Gen
SDS
serine dehydratase
- HGNC 10691↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000135094↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 10993↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 12q24.13
- Koordinater
- Kromosom 12: 113 392 445–113 403 887 (GRCh38)
- Exoner
- 8 exoner på 11,4 kb
- Protein
- 328 aminosyror
- Även känd som
- SDH
- MANE Select-transkript
- ENST00000257549.9NM_006843.3
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sds.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SDS, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser SDS ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är SDS uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,6 kb av genens 11,4 kb, och 987 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SDS
1Låg
Hur svår SDS är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av SDSs exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.0 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.7,9 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SDS-genen: serine dehydratase. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/sds
Dante Labs. SDS-genen: serine dehydratase [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/sds
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor