Gen
TMEM11
transmembrane protein 11
- HGNC 16823↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000178307↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 8834↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 17p11.2
- Koordinater
- Kromosom 17: 21 197 954–21 214 161 (GRCh38)
- Exoner
- 2 exoner på 16,2 kb
- Protein
- 192 aminosyror
- Även känd som
- PMI, PM1
- Tidigare symboler
- C17orf35
- MANE Select-transkript
- ENST00000317635.6NM_003876.3
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tmem11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs TMEM11, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser TMEM11 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är TMEM11 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1 kb av genens 16,2 kb, och 579 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av TMEM11
1Lätt
Hur svår TMEM11 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i TMEM11 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som adderar: andelen av TMEM11:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 15 %.0 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 10 %.7,4 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av TMEM11:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). TMEM11-genen: transmembrane protein 11. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/tmem11
Dante Labs. TMEM11-genen: transmembrane protein 11 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/tmem11
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor