Gen
CSMD3
CUB and Sushi multiple domains 3
- HGNC 19291↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000164796↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 114788↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 8q23.3
- Souřadnice
- Chromozom 8: 112 222 928–113 436 939 (GRCh38)
- Exony
- 71 exonů na 1 214 kb
- Protein
- 3 707 aminokyselin
- Transkript MANE Select
- ENST00000297405.10NM_198123.2
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/csmd3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si CSMD3 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen CSMD3. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.
Jak je CSMD3 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 13,1 kb z 1 214 kb genu; 11 124 těchto bází kódují protein.
Sekvenování CSMD3
1Nízká
Jak obtížně se CSMD3 sekvenuje krátkými čteními, ze 100Každý sloupec udává podíl exonových bází CSMD3 v dané obtížné oblasti. Skóre je váží podle toho, jak moc každá z nich ztěžuje volání krátkými čteními: 0, pokud žádná báze není v žádné takové oblasti, 100, pokud je každá báze ve všech těchto oblastech.
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.0 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Váha 30 %.0 %
- RepeticeTandemové repetice a řetězce jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přesahovat. Váha 15 %.0,7 %
- Obsah GCÚseky s obsahem G a C pod 25 % nebo nad 65 %, které příprava knihovny pokrývá jen slabě. Váha 10 %.10 %
- Pokrytí referenceMezery v okolní referenční sestavě, kam se krátké čtené úseky nemají kam zarovnat. Váha 10 %.0 %
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen CSMD3: CUB and Sushi multiple domains 3. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/csmd3
Dante Labs. Gen CSMD3: CUB and Sushi multiple domains 3 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/csmd3
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů