs HLA-DRA og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser HLA-DRA endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er HLA-DRA opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 1,2 kb af genets 5,2 kb; 765 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af HLA-DRA
0Let
Hvor svær HLA-DRA er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle HLA-DRAs exons ligger, hvor korte reads kan kortlægges tydeligt.
Det, der lægger oven i: andelen af HLA-DRAs exons i hver type svær region
- KortlægbarhedStrækninger, hvor 100 eller 250 bp reads ikke kan placeres entydigt, så et kald der kan mangle eller være forkert. Vægt 100 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vægt 60 %.0 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan alignes til. Vægt 50 %.0 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Vægt 30 %.0 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 20 %.0 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores detHver søjle er andelen af HLA-DRAs exon-baser i den pågældende type svær region. Én type kan alene gøre et gen svært, og hver ekstra type tilføjer mindre: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser er der, hvor reads ikke kan placeres entydigt.
Træk knyttet til HLA-DRA
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, HLA-DRA kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). HLA-DRA-genet: major histocompatibility complex, class II, DR alpha. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/hla-dra
Dante Labs. HLA-DRA-genet: major histocompatibility complex, class II, DR alpha [Internet]. [citeret 19. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/hla-dra
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger