Varianta
GCK A454E
NM_000162.5(GCK):c.1361C>A (p.Ala454Glu)
- p.Ala454Glu
- p.A454E
- rs1057524900
- Klasifikace ClinVar
- Pravděpodobně patogenní
- Stav hodnocení
- 3 hvězdiček z 4Posouzeno odborným panelem
- Naposledy hodnoceno
- 31. března 2024
- Odborný panel
- ClinGen Monogenic Diabetes Variant Curation Expert Panel
Data aktuální k verzi ClinVar 2026-10-12 · vydání dat Dante Labs 2026.10.16-c6eea6bfÚdaje naposledy změněny 16. října 2026
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Shrnutí
A454E je missense varianta v genu GCK: mění jednu aminokyselinu v proteinu, který gen kóduje. ClinVar ji klasifikuje jako pravděpodobně patogenní pro monogenic diabetes (Posouzeno odborným panelem).
Klasifikace ClinVar
| Stav | Klasifikace | Stav hodnocení | Odeslání | Naposledy hodnoceno |
|---|---|---|---|---|
| monogenic diabetesClinVar VCV000393447 (otevře se na nové kartě) | Pravděpodobně patogenní | 3 hvězdiček z 4Posouzeno odborným panelem | 1 odeslání | 31. března 2024 |
Klasifikace, jak je ClinVar zaznamenává ve verzi 2026-10-12. ClinVar je aktualizuje, jakmile se posoudí důkazy.
Umístění v GCK
A454E se nachází v exonu 10 z 10 v transkriptu MANE Select genu GCK, NM_000162.5.
Molekulární podrobnosti
| Gen | GCK |
|---|---|
| Transkript | NM_000162.5MANE Select |
| Změna kódující DNA (HGVS c.) | c.1361C>A |
| Změna proteinu (HGVS p.) | p.Ala454Glup.A454E |
| Předpokládaný důsledek | Missensemissense_variant (otevře se na nové kartě) |
| Předpokládaný dopad | Střední |
| Pozice (GRCh38) | chr7:44145173 G>T |
| Pozice (GRCh37) | chr7:44184772 G>T |
| ID dbSNP | rs1057524900 (otevře se na nové kartě) |
| ID variace ClinVar | VCV000393447 (otevře se na nové kartě) |
| ID alely v ClinVar | 380266 |
| ID v registru alel ClinGen | CA16609264 (otevře se na nové kartě) |
| Název v ClinVar | NM_000162.5(GCK):c.1361C>A (p.Ala454Glu) |
GCK A454E v jiných databázích
Zprávy, které tuto variantu zkoumají (1)
Tyto zprávy o stavech z Genome Test zahrnují A454E mezi variantami, které zkoumají.
| Zpráva | Stavy | Dědičnost |
|---|---|---|
| Diabetes Mellitus | Diabetes Mellitus |
Další varianty v GCK
- A53VPatogenní3 hvězdiček z 4
- A188TPatogenní3 hvězdiček z 4
- A201SPatogenní3 hvězdiček z 4
- A208PPravděpodobně patogenní3 hvězdiček z 4
- A208TPatogenní3 hvězdiček z 4
- A208VPatogenní3 hvězdiček z 4
- A259SPravděpodobně patogenní3 hvězdiček z 4
- A259TPatogenní3 hvězdiček z 4
- A259VPatogenní3 hvězdiček z 4
- A378Cfs*80Pravděpodobně patogenní3 hvězdiček z 4
Omezení
Tato stránka popisuje veřejně dostupné informace o genetické variantě. Nejde o diagnózu a neříká nic o tom, zda vy nebo kdokoli jiný tuto variantu nese.
Klasifikace pocházejí z databáze ClinVar a mění se s tím, jak se posuzují nové důkazy. Klasifikace uvedená zde se proto může lišit od té, která je dnes v ClinVar, nebo od té, kterou uvádí laboratoř.
Celogenomové sekvenování krátkými čteními může některé varianty přehlédnout nebo chybně určit, zejména v opakujících se nebo vysoce podobných úsecích DNA a u velkých inzercí, delecí nebo přestaveb.
Máte-li otázky ohledně varianty ve svých výsledcích nebo v rodině, obraťte se na genetického poradce nebo na svého lékaře.
Zdroje a poděkování
- Klasifikace z ClinVar (verze 2026-10-12), National Center for Biotechnology Information.
- Názvy onemocnění z Mondo Disease Ontology (verze 2026-10-06), použito na základě licence CC BY 4.0.
- Symboly a názvy genů z HUGO Gene Nomenclature Committee (verze 2026-10-16).
- Identifikátory alel z ClinGen Allele Registry (verze 2026-10-16-c4908f54).
- Identifikátory referenčních SNP z dbSNP (verze b157), National Center for Biotechnology Information.
- Vztahy mezi geny a onemocněními z Gene Curation Coalition, GenCC (verze 2026-10-16).
- Obtížné oblasti z Genome in a Bottle Consortium (verze v3.6).
- Transkripty z MANE (verze v1.5), NCBI a EMBL-EBI.
- Předpokládané důsledky z nástroje mehari (verze 0.11.0), s modely transkriptů z cdot.
- Vytvořeno z dat Dante Labs, verze 2026.10.16-c6eea6bf, ze dne 16. října 2026.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (16. října 2026). GCK A454E (c.1361C>A, rs1057524900) (verze 2026.10.16-c6eea6bf). Staženo 16. října 2026 z https://dantelabs.com/genes/gck/variants/a454e
Dante Labs. GCK A454E (c.1361C>A, rs1057524900) [Internet]. Verze 2026.10.16-c6eea6bf. 16. října 2026 [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/genes/gck/variants/a454e
Přečtěte si celý svůj genom
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů