Varianta
MSH2 E290X
NM_000251.3(MSH2):c.868G>T (p.Glu290Ter)
- p.Glu290Ter
- p.E290*
- rs587779190
- Klasifikace ClinVar
- Patogenní
- Stav hodnocení
- 3 hvězdiček z 4Posouzeno odborným panelem
- Naposledy hodnoceno
- 5. září 2013
- Odborný panel
- International Society for Gastrointestinal Hereditary Tumours (InSiGHT)
Data aktuální k verzi ClinVar 2026-10-12 · vydání dat Dante Labs 2026.10.16-c6eea6bfÚdaje naposledy změněny 16. října 2026
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Shrnutí
E290X je nonsense varianta v genu MSH2: vytváří předčasný signál zastavení, takže se předpokládá, že protein kódovaný genem bude zkrácen. ClinVar ji klasifikuje jako patogenní pro Lynch Syndrome (Posouzeno odborným panelem).
Klasifikace ClinVar
| Stav | Klasifikace | Stav hodnocení | Odeslání | Naposledy hodnoceno |
|---|---|---|---|---|
| Lynch SyndromeClinVar VCV000091235 (otevře se na nové kartě) | Patogenní | 3 hvězdiček z 4Posouzeno odborným panelem | 1 odeslání | 5. září 2013 |
Klasifikace, jak je ClinVar zaznamenává ve verzi 2026-10-12. ClinVar je aktualizuje, jakmile se posoudí důkazy.
Umístění v MSH2
E290X se nachází v exonu 5 z 16 v transkriptu MANE Select genu MSH2, NM_000251.3.
Molekulární podrobnosti
| Gen | MSH2 |
|---|---|
| Transkript | NM_000251.3MANE Select |
| Změna kódující DNA (HGVS c.) | c.868G>T |
| Změna proteinu (HGVS p.) | p.Glu290Terp.E290* |
| Předpokládaný důsledek | Nonsense (vznik stop kodonu)stop_gained (otevře se na nové kartě) |
| Předpokládaný dopad | Vysoký |
| Pozice (GRCh38) | chr2:47414344 G>T |
| Pozice (GRCh37) | chr2:47641483 G>T |
| ID dbSNP | rs587779190 (otevře se na nové kartě) |
| ID variace ClinVar | VCV000091235 (otevře se na nové kartě) |
| ID alely v ClinVar | 96710 |
| ID v registru alel ClinGen | CA022458 (otevře se na nové kartě) |
| Název v ClinVar | NM_000251.3(MSH2):c.868G>T (p.Glu290Ter) |
MSH2 E290X v jiných databázích
Zprávy, které tuto variantu zkoumají (1)
Tyto zprávy o stavech z Genome Test zahrnují E290X mezi variantami, které zkoumají.
| Zpráva | Stavy | Dědičnost |
|---|---|---|
| Lynch Syndrome | Lynch Syndrome | Autozomálně dominantní |
Další varianty v MSH2
- A123Vfs*51Patogenní3 hvězdiček z 4
- A230Lfs*16Patogenní3 hvězdiček z 4
- A230Sfs*2Patogenní3 hvězdiček z 4
- A266Qfs*8Patogenní3 hvězdiček z 4
- A370Qfs*3Patogenní3 hvězdiček z 4
- A398Gfs*19Patogenní3 hvězdiček z 4
- A499Cfs*14Patogenní3 hvězdiček z 4
- A500Pfs*26Patogenní3 hvězdiček z 4
- A573Pfs*17Patogenní3 hvězdiček z 4
- A636PPatogenní3 hvězdiček z 4
Omezení
Tato stránka popisuje veřejně dostupné informace o genetické variantě. Nejde o diagnózu a neříká nic o tom, zda vy nebo kdokoli jiný tuto variantu nese.
Klasifikace pocházejí z databáze ClinVar a mění se s tím, jak se posuzují nové důkazy. Klasifikace uvedená zde se proto může lišit od té, která je dnes v ClinVar, nebo od té, kterou uvádí laboratoř.
Celogenomové sekvenování krátkými čteními může některé varianty přehlédnout nebo chybně určit, zejména v opakujících se nebo vysoce podobných úsecích DNA a u velkých inzercí, delecí nebo přestaveb.
Máte-li otázky ohledně varianty ve svých výsledcích nebo v rodině, obraťte se na genetického poradce nebo na svého lékaře.
Zdroje a poděkování
- Klasifikace z ClinVar (verze 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Názvy onemocnění z Mondo Disease Ontology (verze 2026-10-06), použito na základě licence CC BY 4.0.
- Symboly a názvy genů z HUGO Gene Nomenclature Committee (verze 2026-10-16).
- Identifikátory alel z ClinGen Allele Registry (verze 2026-10-16-c4908f54).
- Identifikátory referenčních SNP z dbSNP (verze b157), National Center for Biotechnology Information.
- Vztahy mezi geny a onemocněními z Gene Curation Coalition, GenCC (verze 2026-10-16).
- Obtížné oblasti z Genome in a Bottle Consortium (verze v3.6).
- Transkripty z MANE (verze v1.5), NCBI a EMBL-EBI.
- Předpokládané důsledky z nástroje mehari (verze 0.11.0), s modely transkriptů z cdot.
- Vytvořeno z dat Dante Labs, verze 2026.10.16-c6eea6bf, ze dne 16. října 2026.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (16. října 2026). MSH2 E290X (c.868G>T, rs587779190) (verze 2026.10.16-c6eea6bf). Staženo 16. října 2026 z https://dantelabs.com/genes/msh2/variants/e290x
Dante Labs. MSH2 E290X (c.868G>T, rs587779190) [Internet]. Verze 2026.10.16-c6eea6bf. 16. října 2026 [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/genes/msh2/variants/e290x
Přečtěte si celý svůj genom
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů