Dante Omics AI har i samarbejde med Rockefeller University, Giunta Lab og et netværk af globale partnere udarbejdet det mest komplette og nøjagtige diploide referencegenom for RPE-1-cellelinjen – en af de mest udbredte standarder inden for komplekse cellemanipulationsforsøg.
Denne milepæl udgør en egentlig »kildekode« for forskere over hele verden og åbner op for en dybere indsigt i strukturel kompleksitet, genomisk stabilitet og CRISPR-baseret genteknologi.
Hvorfor det er vigtigt
RPE-1-linjen er en global standard inden for cellebiologi, kræftforskning og genomredigering. Indtil nu har dens genom imidlertid været ufuldstændigt, hvilket har medført, at vigtige områder har været uklare eller manglet.
Vores nye samling ændrer dette:
► Diploid fuldstændighed – både maternelle og paternelle haplotyper er kortlagt på tværs af kromosomerne.► Ultrahøj nøjagtighed – > 99,9999 % på flere kromosomer.► Fuld dækning af komplekse regioner – centromerer, gentagelser og strukturelt udfordrende DNA er nu kortlagt.► Integration på tværs af platforme – data fra Illumina-kortlæser, PacBio HiFi, Oxford Nanopore-langlæser og supplerende ressourcer.► Åben adgang – samlingen RPE1v1.1 er nu tilgængelig via NCBI og UCSC Genome Browser.
Et resultat af et godt samarbejde
Dette projekt blev kun muligt takket være den samlede ekspertise fra et globalt konsortium, der blandt andet bestod af:
Rockefeller UniversityGiunta LabSapienza Universitetet i RomUniversity of TennesseeTrieste Area Science ParkL’Aquila UniversitetDante Omics AI
Som Andrea Riposati, administrerende direktør for Dante Omics AI, forklarede: »Forestil dig at fejlfinde software uden dele af kildekoden. Med denne samling har forskerne endelig en komplet og præcis ’kildekode’ for RPE-1-celler – helt ned til de mest komplekse områder, som før var usynlige.«
Konsekvenser for videnskab og medicin
En ny standard inden for celleteknologi: CRISPR og andre redigeringsteknikker kan nu basere sig på en mere pålidelig reference.Dybere indsigt i DNA’s kompleksitet: centromerer og gentagelser, som tidligere var utilgængelige, kan nu undersøges.Større betydning på tværs af forskningsområder: fra onkologi til syntetisk biologi øger dette genom præcisionen i eksperimenter over hele verden.En model for fremtidige samlinger: metoden kan udvides til andre cellelinjer og arter.
Konklusion
Fra sløret til 4K: DNA er mere end bare en overskrift – det markerer et vendepunkt for genomforskningen. Ved at kombinere AI-accelereret multiomik med banebrydende sekventeringsteknologier har Dante Omics AI og dets partnere leveret den hidtil klareste genomiske blåkopi for en af biologiens vigtigste cellemodeller.
➡ Læs pressemeddelelsen på BusinessWire
Få nye indlæg fra Dante Labs
Indblik i genomforskning, produktnyheder og kliniske perspektiver — leveret direkte til din indbakke.
