Gen
TNP1
transition protein 1
- HGNC 11951↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000118245↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 7141↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 2q35
- Koordinater
- Kromosom 2: 216 859 458–216 860 064 (GRCh38)
- Exoner
- 2 exoner på 0,6 kb
- Protein
- 55 aminosyror
- MANE Select-transkript
- ENST00000236979.2NM_003284.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tnp1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs TNP1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser TNP1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är TNP1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 0,4 kb av genens 0,6 kb, och 168 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av TNP1
0Låg
Hur svår TNP1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av TNP1s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.0 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). TNP1-genen: transition protein 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/tnp1
Dante Labs. TNP1-genen: transition protein 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/tnp1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor