Gen
PCDHGA6
protocadherin gamma subfamily A, 6
- HGNC 8704↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000253731↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 56109↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 5q31
- Koordinatlar
- Kromozom 5: 141.373.891–141.512.975 (GRCh38)
- Eksonlar
- 139,1 kb boyunca 4 ekson
- Protein
- 932 amino asit
- Diğer adları
- PCDH-GAMMA-A6
- MANE Select transkripti
- ENST00000517434.3NM_018919.3
- Lokus türü
- Diğer
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pcdhga6.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePCDHGA6 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
Hiçbir Genome Test raporu PCDHGA6 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.
PCDHGA6 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 139,1 kb uzunluğunun 4,8 kb'sini oluşturur; bu bazların 2.799 tanesi proteini kodlar.
PCDHGA6 dizilemesi
4Düşük
100 üzerinden, PCDHGA6 genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, PCDHGA6 geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%7,1
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%1,4
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%13
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). PCDHGA6 geni: protocadherin gamma subfamily A, 6. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/pcdhga6
Dante Labs. PCDHGA6 geni: protocadherin gamma subfamily A, 6 [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/pcdhga6
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde