Ген PMS2 — Синдромът на Линч, причинен от PMS2, се проявява по-рядко в сравнение с MLH1 или MSH2, но псевдогенът PMS2CL прави стандартните генетични тестове ненадеждни, а цялостното секвениране на генома (WGS) осигурява по-точна оценка.
Секвенирането на целия геном позволява оценка на гена PMS2 с по-голяма точност в сравнение с панелните тестове, като анализира сложния псевдогенен регион PMS2/PMS2CL — разграничавайки истинските патогенни варианти от псевдогенните последователности.
Ген PMS2 — синдром на Линч
PMS2 (хромозома 7p22.1) кодира протеин, участващ в репарацията на несъответствия в ДНК. Патогенните варианти на PMS2 причиняват синдром на Линч с по-ниска пенетрантност от MLH1/MSH2 — приблизително 15–20% риск от колоректален рак през целия живот и 15% риск от рак на ендометриума (спрямо 50–80% риск от колоректален рак при MLH1/MSH2). Въпреки по-ниската пенетрантност, PMS2-Линч все пак носи клинично значим риск от рак, изискващ засилено наблюдение.
PMS2 представлява уникално предизвикателство при тестването — псевдогенът PMS2CL има >98% идентичност на последователността с екзони 1–5 на PMS2, което води до неправилно отнасяне на вариантите при стандартните панели за секвениране от ново поколение. Вариантите в псевдогена могат да бъдат погрешно определени като патогенни варианти на PMS2 (фалшиви положителни резултати), или истинските варианти на PMS2 могат да бъдат отхвърлени като артефакти на псевдогена (фалшиви отрицателни резултати). Дългообхватната PCR, ген-специфичната амплификация или подходите за цялостния геном подобряват точността.
Лечението при PMS2-Lynch включва колоноскопия на всеки 1–2 години от 25- до 30-годишна възраст (по-късно в сравнение с MLH1/MSH2 поради по-ниска пенетрантност), наблюдение за рак на ендометриума при жени носителки и обмисляне на химиопревенция с аспирин. Имунотерапията при ракови заболявания, свързани с дефицит на PMS2, е високо ефективна — туморите с висока MSI/dMMR реагират драстично на пембролизумаб, независимо от това кой MMR ген е дефицитен.
Псевдогенът PMS2CL затруднява стандартните генетични тестове. Вариантите често се класифицират погрешно. Ако при панелното тестване сте получили резултати за PMS2 като „VUS“ или „патогенни“, се препоръчва потвърждение чрез цялостно секвениране на генома (WGS).
PMS2 е гена на Линч, който е най-труден за точно тестване поради наличието на псевдоген. Цялостното секвениране на генома (WGS) осигурява по-добра оценка чрез отчитане на пълния геномния контекст, като по този начин намалява броя на фалшивите положителни и отрицателни резултати, дължащи се на интерференция от псевдогена.
Интерференцията на псевдогени води до фалшиви положителни и отрицателни резултати при PMS2 — цялостното секвениране на генома (WGS) разрешава тази неяснота
Стандартните NGS панели често погрешно приписват варианти на гените PMS2 и PMS2CL. Пациент, на когото е съобщено, че има патогенен вариант на PMS2, всъщност може да има доброкачествен вариант на псевдогена (фалшив положителен резултат → ненужно наблюдение). И обратно, истински вариант на PMS2 може да бъде отсеян като шум от псевдогена (фалшив отрицателен резултат → пропусната диагноза за синдрома на Линч). WGS отчита пълния геномния контекст, като подобрява точността при определянето на вариантите.
Раковите заболявания от типа PMS2-Lynch реагират на имунотерапията — статутът dMMR позволява прилагането на пембролизумаб, независимо от конкретния MMR-ген
Туморите с дефицит на PMS2 са с висока степен на микросателитна нестабилност (MSI-high) и реагират на имунните инхибитори на контролните точки. Пембролизумаб е одобрен от FDA за всички видове рак с висока степен на MSI/dMMR, независимо от тъканта на произход. Потвърждаването на зародишния статус на PMS2 установява молекулярния механизъм, стоящ в основата на статуса MSI-high, и дава начало на каскадно семейно тестване.
Цялата ви ДНК (а не само част от нея)
При традиционните генетични тестове се изследват ограничени групи гени, като по този начин се пропускат голяма част от вашия геном. Ние секвенираме целия ви геном — всеки ген и всеки участък между гените.
Изчерпателна информация и специализирани доклади
Лесно за четене и с отговори, въз основа на които вие и вашият лекар можете да предприемете действия. Не е документ, който трябва да се тълкува — над 200 клинични доклада, подредени по категории.
Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година
Вашата ДНК не се променя, но науката за генома се развива с все по-бързи темпове. Всеки месец се откриват нови връзки между варианти и заболявания. Ние проверяваме тези открития и актуализираме вашите доклади автоматично. Вашият тест става все по-ценен с всяка изминала година.
Резултатите, които лекарите постигат при най-тежките си случаи.
Четиридесет години несигурност. Един тест.
Един пациент прекара десетилетия в британската здравна система без диагноза. Данните от Dante, приети от клиничните екипи на Националната здравна служба (NHS) в Университетската болница „Кралица Елизабет“ в Глазгоу, установиха синдрома на Нунан и вариант на гена RUNX1, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. След 40 години те най-накрая получиха отговор.
Цялостното прочитане дава цялостна представа.
Един пациент се обърна към Dante за изследване на периодична парализа. Анализът на пълния геном разкри съпътстващо наследствено сърдечно заболяване — синдром на Бругада — което лекарят му потвърди чрез ЕКГ. Резултатът обясни и неизяснената сърдечна анамнеза на един член от семейството. Един тест. Всички отговори в него.
Секвениран през 2019 г. Данните бяха обработени през 2021 г.
Дженифър направи секвениране на генома си с помощта на Dante две години преди да ѝ бъде поставена диагнозата рак на гърдата. Когато започна лечението, фармакогеномните данни на Dante показаха, че предписаната ѝ химиотерапия би довела до сериозни нежелани реакции. Лекарят ѝ избра алтернативно лечение — и тя започна ефективно лечение още от първия ден.
Всеки въпрос, свързан с генетиката, заслужава изчерпателен отговор.
Независимо дали днес търсите отговори или се грижите за здравето си за утре, пълното секвениране на целия ви геном е единствената отправна точка.
Това е наследствено във вашето семейство. Сега можете да разберете дали е заложено в гените ви.
Вашият геном съдържа наследствени варианти, свързани със заболявания като сърдечни, онкологични и неврологични. Ние ги анализираме всички — с необходимата клинична задълбоченост, за да придадем смисъл на резултатите.
Научете повече →Когато традиционните лабораторни изследвания показват, че сте добре. А вие знаете, че не е така.
Стандартните диагностични тестове търсят предварително определен набор от отговори. Ние секвенираме цялата ви ДНК — включително части, за които нито един тест не е създаден да проверява. Ако отговорът се крие във вашия геном, ние ще ви помогнем да го откриете.
Научете повече →Диагнозата Ви може да е правилна. Лечебният Ви план може да е непълен.
Вашите гени определят кои лечения имат най-голям шанс да дадат резултат — и кои не. Ние предоставяме на Вашия лекар инструментите и информацията, необходими за изготвянето на Вашия лечебен план.
Научете повече →Искаш да знаеш, преди нещо да те накара да зададеш този въпрос.
Някои хора не чакат диагноза или данни за семейната анамнеза, за да предприемат действия. Секвенирането на целия геном ви предоставя пълна генетична картина още сега — така че вие и вашият лекар можете да вземете информирани решения, преди ситуацията да стане спешна.
Научете повече →Вече сте направили ДНК-тест. Ето какво той не можа да ви разкрие.
Повечето ДНК тестове за потребители анализират по-малко от 0,1% от вашия геном. Ние анализираме целия.
Научете повече →Резултати от клинично ниво. Избирани от потребителите, на които лекарите се доверяват за най-сложните си случаи.
Тестът „Dante Genome“ помогна на специалистите в национална болница за спешна помощ във Великобритания да диагностицират синдрома на Нунан и рядък генетичен вариант, свързан с левкемия, който дотогава не беше открит. Този резултат промени медицинското лечение на пациента.
