İçeriğe atla
HSA veya FSA fonlarınızı kullanın
Genomunuzu dizileyin (yeni sekmede açılır)

Gen

SRRM1

serine and arginine repetitive matrix 1

Özet

Sitogenetik konum
1p36.11
Koordinatlar
Kromozom 1: 24.643.302–24.673.281 (GRCh38)
Eksonlar
30 kb boyunca 17 ekson
Protein
904 amino asit
Diğer adları
SRM160, POP101, MGC39488
MANE Select transkripti
ENST00000323848.14NM_005839.4
Lokus türü
Protein kodlayan
  • Çok yüksek
  • Yüksek
  • Düşük
  • Çok düşük

Bu gen için derlenmiş ilgili raporlar

Hiçbir Genome Test raporu SRRM1 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.

SRRM1 geninin yapısı

  • Kodlayan dizi
  • Çevrilmeyen bölge
  • İntron
  • Transkripsiyon yönü
  • Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Kromozom 1, SRRM1 genin yerini gösteren köşeli parantezle. SRRM1 ve yakınındaki 8 gen, kromozom 1 üzerinde, 24.158.292 ile 25.158.291 arasında.Kromozom 11p36.11p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4424,2 Mb24,4 Mb24,6 Mb24,8 Mb25 MbIFNLR1: 24.154.168–24.187.959, geri iplikIFNLR1GRHL3: 24.199.558–24.364.482, ileri iplikGRHL3STPG1: 24.355.830–24.416.934, geri iplikSTPG1NIPAL3: 24.413.515–24.476.735, ileri iplikNIPAL3RCAN3: 24.502.320–24.541.040, ileri iplikRCAN3NCMAP: 24.556.061–24.609.328, ileri iplikNCMAPSRRM1: 24.643.302–24.673.281, ileri iplikSRRM1CLIC4: 24.745.342–24.844.324, ileri iplikCLIC4RUNX3: 24.899.511–24.965.121, geri iplikRUNX3SRRM1 şeması: kromozom 1 üzerinde ileri yönde 17 eksonEkson 1: 24.643.302–24.643.347, 46 bazEkson 2: 24.645.984–24.646.073, 90 bazEkson 3: 24.646.667–24.646.789, 123 bazEkson 4: 24.648.859–24.649.029, 171 bazEkson 5: 24.649.971–24.650.086, 116 bazEkson 6: 24.651.409–24.651.612, 204 bazEkson 7: 24.652.434–24.652.628, 195 bazEkson 8: 24.652.913–24.653.032, 120 bazEkson 9: 24.654.855–24.655.129, 275 bazEkson 10: 24.660.719–24.660.799, 81 bazEkson 11: 24.661.310–24.661.396, 87 bazEkson 12: 24.662.660–24.662.804, 145 bazEkson 13: 24.666.815–24.666.925, 111 bazEkson 14: 24.669.123–24.669.587, 465 bazEkson 15: 24.670.120–24.670.315, 196 bazEkson 16: 24.671.386–24.671.595, 210 bazEkson 17: 24.672.182–24.673.281, 1.100 baz1246810121416175′3′

Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.

Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).

Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.

Ekzonlar genin 30 kb uzunluğunun 3,7 kb'sini oluşturur; bu bazların 2.715 tanesi proteini kodlar.

SRRM1 dizilemesi

18Orta

Kısa okumalarla SRRM1 dizilemesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden

SRRM1 geninin ekzonlarından bazıları, kısa okumaların bir değişikliği kaçırabileceği veya yanlış yerleştirebileceği yerlerde bulunuyor.

Buna katkıda bulunan etken: SRRM1 geninin ekzonlarının her zorluk türündeki bölgelerde bulunan oranı

  • Eşlenebilirlik%22
  • Homoloji%28
  • Tekrarlar%12
  • GC içeriği%2,4
  • Referans kapsamı%0

Dante Labs'ın kendi araştırmasına dayanan bir Dante Labs puanı; NIST'in zor dizilenen bölgelere ilişkin Genome in a Bottle haritalarına dayanır.Puan nasıl hesaplanır

Dış bağlantılar

Bilgilerin kaynağı

  • HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
  • NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
  • NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.

Bu sayfayı alıntıla

APA

Dante Labs. (t.y.). SRRM1 geni: serine and arginine repetitive matrix 1. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/srrm1

Vancouver

Dante Labs. SRRM1 geni: serine and arginine repetitive matrix 1 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/srrm1

Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.

$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde

Genome Test'imi al