Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

KCNK16

potassium two pore domain channel subfamily K member 16

Shrnutí

Cytogenetická poloha
6p21.2
Souřadnice
Chromozom 6: 39 316 171–39 322 702 (GRCh38)
Exony
5 exonů na 6,5 kb
Protein
294 aminokyselin
Další názvy
K2p16.1, TALK-1, TALK1
Transkript MANE Select
ENST00000437525.3NM_001135106.2
Typ lokusu
Kódující proteiny
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen KCNK16. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je KCNK16 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
Chromozom 6, se závorkou u KCNK16. KCNK16 a 7 genů poblíž na chromozomu 6, od 38 819 437 do 39 819 436.Chromozom 66p21.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2739 Mb39,2 Mb39,4 Mb39,6 Mb39,8 MbDNAH8: 38 715 311–39 030 792, řetězec dopřednémDNAH8GLP1R: 39 048 562–39 091 303, řetězec dopřednémGLP1RSAYSD1: 39 104 063–39 115 193, řetězec zpětnémSAYSD1KCNK5: 39 183 923–39 229 559, řetězec zpětnémKCNK5KCNK17: 39 298 998–39 314 461, řetězec zpětnémKCNK17KCNK16: 39 316 171–39 322 702, řetězec zpětnémKCNK16KIF6: 39 329 990–39 725 441, řetězec zpětnémKIF6DAAM2: 39 792 298–39 904 877, řetězec dopřednémDAAM2Schéma KCNK16: 5 exonů na zpětném řetězci chromozomu 6Exon 5: 39 316 171–39 316 442, 272 bázíExon 4: 39 316 782–39 316 947, 166 bázíExon 3: 39 317 786–39 317 952, 167 bázíExon 2: 39 319 019–39 319 133, 115 bázíExon 1: 39 322 328–39 322 702, 375 bází543215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 1,1 kb z 6,5 kb genu; 885 těchto bází kódují protein.

Sekvenování KCNK16

6Snadné

Jak obtížné je sekvenovat KCNK16 krátkými čteními, ze 100

Téměř všechny exony genu KCNK16 leží v místech, kde se krátká čtení spolehlivě mapují.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu KCNK16 v jednotlivých typech obtížných oblastí

  • Mapovatelnost0 %
  • Homologie0 %
  • Repetice9,1 %
  • Obsah GC50 %
  • Pokrytí referenčního genomu0 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, založené na mapách obtížně sekvenovatelných oblastí Genome in a Bottle od NIST.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen KCNK16: potassium two pore domain channel subfamily K member 16. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/kcnk16

Vancouver

Dante Labs. Gen KCNK16: potassium two pore domain channel subfamily K member 16 [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/kcnk16

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test