Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

SCPPPQ1

secretory calcium-binding phosphoprotein proline-glutamine rich 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
4q22.1
Koordinater
Kromosom 4: 87 460 802–87 471 050 (GRCh38)
Exoner
10 exoner på 10,2 kb
Protein
79 aminosyror
MANE Select-transkript
ENST00000715253.1NM_001405228.1
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser SCPPPQ1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är SCPPPQ1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
Kromosom 4, med en parentes där SCPPPQ1 finns. SCPPPQ1 och 10 gener i närheten på kromosom 4, från 86 965 926 till 87 965 925.Kromosom 44q22.1p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.287 Mb87,2 Mb87,4 Mb87,6 Mb87,8 MbAFF1: 86 934 203–87 141 073, framåt-strängAFF1KLHL8: 87 159 883–87 240 729, bakåt-strängKLHL8HSD17B13: 87 301 953–87 322 948, bakåt-strängHSD17B13HSD17B11: 87 336 162–87 391 223, bakåt-strängHSD17B11NUDT9: 87 422 573–87 459 455, framåt-strängNUDT9SCPPPQ1: 87 460 802–87 471 050, bakåt-strängSCPPPQ1SPARCL1: 87 473 329–87 531 118, bakåt-strängSPARCL1DSPP: 87 608 529–87 616 873, framåt-strängDSPPDMP1: 87 650 278–87 664 361, framåt-strängDMP1IBSP: 87 799 546–87 813 329, framåt-strängIBSPMEPE: 87 821 398–87 846 814, framåt-strängMEPEDiagram över SCPPPQ1: 10 exoner på bakåt-strängen av kromosom 4Exon 10: 87 460 802–87 460 983, 182 baserExon 9: 87 461 967–87 462 004, 38 baserExon 8: 87 463 264–87 463 292, 29 baserExon 7: 87 463 414–87 463 443, 30 baserExon 6: 87 464 177–87 464 203, 27 baserExon 5: 87 467 809–87 467 886, 78 baserExon 4: 87 467 979–87 468 011, 33 baserExon 3: 87 469 592–87 469 662, 71 baserExon 2: 87 470 628–87 470 657, 30 baserExon 1: 87 471 017–87 471 050, 34 baser10864215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 0,6 kb av genens 10,2 kb, och 240 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av SCPPPQ1

0Lätt

Hur svår SCPPPQ1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i SCPPPQ1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som tillkommer: andelen av SCPPPQ1s exoner i varje typ av svår region

  • Kartläggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Delas med chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner0 %
  • GC-innehåll1,6 %

Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts det

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). SCPPPQ1-genen: secretory calcium-binding phosphoprotein proline-glutamine rich 1. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/scpppq1

Vancouver

Dante Labs. SCPPPQ1-genen: secretory calcium-binding phosphoprotein proline-glutamine rich 1 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/scpppq1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test