Акредитирано от и публикувано в
Често задавани въпроси относно секвенирането на целия геном.
Каква е разликата между секвениране на целия геном и целеви генетичен тест?
Целевите генетични тестове — включително стандартните панели за наследствен рак — проверяват предварително определен списък от известни варианти в конкретен набор от гени. Те са предназначени да откриват това, за което вече се знае, че трябва да се търси. Секвенирането на целия геном проучва целия ви геном: всички 6 милиарда базови двойки, всеки ген, всеки регион между гените. Проучване на Mayo Clinic, публикувано в JAMA Oncology, установи, че стандартните насоки за тестване пропускат повече от половината пациенти с наследствени ракови мутации. Genome Test няма фиксиран списък.
Какво ще получа, когато резултатите ми са готови?
Вашият Dante Genome предоставя над 200 готови за използване от лекари доклада, групирани по клинични категории — наследствен рак, сърдечни заболявания, редки болести, фармакогеномика, носителство и др. Докладите се предоставят във вашия защитен Genome Manager и са форматирани за директна клинична употреба. Вашите геномни данни се съхраняват трайно и се преанализират автоматично с напредъка на науката.
Какво се случва, ако бъде открит клинично значим вариант?
Ако бъде идентифициран патогенен или вероятно патогенен вариант, той ще бъде ясно отбелязан във вашия отчет за лекари, заедно с клиничния контекст, публикуваните научни данни и препоръчаните следващи стъпки. Ние препоръчваме да споделите всяка клинично значима находка с вашия лекар или генетичен консултант, който може да ви насочи при вземането на решения относно наблюдението, намаляването на риска или каскадното тестване на членовете на семейството.
В какво се различава това от потребителски ДНК-тест като 23andMe или AncestryDNA?
ДНК тестовете за потребители използват чипове за генотипиране, които отчитат по-малко от 0,1% от вашия геном — една малка предварително подбрана група от често срещани варианти. Те са оптимизирани за определяне на произхода и за характеристики на популационно ниво, а не за клинични генетични заключения. Тестът Dante Genome секвенира 100% от вашия геном с 30-кратно покритие, същият стандарт, използван в клиничната диагностика. Двата теста не са съпоставими по обхват, методология или клинична полезност.
Колко време отнема да се получат резултатите и как се предоставят те?
Вашият комплект за вземане на проба се изпраща в рамките на 48 часа след поръчката. След като пробата Ви пристигне в нашата лаборатория, сертифицирана по CLIA, секвенирането и анализа отнемат 6–8 седмици. Резултатите се изпращат по сигурен начин в Вашия Genome Manager, където можете да разглеждате докладите си, да ги споделяте с Вашия лекар и да получавате автоматични известия при потвърждаване на нови открития във връзка с Вашия геном.
Ние си сътрудничим с организации за защита на правата на пациентите по целия свят.
Dante Labs работи с групи за защита на правата на пациентите от всякакъв мащаб — за гена PMS2 — синдрома на Линч и други заболявания, както редки, така и често срещани. Ние подкрепяме групи във всяка страна, включително виртуални групи за защита на правата на пациентите.
Можем да ви предложим персонализирани отчети, групови отстъпки и пакети, съобразени с нуждите на вашите членове. Моля, свържете се с нас чрез формуляра и ще ви отговорим в рамките на два работни дни.
- Персонализирани геномни доклади за вашите членове
- Групови отстъпки и индивидуално съставени пакети
- Всяка държава — включително виртуални групи
- Обхванати редки и често срещани заболявания
Получих съобщението.
Ще се свържем с вас в рамките на 2 работни дни. За директна връзка: hello@dantelabs.com
Един тест.
Отговори за цял живот.
Един комплект, изпратен до вашия дом. Секвениране на целия ви геном съгласно клиничния стандарт, използван за диагностични решения. Над 200 доклада, готови за използване от лекари, които се изпращат във вашия Genome Manager в рамките на 6–8 седмици — постоянни и актуализирани в съответствие с научния напредък.
Изпраща се до 48 часа · Резултати след 6–8 седмици
